解説

植物由来の核酸結合モジュール，PPRタンパク質を利用したDNA/RNA編集技術の開発
新たなDNA/RNA制御技術基盤の確立に向けて

Vol.59 No.3 Page. 113 - 121 (published date : 2021年3月1日)
田村 泰造1, 中村 崇裕1
  1. 九州大学農学研究院
vol59_3

 

概要原稿

植物に豊富なPPRタンパク質を核酸結合モジュールとして利用することで，所望のDNA/RNAのさまざまな核酸代謝活性を制御する技術が確立されつつある．本稿ではPPRを利用した新たなDNA/RNA制御技術基盤の構築に向けた取り組みについて紹介する．

リファレンス

  1. 1) K. Nishida, T. Arazoe, N. Yachie, S. Banno, M. Kakimoto, M. Tabata, M. Mochizuki, A. Miyabi, M. Araki, K. Y. Hara et al.: Science, 102, 553 (2016).
  2. 2) A. C. Komor, Y. B. Kim, M. S. Packer, J. A. Zuris & D. R. Liu: Nature, 61, 5985 (2016).
  3. 3) A. V. Anzalone, P. B. Randolph, J. R. Davis, A. A. Sousa, L. W. Koblan, J. M. Levy, P. J. Chen, C. Wilson, G. A. Newby, A. Raguram et al.: Nature, 576, 149 (2019).
  4. 4) I. D. Small & N. Peeters: Trends Biochem. Sci., 25, 46 (2000).
  5. 5) C. Lurin, C. Andres, S. Aubourg, M. Bellaoui, F. Bitton, C. Bruyere, M. Caboche, C. Debast, J. Gualberto, B. Hoffmann et al.: Plant Cell, 16, 2089 (2004).
  6. 6) A. Barkan & I. D. Small: Annu. Rev. Plant Biol., 65, 415 (2014).
  7. 7) T. Nakamura, Y. Yagi & K. Kobayashi: Plant Cell Physiol., 53, 1171 (2012).
  8. 8) S. Cheng, B. Gutman, X. Zhong, Y. Ye, M. F. Fisher, F. Bai, I. Castleden, Y. Song, B. Song, J. Huang et al.: Plant J., 85, 532 (2016).
  9. 9) P. Yin, Q. Li, C. Yan, Y. Liu, J. Liu, F. Yu, Z. Wang, J. Long, J. He, H. W. Wang et al.: Nature, 504, 168 (2013).
  10. 10) A. Barkan, M. Rojas, S. Fujii, A. Yap, Y. S. Chong, C. S. Bond & I. D. Small: PLOS Genet., 8, e1002910 (2012).
  11. 11) Y. Yagi, S. Hayashi, K. Kobayashi, T. Hirayama & T. Nakamura: PLOS ONE, 8, e57286 (2013).
  12. 12) H. Spahr, T. Chia, J. P. Lingford, S. J. Siira, S. B. Cohen, A. Filipovska & O. Rackham: Nat. Commun., 9, 2212 (2018).
  13. 13) M. Rojas, Q. Yu, R. Wiliams-Carrier, P. Maliga & A. Barkan: Nat. Plants, 5, 505 (2019).
  14. 14) J. Prikryl, M. Rojas, G. Schuster & A. Barkan: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 415 (2011).
  15. 15) B. Oldenkott, Y. Yang, E. Lesch, V. Knoop & M. Schallenberg-Rudinger: Commun. Biol., 2, 1 (2019).
  16. 16) M. L. Hayes & M. L. Santibanez: J. Biol. Chem., 295, 3497 (2020).
  17. 17) T. Kobayashi, Y. Yagi & T. Nakamura: Methods Mol. Biol., 1469, 147 (2016).
  18. 18) J. J. McDermott, K. P. Watkins, R. Williams-Carrieer & A. Barkan: Plant Cell, 31, 1723 (2019).
  19. 19) J. P. Guilinger, D. B. Thompson & D. R. Liu: Nat. Biotechnol., 32, 577 (2014).
  20. 20) Z. Hou, Y. Zhang, N. E. Propson, S. E. Howden, L. F. Chu, E. J. Sontheimer & J. A. Thomson: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 110, 15644 (2013).
  21. 21) S. Zucchelli, D. Cotella, H. Takahashi, C. Carrieri, L. Cimatti, F. Fasolo, M. H. Jones, D. Sblattero, R. Sanges, C. Santano et al.: RNA Biol., 12, 771 (2015).
  22. 22) Y. Yao, S. Jin, H. Long, Y. Yu, Z. Zhang, G. Cheng, C. Xu, Y. Ding, Q. Guan, N. Li et al.: Nucleic Acids Res., 43, e58 (2018).
  23. 23) S. Rauch, C. He & B. C. Dickinson: J. Am. Chem. Soc., 140, 11974 (2018).
  24. 24) J. Cao, M. Arha, C. Sudrik, L. J. Bugaj, D. V. Schaffer & R. S. Kane: Chem. Commun. (Camb.), 49, 8338 (2013).
  25. 25) J. Cao, M. Arha, C. Sudrik, D. V. Schaffer & R. S. Kane: Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 53, 4900 (2014).
  26. 26) E. D. Gregorio, T. Preiss & M. W. Hentze: EMBO J., 18, 4865 (1999).
  27. 27) M. Wang, L. Oge, M. D. Perez-Garcia, L. Hamama & S. Sakr: Int. J. Mol. Sci., 19, 19 (2018).
  28. 28) Z. T. Campbell, C. T. Valley & M. Wickens: Nat. Struct. Mol. Biol., 21, 732 (2014).
  29. 29) Y. Wang, C. G. Cheong, T. M. Tanaka-Hall & Z. Wang: Nat. Methods, 6, 825 (2009).
  30. 30) T. Ozawa, Y. Natori, M. Sato & Y. Umezawa: Nat. Methods, 4, 413 (2007).
  31. 31) A. Cooke, A. Prigge, L. Opperman & M. Wickens: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 15870 (2011).
  32. 32) A. Radhakrishnan, Y. H. Chen, S. Martin, N. Alhusaini, R. Green & J. Coller: Cell, 167, 122 (2016).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。