解説

バイオインフォマティックスによるバイオマーカーおよび機能性天然物の解析
バイオインフォマティックス活用

Vol.61 No.9 Page. 410 - 418 (published date : 2023年9月1日)
周 英鈺1
  1. ハルビン工業大学・医学部
vol61_9

 

概要原稿

肥満による慢性炎症と結腸直腸がんの治療に関する天然物開発へのバイオインフォマティクスの2応用例を紹介した．ビッグデータの利用が，がん等の疾患に関わるバイオマーカーと，それを標的とした天然物の探索において有用であることを示唆している．

リファレンス

  1. 1) L. Li, Q. Lei, S. Zhang, L. Kong & B. Qin: Oncol. Rep., 38, 2607 (2017).
  2. 2) W. Lou, J. Chen, B. Ding, D. Chen, H. Zheng, D. Jiang, L. Xu, C. Bao, G. Cao & W. Fan: J. Transl. Med., 16, 266 (2018).
  3. 3) E. Lopez-Lopez, J. Bajorath & J. L. Medina-Franco: J. Chem. Inf. Model., 61, 26 (2021).
  4. 4) W. Zhou, X. Li, L. Han & S. Fan: “Network Pharmacology.,” pp. 35-73, Springer, 2021.
  5. 5) C. Liu, R. Liu, H. Fan, X. Xiao, X. Chen, H. Xu, & Y. Lin: Chin. Herb. Med., 7, 3 (2015).
  6. 6) Y. Zhou, T. Takano, X. Li, Y. Wang, R. Wang, Z. Zhu, M. Tanokura, T. Miyakawa & S. Hachimura: Commun. Biol., 5, 519 (2022).
  7. 7) A. R. Saltiel & J. M. Olefsky: J. Clin. Invest., 127, 1 (2017).
  8. 8) A. B. Goldfine & S. E. Shoelson: J. Clin. Invest., 127, 83 (2017).
  9. 9) C. Crewe, Y. A. An & P. E. Scherer: J. Clin. Invest., 127, 74 (2017).
  10. 10) M. Zeyda & T. M. Stulnig: Gerontology, 55, 379 (2009).
  11. 11) J. Hirosumi, G. Tuncman, L. Chang, C. Z. Gorgun, K. T. Uysal, K. Maeda, M. Karin & G. S. Hotamisligil: Nature, 420, 333 (2002).
  12. 12) B. Zhai, N. Zhang, X. Han, Q. Li, M. Zhang, X. Chen, G. Li, R. Zhang, P. Chen, W. Wang et al.: Biomed. Pharmacother., 114, 108812 (2019).
  13. 13) E. Y. Kwon, S.-K. Shin, Y.-Y. Cho, U.-J. Jung, E. Kim, T. Park, J. H. Y. Park, J. W. Yun, R. A. McGregor, Y. B. Park et al.: BMC Genomics, 13, 1 (2012).
  14. 14) A. Cobos-Correa, J. B. Trojanek, S. Diemer, M. A. Mall & C. Schultz: Nat. Chem. Biol., 5, 628 (2009).
  15. 15) D. G. Morris, X. Huang, N. Kaminski, Y. Wang, S. D. Shapiro, G. Dolganov, A. Glick & D. Sheppard: Nature, 422, 169 (2003).
  16. 16) X. Wang, Y. Shen, S. Wang, S. Li, W. Zhang, X. Liu, L. Lai, J. Pei & H. Li: Nucleic Acids Res., 45, W1 (2017).
  17. 17) M. J. Khandekar, P. Cohen & B. M. Spiegelman: Nat. Rev. Cancer, 11, 886 (2011).
  18. 18) Y. Pacheco, C. X. Lim, T. Weichhart, D. Valeyre, A. Bentaher & A. Calender: Trends Immunol., 41, 286 (2020).
  19. 19) J. S. Liu, S. C. He, Z. L. Zhang, R. Chen, L. Fan, G. L. Qiu, S. Chang, L. Li & X. M. Che: Oncol. Rep., 32, 2635 (2014).
  20. 20) C. Pan,Y. Si, Q. Meng, L. Jing, L. Chen, Y. Zhang & H. Bao: Front. Neurosci., 13, 1 (2019).
  21. 21) A. P. Wheeler, C. M. Wells, S. D. Smith, F. M. Vega, R. B. Henderson, V. L. Tybulewicz & A. J. Ridley: J. Cell Sci., 119, 2749 (2006).
  22. 22) Y. Zhou, X. Li, Y. Morita, S. Hachimura, T. Miyakawa, S. Takahashi & M. Tanokura: Front. Oncol., 11, 705939 (2021).
  23. 23) K. Van Der Jeught, H. C. Xu, Y. J. Li, X. Bin Lu & G. Ji: World J. Gastroenterol., 24, 3834 (2018).
  24. 24) N. N. Keum & E. Giovannucci: Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol., 16, 713 (2019).
  25. 25) R. Demisse, N. Damle, E. Kim, J. Gong, M. Fakih, C. Eng, L. Oesterich, M. McKenny, J. Ji, J. Liu et al.: JNCCN J. Natl. Compr. Cancer Netw., 18, 798 (2020).
  26. 26) T. Barrett, S. E. Wilhite, P. Ledoux, C. Evangelista, I. F. Kim, M. Tomashevsky, K. A. Marshall, K. H. Phillippy, P. M. Sherman, M. Holko et al.: Nucleic Acids Res., 41, D991 (2013).
  27. 27) D. Schaller, D. Sribar, T. Noonan, L. Deng, T. N. Nguyen, S. Pach, D. Machalz, M. Bermudez & G. Wolber: Wiley Interdiscip. Rev. Comput. Mol. Sci., 10, e1468 (2020).
  28. 28) A. D. Theocharis, I. Tsolakis, G. N. Tzanakakis & N. K. Karamanos: Adv. Pharmacol., 53, 281 (2006).
  29. 29) D. Uebelhart: Osteoarthritis Cartilage, 16, S19 (2008).
  30. 30) F. J. G. M. Kubben, A. Peeters-Haesevoets, L. G. Engels, C. G. Baeten, B. Schutte, J. W. Arends, R. W. Stockbrugger & G. H. Blijham: Gut, 35, 530 (1994).
  31. 31) Y. J. Ho, Y. M. Lin, Y. C. Huang, B. Shi, K. T. Yeh, Z. Gong & J. W. Lu: Res. Commun., 494, 173 (2017).
  32. 32) J. Ru, P. Li, J. Wang, W. Zhou, B. Li, C. Huang, P. Li, Z. Guo, W. Tao, Y. Yang et al.: J. Cheminform., 6, 13 (2014).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。