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ゲノムデータの分子系統解析への応用と今後の展望
ゲノムデータから分子生物・進化学研究の羅針盤を作る！

Vol.61 No.6 Page. 257 - 259 (published date : 2023年6月1日)
堀池 徳祐1, 渡邊 知輝2
  1. 静岡大学農学部
  2. 岐阜大学大学院連合農学研究科
vol61_6

 

概要原稿

系統解析は形質比較や分子比較を経て，ゲノム全体を比較する手法に進歩してきた．本稿ではその背景，ゲノム情報を用いたオーソログデータセットの作成法とその利用法，将来への展望について概説する．

リファレンス

  1. 1) E. V. Koonin: Annu. Rev. Genet., 39, 309 (2005).
  2. 2) D. M. Emms & S. Kelly: Genome Biol., 20, 238 (2019).
  3. 3) A. M. Altenhoff, J. Levy, M. Zarowiecki, B. Tomiczek, A. W. Vesztrocy, D. A. Dalquen, S. Muller, M. J. Telford, N. M. Glover, D. Dylus et al.: Genome Res., 29, 1152 (2019).
  4. 4) D. M. Kristensen, Y. I. Wolf, A. R. Mushegian & E. V. Koonin: Brief. Bioinform., 12, 379 (2011).
  5. 5) T. Horiike, R. Minai, D. Miyata, Y. Nakamura & Y. Tateno: Genome Biol. Evol., 8, 446 (2016).
  6. 6) T. Watanabe, A. Kure & T. Horiike: Genome Biol. Evol., 15, evad026 (2023).
  7. 7) C. Zhang, R. Maryam, S. Erfan & M. Siavash: BMC Bioinformatics, 19, 153 (2018).


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