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トランスクリプトームメタ解析による植物のストレス応答遺伝子探索
未知のストレス応答遺伝子を簡便かつ迅速に見つけるには?
Vol.63 No.7 Page. 290 - 292 (published date : 2025年7月1日)
川口 晃平1,
福田 由介2,
福島 敦史2,3
- 東京科学大学生命理工学院
- 京都府立大学大学院生命環境科学研究科
- 理化学研究所情報統合本部
概要原稿
近年,公共データベース上のさまざまなデータを再利用して,植物遺伝子の機能解明および解析ツールの開発が盛んに行われている.本稿では,トランスクリプトームデータを活用したメタ解析の現状について概説する.
リファレンス
- 1) T. Obayashi, H. Hibara, Y. Kagaya, Y. Aoki & K. Kinoshita: Plant Cell Physiol., 63, 869 (2022).
- 2) D. Winter, B. Vinegar, H. Nahal, R. Ammar, G. V. Wilson & N. J. Provart: PLoS One, 2, e718 (2007).
- 3) K. Tamura & H. Bono: Life (Basel), 12, 1079 (2022).
- 4) M. Shintani, K. Tamura & H. Bono: Front. Plant Sci., 15, 1343787 (2024).
- 5) R. K. Hayford, O. C. Haley, E. K. Cannon, J. L. Portwood II, J. M. Gardiner, C. M. Andorf & M. R. Woodhouse: BMC Genomics, 25, 533 (2024).
- 6) S. Smita, A. Katiyar, S. K. Lenka, M. Dalal, A. Kumar, S. K. Mahtha, G. Yadav, V. Chinnusamy, D. M. Pandey & K. C. Bansal: Funct. Integr. Genomics, 20, 29 (2020).
- 7) Y. Fukuda, K. Kawaguchi & A. Fukushima: Plant Physiol., 197, kiaf105 (2025).
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