今日の話題

ゲノムやエピゲノムの変化による生物の進化
ゲノムか，エピゲノムか，その両方か

Vol.61 No.9 Page. 404 - 407 (published date : 2023年9月1日)
一柳 健司1
  1. 名古屋大学大学院生命農学研究科動物科学専攻ゲノム・エピゲノムダイナミクス研究室
vol61_9

 

概要原稿

近縁種間の表現型の違いはアミノ酸配列の違いよりも，遺伝子の発現量や発現パターンの違いによる．その差異はゲノム変化だけでなく，エピゲノム変化によっても生み出されうる．このような生物進化の仕組みについて最近の研究を紹介する．

リファレンス

  1. 1) M. T. Maurano, R. Humbert, E. Rynes, R. E. Thurman, E. Haugen, H. Wang, A. P. Reynolds, R. Sandstrom, H. Qu, J. Brody et al.: Science, 337, 1190 (2012).
  2. 2) K. K. Farh, A. Marson, J. Zhu, M. Kleinewietfeld, W. J. Housley, S. Beik, N. Shoresh, H. Whitton, R. J. Ryan, A. A. Shishkin et al.: Nature, 518, 337 (2015).
  3. 3) J. Nasser, D. T. Bergman, C. P. Fulco, P. Guckelberger, B. R. Doughty, T. A. Patwardhan, T. R. Jones, T. H. Nguyen, J. C. Ulirsch, F. Lekschas et al.: Nature, 593, 238 (2021).
  4. 4) M. C. King & A. C. Wilson: Science, 188, 107 (1975).
  5. 5) S. B. Carroll: PLoS Biol., 3, e245 (2005).
  6. 6) W. Enard, M. Przeworski, S. E. Fisher, C. S. Lai, V. Wiebe, T. Kitano, A. P. Monaco & S. Paabo: Nature, 418, 869 (2002).
  7. 7) M. Kimura: Nature, 217, 624 (1968).
  8. 8) M. D. Shapiro, M. E. Marks, C. L. Peichel, B. K. Blackman, K. S. Nereng, B. Jonsson, D. Schluter & D. M. Kingsley: Nature, 428, 717 (2004).
  9. 9) C. D. Allis, M. L. Caparros, T. Jenuwein & D. Reinberg: “Overview and Concepts” in Epigenetics 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2015.
  10. 10) J. van Dongen, S. D. Gordon, A. F. McRae, V. V. Odintsova, H. Mbarek, C. E. Breeze, K. Sugden, S. Lundgren, J. E. Castillo-Fernandez, E. Hannon et al.: Nat. Commun., 12, 5618 (2021).
  11. 11) A. A. Pai, J. T. Bell, J. C. Marioni, J. K. Pritchard & Y. Gilad: PLoS Genet., 7, e1001316 (2011).
  12. 12) K. Fukuda, Y. Inoguchi, K. Ichiyanagi, T. Ichiyanagi, Y. Go, M. Nagano, Y. Yanagawa, N. Takaesu, Y. Ohkawa, H. Imai et al.: Hum. Mol. Genet., 26, 3508 (2017).
  13. 13) E. E. Guevara, W. D. Hopkins, P. R. Hof, J. J. Ely, B. J. Bradley & C. C. Sherwood: PLoS Genet., 17, e1009506 (2021).
  14. 14) H. Jeong, I. Mendizabal, S. Berto, P. Chatterjee, T. Layman, N. Usui, K. Toriumi, C. Douglas, D. Singh, I. Huh et al.: Nat. Commun., 12, 2021 (2021).
  15. 15) S. L. Prescott, R. Srinivasan, M. C. Marchetto, I. Grishina, I. Narvaiza, L. Selleri, F. H. Gage, T. Swigut & J. Wysocka: Cell, 163, 68 (2015).
  16. 16) R. M. Agoglia, D. Sun, F. Birey, S. J. Yoon, Y. Miura, K. Sabatini, S. P. Pasca & H. B. Fraser: Nature, 592, 421 (2021).
  17. 17) D. Gokhman, R. M. Agoglia, M. Kinnebrew, W. Gordon, D. Sun, V. K. Bajpai, S. Naqvi, C. Chen, A. Chan, C. Chen et al.: Nat. Genet., 53, 467 (2021).
  18. 18) M. Hirata, T. Ichiyanagi, H. Katoh, T. Hashimoto, H. Suzuki, H. Nitta, M. Kawase, R. Nakai, M. Imamura & K. Ichiyanagi: Mol. Biol. Evol., 39, msac208 (2022).
  19. 19) T. Ichiyanagi, H. Katoh, Y. Mori, K. Hirafuku, B. A. Boyboy, M. Kawase & K. Ichiyanagi: Mol. Biol. Evol., 38, 2380 (2021).
  20. 20) O. Pos, J. Radvanszky, G. Buglyo, Z. Pos, D. Rusnakova, B. Nagy & T. Szemes: Biomed. J., 44, 548 (2021).
  21. 21) A. Boskovic & O. J. Rando: Annu. Rev. Genet., 52, 21 (2018).
  22. 22) M. H. Fitz-James & G. Cavalli: Nat. Rev. Genet., 23, 325 (2022).
  23. 23) A. V. Gore, K. A. Tomins, J. Iben, L. Ma, D. Castranova, A. E. Davis, A. Parkhurst, W. R. Jeffery & B. M. Weinstein: Nat. Ecol. Evol., 2, 1155 (2018).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。