解説
オミクス解析に基づく生体鉱物形成関連タンパク質の同定
環境調和型の機能性材料合成法の開発を目指して
Vol.61 No.9 Page. 439 - 444 (published date : 2023年9月1日)
概要原稿
筆者はこれまで次世代シーケンサーを活用したオミクス解析を用いて非モデル生物である珪藻やヒザラガイからバイオミネラリゼーション関連タンパク質を同定してきた.
リファレンス
- 1) H. A. Lowenstam: Science, 211, 1126 (1981).
- 2) N. Kroger, R. Deutzmann & M. Sumper: Science, 286, 1129 (1999).
- 3) K. Shimizu, J. Cha, G. D. Stucky & D. E. Morse: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 6234 (1998).
- 4) A. Arakaki, J. Webb & T. Matsunaga: J. Biol. Chem., 278, 8745 (2003).
- 5) C. Du, G. Falini, S. Fermani, C. Abbott & J. Moradian-Oldak: Science, 307, 1450 (2005).
- 6) V. Sharma, A. Srinivasan, F. Nikolajeff & S. Kumar: Acta Biomater., 120, 20 (2021).
- 7) J. Moradian-Oldak & A. George: J. Dent. Res., 100, 1020 (2021).
- 8) P. G. Falkowski & J. A. Raven: “Aquatic Photosynthesis,” Princeton University Press, 2007.
- 9) M. Pancic , R. R. Torres, R. Almeda & T. Kiorboe: Proc. Biol. Sci., 286, 20190184 (2019).
- 10) T. Fuhrmann, S. Landwehr, M. El Rharbi-Kucki & M. Sumper: Appl. Phys. B, 78, 257 (2004).
- 11) N. Kroger, R. Deutzmann, C. Bergsdorf & M. Sumper: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 97, 14133 (2000).
- 12) N. Kroger, G. Lehmann, R. Rachel & M. Sumper: Eur. J. Biochem., 250, 99 (1997).
- 13) N. Poulsen & N. Kroger: J. Biol. Chem., 279, 42993 (2004).
- 14) A. Scheffel, N. Poulsen, S. Shian & N. Kroger: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 3175 (2011).
- 15) S. Wenzl, R. Hett, P. Richthammer & M. Sumper: Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 47, 1729 (2008).
- 16) A. K. Davis, M. Hildebrand & B. Palenik: J. Phycol., 41, 577 (2005).
- 17) B. Tesson, S. J. L. Lerch & M. Hildebrand: Sci. Rep., 7, 13457 (2017).
- 18) M. Nemoto, Y. Maeda, M. Muto, M. Tanaka, T. Yoshino, S. Mayama & T. Tanaka: Mar. Genomics, 16, 39 (2014).
- 19) A. Kotzsch, P. Groger, D. Pawolski, P. H. H. Bomans, N. A. J. M. Sommerdijk, M. Schlierf & N. Kroger: BMC Biol., 15, 65 (2017).
- 20) S. Gorlich, D. Pawolski, I. Zlotnikov & N. Kroger: Commun. Biol., 2, 245 (2019).
- 21) R. C. Trievel, B. M. Beach, L. M. A. Dirk, R. L. Houtz & J. H. Hurley: Cell, 111, 91 (2002).
- 22) M. Nemoto, S. Iwaki, H. Moriya, Y. Monden, T. Tamura, K. Inagaki, S. Mayama & K. Obuse: Mar. Biotechnol. (NY), 22, 551 (2020).
- 23) J. C. Weaver, Q. Wang, A. Miserez, A. Tantuccio, R. Stromberg, K. N. Bozhilov, P. Maxwell, R. Nay, S. T. Heier, E. DiMasi et al.: Mater. Today, 13, 42 (2010).
- 24) Q. Wang, M. Nemoto, D. Li, J. C. Weaver, B. Weden, J. Stegemeier, K. N. Bozhilov, L. R. Wood, G. W. Milliron, C. S. Kim et al.: Adv. Funct. Mater., 23, 2908 (2013).
- 25) T. Wang, W. Huang, C. H. Pham, S. Murata, S. Herrera, N. D. Kirchhofer, B. Arkook, D. Stekovic, M. E. Itkis, N. Goldman et al.: Small Struct., 3, 202100202 (2022).
- 26) M. Nemoto, D. Ren, S. Herrera, S. Pan, T. Tamura, K. Inagaki & D. Kisailus: Sci. Rep., 9, 856 (2019).
- 27) M. Nemoto, Q. Wang, D. Li, S. Pan, T. Matsunaga & D. Kisailus: Proteomics, 12, 2890 (2012).
- 28) M. Miyahara, M. Aoi, N. Inoue-Kashino, Y. Kashino & K. Ifuku: Biosci. Biotechnol. Biochem., 77, 874 (2013).
- 29) K. E. Apt, P. G. Kroth-Pancic & A. R. Grossman: Mol. Gen. Genet., 252, 572 (1996).
- 30) A. Hopes, V. Nekrasov, S. Kamoun & T. Mock: Plant Methods, 12, 49 (2016).
- 31) M. Suzuki, K. Saruwatari, T. Kogure, Y. Yamamoto, T. Nishimura, T. Kato & H. Nagasawa: Science, 325, 1388 (2009).
- 32) M. Abe & R. Kuroda: Development, 146, dev175976 (2019).
- 33) X. F. Chen, C. Wang, E. Baker & C. Sun: Sci. Rep., 5, dev175976 (2015).
- 34) Z. Bao, M. R. Weatherspoon, S. Shian, Y. Cai, P. D. Graham, S. M. Allan, G. Ahmad, M. B. Dickerson, B. C. Church, Z. Kang et al.: Nature, 446, 172 (2007).
本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。