プラスチド形態と色素

植物細胞内には，すべてのタイプのプラスチドの起源であるプロプラスチド，暗所で生育した植物細胞に存在するエチオプラスト，光合成を行うクロロプラスト（葉緑体），カロテノイドを蓄積するクロモプラスト（有色体），油を蓄積するエライオプラストや，根や貯蔵組織細胞に存在し，澱粉粒を含むアミロプラストなどの無色のプラスチドの総称であるロイコプラスト（白色体）など様々なタイプのプラスチドが存在する．

トマト果実は細胞分裂をし，果実が肥大すると，果実細胞にあるクロロプラストは光合成機能が低下し，クロロプラスト内の扁平なチラコイドが層状になった内膜構造であるグラナラメラ構造が分解すると同時に，チラコイド膜に内包されている集光性タンパク質のクロロフィルも他の光合成に関係する膜タンパク質と共に分解される．しかし，光合成機能の低下よりも，集光性タンパク質による光エネルギーの受容機能の方が長く維持されるので，炭酸固定に使われない余剰エネルギーは細胞内に蓄積する．そのため，細胞内に蓄積した余剰エネルギーが活性酸素種のバーストを発生させ，プラストグロビュールの形成を促進して，クロモプラスト形成を刺激する．プラストグロビュールとフィブリルには，カロテノイドやその他の多数のプレニル脂質や中性脂質化合物が蓄積する．クロロプラストは丸いプラストグロビュールを持ち，光合成光反応などに関連しているが⁽¹⁾1) J. R. Austin II, E. Frost, P.-A. Vidi, F. Kessler & L. A. Staehelin: Plant Cell, 18, 1693 (2006).，クロモプラストではプラストグロビュールの組成にカロテノイドが占める割合が高くなり，その形態的特徴が変化し，細長い棒状になり，フィブリルと呼ばれるようになる⁽²⁾2) H. M. Berry, D. V. Rickett, C. J. Baxter, E. M. A. Enfissi & P. D. Fraser: J. Exp. Bot., 70, 2637 (2019).．クロモプラストへと分化し，そこでリコペン等のカロテノイドを合成，蓄積することで果実色が赤色に変化する⁽³⁾3) L. Li & H. Yuan: Arch. Biochem. Biophys., 539, 102 (2013).．トマト果実細胞では，クロロプラストからクロモプラストヘ分化するプラスチドが大半を占めるが，クロモプラストはプロプラスチド，ロイコプラスト，アミロプラストからも分化する．

‘マイクロトム’（Solanum lycopersicum cv．‘Micro-Tom’）は，‘フロリダ バスケット’と‘オハイオ 4013-3’の栽培品種を交配して観賞用に作出されたもので，非常に矮性で，成長も早く，果実は小さく，形質転換も容易であるため，実験によく用いられる（図1図1■黒トマト，白トマトと各成熟ステージの‘マイクロトム’）^{(4, 5)}4) E. Martí, C. Gisbert, G. J. Bishop, M. S. Dixon & J. L. García-Martínez: J. Exp. Bot., 57, 2037 (2006).5) K. Shirasawa & T. Ariizumi: Plant Biotechnol, (2024). doi: 10.5511/plantbiotechnology.24.0522a.．この‘マイクロトム’の開花後から成熟果実までの各果実から，透過型電子顕微鏡を用いて果実細胞内のプラスチドの観察を行った結果，‘マイクロトム’では開花30日後の緑色果実期においてクロロプラストのグラナラメラ構造が観察された（グラフィカルアブストラクト図）．また，開花32～35日後の黄色果実期，オレンジ色果実期ではグラナラメラ構造が分解され，カロテノイドが蓄積し発達したプラストグロビュール（緑の矢印）やフィブリル（赤い矢印）などが見られる．さらに，開花45日後の赤色に成熟した果実期では渦巻き状の膜構造が観察された．

図1■黒トマト，白トマトと各成熟ステージの‘マイクロトム’

果実が直径10 cm近い大玉系で，楕円形の白色トマトのプラスチドの形態は，‘マイクロトム’の黄色果実期に見られるような小さなチラコイドが観察される（図1, 2図1■黒トマト，白トマトと各成熟ステージの‘マイクロトム’図2■白トマト，黒トマトとオレンジトマトの原因タンパク質とクロモプラストの形状）．果実のヘタの周辺部分に広範囲にクロロフィルが残る黒トマトでは，‘マイクロトム’の緑色果実期のプラスチドに似たチラコイドのような構造とカロテノイドが結合したフィブリルが確認され，トマト果実のプラスチド構造には品種間で明確な違いが見られる（図2図2■白トマト，黒トマトとオレンジトマトの原因タンパク質とクロモプラストの形状）．白トマトはフィトエン合成酵素（PSY1）というカロテノイド生合成経路の律速酵素が壊れていて，カロテノイドが蓄積していない（図2, 3図2■白トマト，黒トマトとオレンジトマトの原因タンパク質とクロモプラストの形状図3■カロテノイド生合成経路）．また，黒トマトはSGR（Stay green protein）が壊れていて，クロロフィルの分解が遅く，カロテノイド含有量は‘マイクロトム’の成熟果実と比較して半分程度である⁽⁶⁾6) Z. Luo, J. Zhang, J. Li, C. Yang, T. Wang, B. Ouyang, H. Li, J. Giovannoni & Z. Ye: New Phytol., 198, 442 (2013).．トマトのSGR1は，PSY1と直接相互作用し，その活性を阻害し，リコピンの蓄積を調節する働きがある⁽⁷⁾7) C. S. Barry, R. P. McQuinn, M.-Y. Chung, A. Besuden & J. J. Giovannoni: Plant Physiol., 147, 179 (2008).．SGR1の1つのアミノ酸置換がトマトのgf（green-fresh）変異の原因であり，カロテノイドを豊富に含むクロモプラストとクロロフィルを含むクロロプラストの両方を持つ緑と赤が混ざった色の熟した果実が生じることが明らかになっている⁽⁸⁾8) M. Suzuki, S. Takahashi, T. Kondo, H. Dohra, Y. Ito, Y. Kiriiwa, M. Hayashi, S. Kamiya, M. Kato, M. Fujiwara et al.: PLoS One, 10, 0137266 (2015). doi: 10.1371/journal.pone.0137266.．実際にトマト果実では，クロロフィルはクロロプラストからクロモプラストへの分化の過程で維持され，内部膜構造も存続し，光合成が停止してプレニル脂質に富むプラストグロビュールが生じても，クロロフィルを含むチラコイドの残骸が残っている⁽⁹⁾9) L. Morelli, S. Torres-Montilla, G. Glauser, V. Shanmugabalaji, F. Kessler & M. Rodriguez-Concepcion: New Phytol., 237, 1696 (2023).．クロロフィルを含むチラコイドの残骸が残っていることで，集光性タンパク質が光合成反応に用いない光エネルギーを受け取り，活性酸素種を発生させる要因となる．

図2■白トマト，黒トマトとオレンジトマトの原因タンパク質とクロモプラストの形状

電子顕微鏡写真（日本女子大学　永田典子教授撮影）

図3■カロテノイド生合成経路

PSY1: フィトエン合成酵素1, PSY2: フィトエン合成酵素2，PDS: フィトエンディサチュレース，ZDS: ζ-カロテンディサチュレース，CRISO: カロテノイドイソメラーゼ，LcyE: リコペンδ-サイクラーゼ，LcyB: リコペンβ-サイクラーゼ，CycB: クロモプラスト特有リコペンβ-サイクラーゼ，CrtB: バクテリアのフィトエン合成酵素

ナショナルバイオリソースプロジェクト・トマト⁽¹⁰⁾10) S. Watanabe, T. Mizoguchi, K. Aoki, Y. Kubo, H. Mori, S. Imanishi, Y. Yamazaki, D. Shibata & H. Ezura: Plant Biotechnol., 24, 33 (2007).より分譲を受けたvivid orange変異体は，成熟しても果実がオレンジ色のままであるという特徴を持っている．vo変異体はCRTISO（カロテノイド合成経路のプロリコペンからリコペンを作る酵素であるカロテノイドイソメラーゼ）に変異があり（図3図3■カロテノイド生合成経路），成熟果実の細胞内のプラスチドは，野生型のオレンジ色果実と比較するとカロテノイドが蓄積するプラストグロビュールが多く観察され，野生型の赤色果実と比較すると渦巻状の構造はあまり発達せず，野生型で見られるような電子密度の高い紐状の構造はほとんど見られない（図2図2■白トマト，黒トマトとオレンジトマトの原因タンパク質とクロモプラストの形状）．また，通常，トマトの赤色の原因であるリコピンはトマトが成熟するにつれて蓄積するが，vo変異体はリコピンを蓄積せず，β-カロテン（オレンジ色）を蓄積している．他の研究グループからも果実がオレンジ色で，野生型で通常合成されるオールトランスリコピンの代わりにプロリコピンやζ-カロテンを蓄積するCRTISOに変異が入ったtangerine変異体が単離されているが，そのクロモプラストの形態は観察されていない⁽¹¹⁾11) T. Isaacson, G. Ronen, D. Zamir & J. Hirschberg: Plant Cell, 14, 333 (2002).．上記のように，カロテノイドやクロロフィルがクロモプラストの形態変化に影響を与えている．

さらに，クロロプラストからクロモプラストへの分化の鍵となるカロテノイドが発見された⁽¹²⁾12) B. Llorente, S. Torres-Montilla, L. Morelli, I. Florez-Sarasa, J. T. Matus, M. Ezquerro, L. D’Andrea, F. Houhou, E. Majer, B. Picó et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 117, 21796 (2020).．タバコの葉に細菌のPSY（フィトエン合成酵素）をコードするCrtB遺伝子を一過的に発現させると（図3図3■カロテノイド生合成経路），葉のクロロプラストにフィトエンが急激に蓄積し，クロロプラストからクロモプラストへの分化が誘導される⁽¹²⁾12) B. Llorente, S. Torres-Montilla, L. Morelli, I. Florez-Sarasa, J. T. Matus, M. Ezquerro, L. D’Andrea, F. Houhou, E. Majer, B. Picó et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 117, 21796 (2020).．クロロプラストのアイデンティティーの弱体化に伴なう光合成機能の低下は，クロモプラスト分化の第1段階である．第2段階は，PSYやその他のカロテノイド生合成酵素をコードする遺伝子の発現が促進され，カロテノイドの生産が促進されると，プラスチドから核へのコミュニケーションが再プログラムされ，プラスチドの微細構造が変化する．その結果としてクロモプラストの分化が起こり，カロテノイド生合成が促進され，カロテノイドの貯蔵も改善される．しかし，トマト（Solanum lycopersicum）にタバコと同様に細菌のCrtBカロテノイド生成遺伝子を過剰発現させた場合は，プラスチドに局在する脂質であるモノガラクトジアシルグリセロール（MGDG）とカロテノイドと膜状構造が同時に増加し，新しく形成されたカロテノイド，タンパク質，脂質が，プラスチドの細胞内構造内に隔離されている⁽¹³⁾13) M. Nogueira, L. Mora, E. M. Enfissi, P. M. Bramley & P. D. Fraser: Plant Cell, 25, 4560 (2013).．

このように同じナス科植物であっても種によって，カロテノイドとクロモプラスト形態分化には違いがある．

プラスチドプロテオームデータからのプラスチド分化因子探索

プラスチド分化と果実色および成熟の関係性を明らかにするために，トマト果実のプラスチドタンパク質のプロテオーム解析を行った⁽⁸⁾8) M. Suzuki, S. Takahashi, T. Kondo, H. Dohra, Y. Ito, Y. Kiriiwa, M. Hayashi, S. Kamiya, M. Kato, M. Fujiwara et al.: PLoS One, 10, 0137266 (2015). doi: 10.1371/journal.pone.0137266.．異なる果実色のトマトからNycodenz密度勾配遠心法によりプラスチドを単離し，単離プラスチドからプラスチドタンパク質を抽出し，2次元電気泳動により分離した結果，TIL（Temperature-induced Lipocalin，温度誘導性リポカリン）タンパク質の発現量や質量，等電点が異なっていた⁽⁸⁾8) M. Suzuki, S. Takahashi, T. Kondo, H. Dohra, Y. Ito, Y. Kiriiwa, M. Hayashi, S. Kamiya, M. Kato, M. Fujiwara et al.: PLoS One, 10, 0137266 (2015). doi: 10.1371/journal.pone.0137266.．また，白トマトと黒トマトにおいて，果実のプラスチドタンパク質を比較したところ，カロテノイド蓄積関連タンパク質であるCHRC（クロモプラスト特異的カロテノイド関連タンパク質）とPAP（プラスチド脂質関連タンパク質）／フィブリリンファミリーのタンパク質に類似した配列を持つHarpin binding protein 1のタンパク質量が，赤く熟した‘マイクロトム’の果実に比べて少ないことが確認された．これらのタンパク質は疎水性分子の輸送など，リポカリンタンパク質と同様な特性と機能を持っている⁽⁸⁾8) M. Suzuki, S. Takahashi, T. Kondo, H. Dohra, Y. Ito, Y. Kiriiwa, M. Hayashi, S. Kamiya, M. Kato, M. Fujiwara et al.: PLoS One, 10, 0137266 (2015). doi: 10.1371/journal.pone.0137266.．フィブリリンタンパク質は，タバコの葉に細菌のCrtB遺伝子を発現させると蓄積し，光化学系IIの反応中心タンパク質サブユニットのD1（PsbA）が減少した報告があり，クロモプラスト分化に関係している⁽¹²⁾12) B. Llorente, S. Torres-Montilla, L. Morelli, I. Florez-Sarasa, J. T. Matus, M. Ezquerro, L. D’Andrea, F. Houhou, E. Majer, B. Picó et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 117, 21796 (2020).．

ピーマン（Capsicum annuum）果実細胞のクロロプラストからクロモプラストへ分化過程のプロテオームデータからは，光化学系IとIIを構成するタンパク質が分解されされる一方で，シトクロムb6f複合体，ATPase複合体やカルビン・ベンソン回路酵素は，完全に成熟した果実細胞のクロモプラストまで高いレベルで維持される⁽¹⁴⁾14) A. Rödiger, B. Agne, D. Dobritzsch, S. Helm, F. Muller, N. Potzsch & S. Baginsky: Plant J., 105, 1431 (2021).．また，フェレドキシン（Fd）およびFd依存性NADP還元酵素も同様に，完全に成熟した果実細胞のクロモプラストまで高い発現レベルで維持され，トマトとは異なりピーマンのクロモプラストの酸化還元代謝においてフェレドキシンが中心的な役割を保持していることを示唆している．ピーマンのカロテノイドは膜に隔離されているため，カロテノイドを収容する膜の生合成が活発になり，脂肪酸生合成に関与するAccD（プラスチドゲノムコードのアセチルCoAカルボキシラーゼサブユニット）は，クロモプラスト分化過程で発現量が増加する．さらに，フィトエン不飽和化酵素（PDS）レベルが大幅に増加する⁽¹⁴⁾14) A. Rödiger, B. Agne, D. Dobritzsch, S. Helm, F. Muller, N. Potzsch & S. Baginsky: Plant J., 105, 1431 (2021).．これらの結果より，トマト，タバコ同様にピーマンもフィトエンがクロモプラスト分化の鍵であると考えられる．

リポカリンタンパク質とクロモプラスト分化

リポカリン（Lipocalin）は細菌，動物，植物に広く見られ，疎水性小分子を結合することができるタンパク質ファミリーである（図4図4■リポカリンの機能）．リポカリンの結晶構造は高度に保存されており，内部のリガンド結合部位を囲む，8本鎖の逆平行βシートが水素結合したβバレルを含んでいる⁽¹⁵⁾15) D. R. Flower: Biochem. J., 318, 1 (1996).．大腸菌のリポカリンBlcは，飢餓や高浸透圧などの細胞ストレス応答に関与していることが示唆され，分子内ジスルフィド結合を持たないことが他のリポカリンタンパク質と異なる点である．Blcは膜の生合成や修復を担っており，他にも抗生物質耐性遺伝子の伝播や免疫の活性化に関与していることが示唆されている⁽¹⁶⁾16) R. E. Bishop: B. B.A., 1482, 73 (2000).．最近のゲノム解読の結果から，少なくとも20種類の細菌性リポカリンが存在することが明らかになっている．