生物コーナー

国立遺伝学研究所で保存される野生イネ遺伝資源の現在と未来
ゲノム科学時代の野生イネ遺伝資源の利活用

Vol.63 No.4 Page. 174 - 185 (published date : 2025年4月1日)
佐藤 豊1, 吉川 貴徳1
  1. 国立遺伝学研究所
vol63_4

 

概要原稿

国立遺伝学研究所（遺伝研）は1950年代以降に収集された野生イネ属遺伝資源（野生イネ）を多数保存している．本稿では，遺伝研が保有する野生イネ遺伝資源の概要とその多様性，さらにこれらのゲノム解読により可能となった野生イネ資源の新たな利用の試みを紹介する．

リファレンス

  1. 1) E. E. Rezaei, H. Webber, S. Asseng, K. Boote, J. L. Durand, F. Ewert, P. Martre & D. S. MacCarthy: Nat. Rev. Earth Environ., 4, 831 (2023).
  2. 2) J. R. Porter, L. Xie, A. J. Challinor, K. Cochrane, S. M. Howden, M. M. Iqbal, D. B. Lobell & M. I. Travasso: “Food security and food production systems. In: Climate Change 2014: Impacts, Adaptation, and Vulnerability. Part A: Global and Sectoral Aspects. Contribution of Working Group II to the Fifth Assessment Report of the Intergovernmental Panel on Climate Change,” Cambridge University Press, 2014, p. 485.
  3. 3) B. M. Campbell, J. Hansen, J. Rioux, C. M. Stirling, S. Twomlow & E. Wollenberg: Curr. Opin. Environ. Sustain., 34, 13 (2018).
  4. 4) S. Ceccarelli, S. Grando, M. Maatougui, M. Michael, M. Slash, R. Haghparast, M. Rahmanian, A. Taheri, A. Al-Yassin, A. Benbelkacem et al.: J. Agric. Sci., 148, 627 (2010).
  5. 5) T. J. Flowers, M. L. Koyama, S. A. Flowers, C. Sudhakar, K. P. Singh & A. R. Yeo: J. Exp. Bot., 51, 99 (2000).
  6. 6) S. R. G. Raj & K. Nadarajah: Int. J. Mol. Sci., 24, 6 (2022).
  7. 7) J. Wen, F. Jiang, Y. Weng, M. Sun, X. Shi, Y. Zhou, L. Yu & Z. Wu: BMC Plant Biol., 19, 1 (2019).
  8. 8) R. K. Joshi & S. Nayak: Biotechnol. Mol. Biol. Rev., 5, 51 (2010).
  9. 9) V. Muthu, R. Abbai, J. Nallathambi, H. Rahman, S. Ramasamy, R. Kambale, T. Thulasinathan, B. Ayyenar & R. Muthurajan: PLoS One, 15, e0227421 (2020).
  10. 10) D. A. Vaughan, E. Balazs & J. S. Heslop-Harrison: Ann. Bot. (Lond.), 100, 893 (2007).
  11. 11) M. J. Kovach, M. T. Sweeney & S. R. McCouch: Trends Genet., 23, 578 (2007).
  12. 12) R. S. Meyer, J. Y. Choi, M. Sanches, A. Plessis, J. M. Flowers, J. Amas, K. Dorph, A. Barretto, B. Gross, D. Q. Fuller et al.: Nat. Genet., 48, 1083 (2016).
  13. 13) M. Sweeney & S. McCouch: Ann. Bot., 100, 951 (2007).
  14. 14) T. Izawa: Plant Cell Physiol., 63, 1529 (2022).
  15. 15) H. Zhang, N. Mittal, L. J. Leamy, O. Barazani & B. H. Song: Evol. Appl., 10, 5 (2017).
  16. 16) B. J. Atwell, H. Wang & A. P. Scafaro: Plant Sci., 215-216, 48 (2014).
  17. 17) D. A. Vaughan, H. Morishima & K. Kadowaki: Curr. Opin. Plant Biol., 6, 139 (2003).
  18. 18) K. B. Gaikwad, N. Singh, P. Kaur, S. Rani, P. Babu H & K. Singh: Plant Breed., 140, 23 (2021).
  19. 19) X. Huang, N. Kurata, X. Wei, Z. X. Wang, A. Wang, Q. Zhao, Y. Zhao, K. Liu, H. Lu, W. Li et al.: Nature, 490, 497 (2012).
  20. 20) H. Wang, F. G. Vieira, J. E. Crawford, C. Chu & R. Nielsen: Genome Res., 27, 1029 (2017).
  21. 21) Q. Zhao, Q. Feng, H. Lu, Y. Li, A. Wang, Q. Tian, Q. Zhan, Y. Lu, L. Zhang, T. Huang et al.: Nat. Genet., 50, 278 (2018).
  22. 22) N. Kurata, H. Satoh, H. Kitano, Y. Nagato, T. Endo, K. Sato, R. Akashi, H. Ezura, M. Kusaba, M. Kobayashi et al.: Breed. Sci., 60, 461 (2010).
  23. 23) Y. Sato, K. Tsuda, Y. Yamagata, H. Matsusaka, H. Kajiya-Kanegae, Y. Yoshida, A. Agata, K. N. Ta, S. Shimizu-Sato, T. Suzuki et al.: Breed. Sci., 71, 291 (2021).
  24. 24) N. Kurata & Y. Yamazaki: Plant Physiol., 140, 12 (2006).
  25. 25) Y. Yamazaki, S. Sakaniwa, R. Tsuchiya, K. I. Nonomura & N. Kurata: Breed. Sci., 60, 544 (2010).
  26. 26) R. Liu, X. M. Zheng, L. Zhou, H. F. Zhou & S. Ge: Mol. Ecol., 24, 5211 (2015).
  27. 27) X. M. Zheng & S. Ge: Mol. Ecol., 19, 2439 (2010).
  28. 28) Y. Yamagata, K. T. Win, Y. Miyazaki, C. Ogata, H. Yasui & A. Yoshimura: Breed. Sci., 69, 359 (2019).
  29. 29) T. Kurakazu, Sobrizal K. Ikeda, P. L. Sanchez, K. Doi, E. R. Angeles, G. S. Khush & A. Yoshimura: Rice Genet. Newsl., 18, 81 (2001).
  30. 30) Sobrizal, K. Ikeda, P. L. Sanchez, K. Doi, E. R. Angeles, G. S. Khush & A. Yosimura: Rice Genet. Newsl., 16, 107 (1999).
  31. 31) A. Yoshimura, H. Nagayama, Sobrizal, T. Kurakazu, P. L. Sanchez, K. Doi, Y. Yamagata & H. Yasui: Breed. Sci., 60, 597 (2010).
  32. 32) K. I. Nonomura, H. Morishima, T. Miyabayashi, S. Yamaki, M. Eiguchi, T. Kubo & N. Kurata: Breed. Sci., 60, 502 (2010).
  33. 33) H. Kajiya-Kanegae, H. Ohyanagi, T. Ebata, Y. Tanizawa, A. Onogi, Y. Sawada, M. Yokota-Hirai, Z. X. Wang, B. Han, A. Toyoda et al.: Rice (N. Y.), 14, 24 (2021).
  34. 34) K. N. Ta, S. Shimizu-Sato, A. Agata, Y. Yoshida, K. I. Taoka, H. Tsuji, T. Akagi, Y. Tanizawa, R. Sano, M. Nosaka-Takahashi et al.: Plant J., 115, 175 (2023).
  35. 35) A. Fornasiero, T. Feng, N. Al-Bader, A. Alsantely, S. Mussurova, N. V. Hoang, G. Misra, Y. Zhou, L. Fabbian, N. Mohammed et al.: bioRxiv, 2024-05 (2024).
  36. 36) H. Wang, X. Xu, F. G. Vieira, Y. Xiao, Z. Li, J. Wang, R. Nielsen & C. Chu: Mol. Plant, 9, 975 (2016).
  37. 37) P. Malik, M. Huang, K. Neelam, D. Bhatia, R. Kaur, B. Yadav, J. Singh, C. Sneller & K. Singh: Rice, 15, 37 (2022).
  38. 38) S. K. Aggarwal, P. Malik, K. Neelam, K. Kumar, R. Kaur, J. S. Lore & K. Singh: Euphytica, 218, 144 (2022).
  39. 39) J. Yan, T. Aboshi, M. Teraishi, S. R. Strickler, J. E. Spindel, C. W. Tung, R. Takata, F. Matsumoto, Y. Maesaka, S. R. McCouch et al.: Plant Cell, 27, 1265 (2015).
  40. 40) K. K. Jena: Breed. Sci., 60, 518 (2010).
  41. 41) H. Morishima & H. I. Oka: Evolution, 14, 153 (1960).
  42. 42) D. S. Brar & G. S. Khush: “Alien introgression in rice. Oryza: from molecule to plant”, Springer Press, 1997, p. 35.
  43. 43) B. D. Nguyen, D. S. Brar, B. C. Bui, T. V. Nguyen, L. N. Pham & H. T. Nguyen: Theor. Appl. Genet., 106, 583 (2003).
  44. 44) E. M. Septiningsih, J. Prasetiyono, E. Lubis, T. H. Tai, T. Tjubaryat, S. Moeljopawiro & S. R. McCouch: Theor. Appl. Genet., 107, 1419 (2003).
  45. 45) E. M. Septiningsih, K. R. Trijatmiko, S. Moeljopawiro & S. R. McCouch: Theor. Appl. Genet., 107, 1433 (2003).
  46. 46) J. Xiao, S. Grandillo, S. N. Ahn, S. R. McCouch, S. D. Tanksley, J. Li & L. Yuan: Nature, 384, 223 (1996).
  47. 47) R. Quan, J. Wang, J. Hui, H. Bai, X. Lyu, Y. Zhu, H. Zhang, Z. Zhang, S. Li & R. Huang: Front. Plant Sci., 8, 2269 (2018).
  48. 48) Y. Koide, D. Kuniyoshi & Y. Kishima: Front. Plant Sci., 11, 1231 (2020).
  49. 49) S. Ge, T. Sang, B. R. Lu & D. Y. Hong: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96, 14400 (1999).
  50. 50) G. S. Khush: Plant Mol. Biol., 35, 25 (1997).
  51. 51) K. K. Jena & G. S. Khush: Genome, 32, 449 (1989).
  52. 52) K. K. Jena & G. S. Khush: Theor. Appl. Genet., 80, 737 (1990).
  53. 53) A. Amante-Bordeos, L. A. Sitch, R. Nelson, R. D. Dalmacio, N. P. Oliva, H. Aswidinnoor & H. Leung: Theor. Appl. Genet., 84, 345 (1992).
  54. 54) D. S. Multani, K. K. Jena, D. S. Brar, B. G. de Los Reyes, E. R. Angeles & G. S. Khush: Theor. Appl. Genet., 88, 102 (1994).
  55. 55) H. Yu, T. Lin, X. Meng, H. Du, J. Zhang, G. Liu, M. Chen, Y. Jing, L. Kou, X. Li et al.: Cell, 184, 1156 (2021).
  56. 56) A. Alsantely, R. Gutaker, M. E. Navarrete Rodriguez, G. Arrieta-Espinoza, E. J. Fuchs, A. Costa de Oliveira, J. Tohme, A. Zuccolo, R. A. Wing & A. Fornasiero: J. Exp. Bot., 74, 1331 (2023).
  57. 57) S. Shimizu-Sato, K. Tsuda, M. Nosaka-Takahashi, T. Suzuki, S. Ono, K. N. Ta, Y. Yoshida, K. I. Nonomura & Y. Sato: Rice, 13, 1 (2020).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。