解説

小胞体における酸化的フォールディング酵素の機能・構造相関解析
網羅的・俯瞰的解析から見える酵素の協働

Vol.63 No.4 Page. 166 - 173 (published date : 2025年4月1日)
奥田 綾1
  1. 京都大学複合原子力科学研究所
vol63_4

 

概要原稿

小胞体におけるジスルフィド結合を伴うタンパク質の立体構造形成，酸化的フォールディングは主にPDIファミリータンパク質によって担われている．PDIファミリータンパク質は複数種類存在するが，それらの作用機構については未解明の部分が多い．生化学的手法による機能の解析と小角散乱法による構造解析により見出された，PDIファミリーによる協働的なフォールディング反応の存在や機能に相関した構造の違いについて解説する．

リファレンス

  1. 1) F. U. Hartl, A. Bracher & M. Hayer-Hartl: Nature, 475, 324 (2011).
  2. 2) B. P. Tu & J. S. Weissman: J. Cell Biol., 164, 341 (2004).
  3. 3) F. Hatahet & L. W. Ruddock: Antioxid. Redox Signal., 11, 2807 (2009).
  4. 4) L. Ellgaard & L. W. Ruddock: EMBO Rep., 6, 28 (2005).
  5. 5) N. L. Houston, C. Fan, J. Q.-Y. Xiang, J.-M. Schulze, R. Jung & R. S. Boston: Plant Physiol., 137, 762 (2005).
  6. 6) C. S. Sevier & C. A. Kaiser: Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 3, 836 (2002).
  7. 7) B. Wilkinson & H. F. Gilbert: Biochim. Biophys. Acta. Proteins Proteom., 1699, 35 (2004).
  8. 8) H. Wadahama, S. Kamauchi, M. Ishimoto, T. Kawada & R. Urade: FEBS J., 274, 687 (2007).
  9. 9) S. Kamauchi, H. Wadahama, K. Iwasaki, Y. Nakamoto, K. Nishizawa, M. Ishimoto, T. Kawada & R. Urade: FEBS J., 275, 2644 (2008).
  10. 10) H. Wadahama, S. Kamauchi, Y. Nakamoto, K. Nishizawa, M. Ishimoto, T. Kawada & R. Urade: FEBS J., 275, 399 (2008).
  11. 11) K. Iwasaki, S. Kamauchi, H. Wadahama, M. Ishimoto, T. Kawada & R. Urade: FEBS J., 276, 4130 (2009).
  12. 12) A. Okuda, M. Matsusaki, T. Masuda & R. Urade: FEBS J., 284, 414 (2017).
  13. 13) A. Okuda, M. Matsusaki, T. Masuda, K. Morishima, N. Sato, R. Inoue, M. Sugiyama & R. Urade: J. Biochem., 168, 393 (2020).
  14. 14) M. Matsusaki, A. Okuda, K. Matsuo, K. Gekko, T. Masuda, Y. Naruo, A. Hirose, K. Kono, Y. Tsuchi & R. Urade: J. Biol. Chem., 294, 18820 (2019).
  15. 15) C. S. Sevier & C. A. Kaiser: Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Res., 1783, 549 (2008).
  16. 16) A. Cabibbo, M. Pagani, M. Fabbri, M. Rocchi, M. R. Farmery, N. J. Bulleid & R. Sitia: J. Biol. Chem., 275, 4827 (2000).
  17. 17) M. Pagani, M. Fabbri, C. Benedetti, A. Fassio, S. Pilati, N. J. Bulleid, A. Cabibbo & R. Sitia: J. Biol. Chem., 275, 23685 (2000).
  18. 18) C. Appenzeller-Herzog, J. Riemer, B. Christensen, E. S. Sorensen & L. Ellgaard: EMBO J., 27, 2977 (2008).
  19. 19) M. Matsusaki, A. Okuda, T. Masuda, K. Koishihara, R. Mita, K. Iwasaki, K. Hara, Y. Naruo, A. Hirose, Y. Tsuchi et al.: Plant Physiol., 170, 774 (2016).
  20. 20) R. Inoue, T. Nakagawa, K. Morishima, N. Sato, A. Okuda, R. Urade, R. Yogo, S. Yanaka, M. Yagi-Utsumi, K. Kato et al.: Sci. Rep., 9, 12610 (2019).
  21. 21) K. Morishima, A. Okuda, R. Inoue, N. Sato, Y. Miyamoto, R. Urade, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, R. Hirano, T. Kujirai et al.: Commun. Biol., 3, 1 (2020).
  22. 22) A. Okuda, M. Shimizu, K. Morishima, R. Inoue, N. Sato, R. Urade & M. Sugiyama: Sci. Rep., 11, 5655 (2021).
  23. 23) M. Sugiyama, H. Yagi, T. Yamaguchi, K. Kumoi, M. Hirai, Y. Oba, N. Sato, L. Porcar, A. Martel & K. Kato: J. Appl. Cryst., 47, 430 (2014).
  24. 24) A. Okuda, R. Inoue, K. Morishima, T. Saio, Y. Yunoki, M. Yagi-Utsumi, H. Yagi, M. Shimizu, N. Sato, R. Urade et al.: Biophys. Physicobiol., 18, 16 (2021).
  25. 25) A. Okuda, M. Shimizu, R. Inoue, R. Urade & M. Sugiyama: Angew. Chem. Int. Ed., 62, e202214412 (2023).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。