生物コーナー

SNPを利用した水圏生物の遺伝的集団構造の解析
SNP解析により微細な遺伝的集団構造の差異が明らかに

Vol.60 No.8 Page. 431 - 437 (published date : 2022年8月1日)
五十嵐 洋治1
  1. 三重大学大学院生物資源学研究科
vol60_8

 

概要原稿

次世代シーケンシング技術の発展により，現在では多様な生物を対象にSNPマーカーに基づく集団構造解析が可能な状況である．本稿では，これまでに我々が行ったSNPを利用した水圏生物の遺伝的集団構造解析の一部を紹介したい．

リファレンス

  1. 1) K. Tsukamoto, S. Chow, T. Otake, H. Kurogi, N. Mochioka, M. J. Miller, J. Aoyama, S. Kimura, S. Watanabe, T. Yoshinaga et al.: Nat. Commun., 2, 179 (2011).
  2. 2) M. C. Tseng, W. N. Tzeng & S. Lee: Mar. Ecol. Prog. Ser., 308, 221 (2006).
  3. 3) Y. S. Han, C. L. Hung, Y. F. Liao & W. N. Tzeng: Mar. Ecol. Prog. Ser., 401, 221 (2010).
  4. 4) Y. Minegishi, C. V. Henkel, R. P. Dirks & G. E. E. J. M. van den Thillart: Mar. Biotechnol., 14, 583 (2012).
  5. 5) Y. Igarashi, H. Zhang, E. Tan, M. Sekino, K. Yoshitake, S. Kinoshita, S. Mitsuyama, T. Yoshinaga, S. Chow, H. Kurogi et al.: Genes, 9, 474 (2018).
  6. 6) M. S. Hossain, S. M. Sharifuzzaman, S. R. Chowdhury & S. Sarker: Fish. Manag. Ecol., 23, 450 (2016).
  7. 7) S. Dutta, I. Al-Abri & S. Paul: Mar. Policy, 128, 104483 (2021).
  8. 8) M. Asaduzzaman, M. A. Wahab, M. J. Rahman, M. Nahiduzzzaman, M. W. Dickson, Y. Igarashi, S. Asakawa & L. L. Wong: Sci. Rep., 9, 16050 (2019).
  9. 9) M. Asaduzzaman, Y. Igarashi, M. A. Wahab, M. Nahiduzzzaman, M. J. Rahman, M. J. Phillips, S. Huang, S. Asakawa, M. M. Rahman & L. L. Wong: Genes, 11, 46 (2020).
  10. 10) 農林水産省：農林水産物輸出入統計／貿易統計（輸入），https://www.e-stat.go.jp/stat-search/files?page=1&layout=datalist&toukei=00500100&tstat=000001018079&cycle=7&year=20200&month=0&tclass1=000001018080, 2020.
  11. 11) FAO: Improving Penaeus monodon hatchery practices. Manual based on experience in India.: FAO Fish. Tech. Pap., 2007.
  12. 12) L. L. Wong, Z. M. Deris, Y. Igarashi, S. Huang, S. Asakawa, Q. Ayub, S. Y. Lim, M. Ikhwanuddin, S. Iehata, K. Okamoto et al.: Biology, 9, 277 (2020).
  13. 13) X. Huang, Q. Feng, Q. Qian, Q. Zhao, L. Wang, A. Wang, J. Guan, D. Fan, Q. Weng, T. Huang et al.: Genome Res., 19, 1068 (2009).
  14. 14) K. Gacek, P. Bayer, I. Bartkowiak-Broda, L. Szala, J. Bocianowski, D. Edwards & J. Batley: Front. Plant Sci., 7, 2062 (2017).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。