解説

巨大な動物細胞ゲノムはどのように倍加されるのか？
ゲノム網羅的な解析からわかったこと

Vol.63 No.6 Page. 267 - 273 (published date : 2025年6月1日)
竹林 慎一郎1
  1. 三重大学大学院生物資源学研究科分子細胞生物学教育研究分野
vol63_6

 

概要原稿

次世代シーケンサーを用いたゲノム網羅的な解析を通して，これまでアプローチの難しかった動物細胞の巨大なゲノムのDNA複製過程について正確な全体像がわかってきた．最新の解析技術とともに，この分野の最近の動向について解説する．

リファレンス

  1. 1) D. M. Gilbert, S. I. Takebayashi, S. T. Ryba, J. Lu, B. D. Pope, K. A. Wilson & I. Hiratani: Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 75, 143 (2010).
  2. 2) S. I. Takebayashi, M. Ogata & K. Okumura: Genes (Basel), 8, 110 (2017).
  3. 3) I. Hiratani, T. Ryba, M. Itoh, J. Rathjen, M. Kulik, B. Papp, E. Fussner, D. P. Bazett-Jones, K. Plath, S. Dalton et al.: Genome Res., 20, 155 (2010).
  4. 4) J. C. Rivera-Mulia, Q. Buckley, T. Sasaki, J. Zimmerman, R. A. Didier, K. Nazor, J. F. Loring, Z. Lian, S. Weissman, A. J. Robins et al.: Genome Res., 25, 1091 (2015).
  5. 5) T. Ryba, I. Hiratani, T. Sasaki, D. Battaglia, M. Kulik, J. Zhang, S. Dalton & D. M. Gilbert: PLOS Comput. Biol., 7, e1002225 (2011).
  6. 6) T. Hayakawa, A. Yamamoto, T. Yoneda, S. Hori, N. Okochi, K. Kagotani, K. Okumura & S. I. Takebayashi: J. Cell Sci., 136, jcs260778 (2023).
  7. 7) T. Yokochi, K. Poduch, T. Ryba, J. Lu, I. Hiratani, M. Tachibana, Y. Shinkai & D. M. Gilbert: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 19363 (2009).
  8. 8) S. Takebayashi, I. Lei, T. Ryba, T. Sasaki, V. Dileep, D. Battaglia, X. Gao, P. Fang, Y. Fan, M. A. Esteban et al.: Epigenetics Chromatin, 6, 42 (2013).
  9. 9) S. I. Takebayashi, T. Ryba, K. Wimbish, T. Hayakawa, M. Sakaue, K. Kuriya, S. Takahashi, S. Ogata, I. Hiratani, K. Okumura et al.: Cells, 10, 266 (2021).
  10. 10) J. Sima, A. Chakraborty, V. Dileep, M. Michalski, K. N. Klein, N. P. Holcomb, J. L. Turner, M. T. Paulsen, J. C. Rivera-Mulia, C. Trevilla-Garcia et al.: Cell, 176, 816 (2019).
  11. 11) C. A. Muller & C. A. Nieduszynski: J. Cell Biol., 216, 1907 (2017).
  12. 12) Y. Voichek, R. Bar-Ziv & N. Barkai: Science, 351, 1087 (2016).
  13. 13) J. Zhang, F. Xu, T. Hashimshony, I. Keshet & H. Cedar: Nature, 420, 198 (2002).
  14. 14) R. Somech, S. Shaklai, O. Geller, N. Amariglio, A. J. Simon, G. Rechavi & E. N. Gal-Yam: J. Cell Sci., 118, 4017 (2005).
  15. 15) I. Hiratani, S. Takebayashi, J. Lu & D. M. Gilbert: Curr. Opin. Genet. Dev., 19, 142 (2009).
  16. 16) R. L. Hannibal, E. B. Chuong, J. C. Rivera-Mulia, D. M. Gilbert, A. Valouev & J. C. Baker: PLoS Genet., 10, e1004290 (2014).
  17. 17) S. I. Takebayashi, S. Ogata, M. Ogata & K. Okumura: Biosci. Biotechnol. Biochem., 82, 2098 (2018).
  18. 18) C. Marchal, T. Sasaki, D. Vera, K. Wilson, J. Sima, J. C. Rivera-Mulia, C. Trevilla-Garcia, C. Nogues, E. Nafie & D. M. Gilbert: Nat. Protoc., 13, 819 (2018).
  19. 19) S. Takahashi, H. Miura, T. Shibata, K. Nagao, K. Okumura, M. Ogata, C. Obuse, S. I. Takebayashi & I. Hiratani: Nat. Genet., 51, 529 (2019).
  20. 20) H. Miura, S. Takahashi, T. Shibata, K. Nagao, C. Obuse, K. Okumura, M. Ogata, I. Hiratani & S. I. Takebayashi: Nat. Protoc., 15, 4058 (2020).
  21. 21) C. Chen, D. Xing, L. Tan, H. Li, G. Zhou, L. Huang & X. S. Xie: Science, 356, 189 (2017).
  22. 22) S. Takahashi, H. Kyogoku, T. Hayakawa, H. Miura, A. Oji, Y. Kondo, S. I. Takebayashi, T. S. Kitajima & I. Hiratani: Nature, 633, 686 (2024).
  23. 23) M. Sakamoto, S. Hori, A. Yamamoto, T. Yoneda, K. Kuriya & S. I. Takebayashi: Cytogenet. Genome Res., 162, 161 (2022).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。