解説

ATP-graspリガーゼによって生産される環状ペプチド
多様な構造を生み出す生合成システム

Vol.60 No.10 Page. 518 - 526 (published date : 2022年10月1日)
小谷 真也1
  1. 静岡大学学術院農学領域
vol60_10

 

概要原稿

バクテリアの生合成においてATP-graspリガーゼによって修飾を受け環化されるペプチドの一群がある．近年のゲノムマイニングによって多様な生合成遺伝子クラスターの存在が示唆されている．筆者の研究成果を交えながら最近の知見を紹介する．

リファレンス

  1. 1) H. Lee, M. Choi, J. U. Park, H. Roh & S. Kim: J. Am. Chem. Soc., 142, 3013 (2020).
  2. 2) M. Montalban-Lopez, T. A. Scott, S. Ramesh, I. R. Rahman, A. J. van Heel, J. H. Viel, V. Bandarian, E. Dittmann, O. Genilloud, Y. Goto et al.: Nat. Prod. Rep., 38, 130 (2021).
  3. 3) C. Imada, S. Hara, M. Maeda & U. Simidu: Nippon Suisan Gakkaishi, 52, 1455 (1986).
  4. 4) C. Imada, M. Maeda, S. Hara, N. Taga & U. Simidu: J. Appl. Bacteriol., 60, 469 (1986).
  5. 5) M. Taichi, T. Yamazaki, T. Kimura & Y. Nishiuchi: Tetrahedron Lett., 50, 2377 (2009).
  6. 6) M. Taichi, T. Yamazaki, K. Kawahara, D. Motooka, S. Nakamura, S. Harada, T. Teshima, T. Ohkubo, Y. Kobayashi & Y. Nishiuchi: J. Pept. Sci., 16, 329 (2010).
  7. 7) K. Miyamoto, H. Tsujibo, Y. Hikita, K. Tanaka, S. Miyamoto, M. Hishimoto, C. Imada, K. Kamei, S. Hara & Y. Inamori: Biosci. Biotechnol. Biochem., 62, 2446 (1998).
  8. 8) K. Unno, H. Nakagawa & S. Kodani: Biosci. Biotechnol. Biochem., 85, 97 (2021).
  9. 9) M. O. Ishitsuka, T. Kusumi, H. Kakisawa, K. Kaya & M. M. Watanabe: J. Am. Chem. Soc., 112, 8180 (1990).
  10. 10) T. Okino, H. Matsuda, M. Murakami & K. Yamaguchi: Tetrahedron, 51, 10679 (1995).
  11. 11) H. J. Shin, M. Murakami, H. Matsuda & K. Yamaguchi: Tetrahedron, 52, 8159 (1996).
  12. 12) M. Murakami, Q. Sun, K. Ishida, H. Matsuda, T. Okino & K. Yamaguchi: Phytochemistry, 45, 1197 (1997).
  13. 13) T. Rohrlack, K. Christoffersen, P. E. Hansen, W. Zhang, O. Czarnecki, M. Henning, J. Fastner, M. Erhard, B. A. Neilan & M. Kaebernick: J. Chem. Ecol., 29, 1757 (2003).
  14. 14) V. Reshef & S. Carmeli: Tetrahedron, 62, 7361 (2006).
  15. 15) K. Fujii, K. Sivonen, E. Naganawa & K.-i. Harada: Tetrahedron, 56, 725 (2000).
  16. 16) N. Ziemert, K. Ishida, A. Liaimer, C. Hertweck & E. Dittmann: Angew. Chem. Int. Ed., 47, 7756 (2008).
  17. 17) B. Philmus, G. Christiansen, W. Y. Yoshida & T. K. Hemscheidt: ChemBioChem, 9, 3066 (2008).
  18. 18) T. K. Hemscheidt: Methods Enzymol., 516, 25 (2012).
  19. 19) K. Li, H. L. Condurso, G. Li, Y. Ding & S. D. Bruner: Nat. Chem. Biol., 12, 973 (2016).
  20. 20) A. R. Weiz, K. Ishida, K. Makower, N. Ziemert, C. Hertweck & E. Dittmann: Chem. Biol., 18, 1413 (2011).
  21. 21) N. Ziemert, K. Ishida, A. Weiz, C. Hertweck & E. Dittmann: Appl. Environ. Microbiol., 76, 3568 (2010).
  22. 22) Y. Zhang, K. Li, G. Yang, J. L. McBride, S. D. Bruner & Y. Ding: Nat. Commun., 9, 1780 (2018).
  23. 23) M. N. Ahmed, E. Reyna-Gonzalez, B. Schmid, V. Wiebach, R. D. Sussmuth, E. Dittmann & D. P. Fewer: ACS Chem. Biol., 12, 1538 (2017).
  24. 24) E. Reyna-Gonzalez, B. Schmid, D. Petras, R. D. Sussmuth & E. Dittmann: Angew. Chem. Int. Ed., 55, 9398 (2016).
  25. 25) D. Gatte-Picchi, A. Weiz, K. Ishida, C. Hertweck & E. Dittmann: Appl. Environ. Microbiol., 80, 1380 (2014).
  26. 26) T. Rohrlack, K. Christoffersen, M. Kaebernick & B. A. Neilan: Appl. Environ. Microbiol., 70, 5047 (2004).
  27. 27) K. Unno, I. Kaweewan, H. Nakagawa & S. Kodani: Appl. Microbiol. Biotechnol., 104, 5293 (2020).
  28. 28) A. R. Weiz, K. Ishida, F. Quitterer, S. Meyer, J. C. Kehr, K. M. Muller, M. Groll, C. Hertweck & E. Dittmann: Angew. Chem. Int. Ed., 53, 3735 (2014).
  29. 29) S. Ramesh, X. Guo, A. J. DiCaprio, A. M. De Lio, L. A. Harris, B. L. Kille, T. V. Pogorelov & D. A. Mitchell: ACS Chem. Biol., 16, 2787 (2021).
  30. 30) C. Lee, H. Lee, J. U. Park & S. Kim: Biochemistry, 59, 285 (2020).
  31. 31) H. Roh, Y. Han, H. Lee & S. Kim: ChemBioChem, 20, 1051 (2019).
  32. 32) I. Kaweewan, H. Nakagawa & S. Kodani: Appl. Microbiol. Biotechnol., 105, 7241 (2021).
  33. 33) K. Unno & S. Kodani: Microbiol. Res., 244, 126669 (2021).
  34. 34) I. Song, Y. Kim, J. Yu, S. Y. Go, H. G. Lee, W. J. Song & S. Kim: Nat. Chem. Biol., 17, 1123 (2021).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。