今日の話題

増えない微生物を培養する
培養系再考のすすめ

Vol.52 No.2 Page. 73 - 75 (published date : 2014年2月1日)
橋床 泰之1
  1. 北海道大学

概要原稿

この地球上に存在する微生物の99%は純粋分離も培養もできないことが指摘されて久しいが（1），次世代シーケンサーによってもたらされる腸内圏（腸の内部）や根圏（根の周辺空間），水圏（陸水や海水中），土壌圏（土や岩石の中）の環境微生物菌叢に関する大量の遺伝子情報は，難培養微生物を含めた環境微生物の多様性が想像以上に高いことを示している（2）．数グラムの土壌試料から得られるDNA量でも，これを次世代シーケンサーにかければ，培養できない難培養微生物も含めて，1万種以上の細菌16S rRNA遺伝子情報を一度に得ることが可能である．

リファレンス

  1. 1) R. I. Amann, W. Ludwig & K. H. Schleifer : Microbiol. Rev., 59, 143 (1995).
  2. 2) 玉木秀幸，鎌形洋一：化学と生物，50, 730 (2012).
  3. 3) 鎌形洋一：環境バイオテクノロジー学会誌，7, 69 (2007).
  4. 4) 松本伯夫：醗酵工業とものづくりの最前線，6, 299 (2011).
  5. 5) H. Hoo, Y. Hashidoko, M. T. Islam & S. Tahara : Appl. Environ. Microbiol., 70, 5214 (2004).
  6. 6) N. Ogita, Y. Hashidoko, S. H. Limin & S. Tahara : Biosci. Biotechnol. Biochem., 70, 2325 (2006).
  7. 7) J. H. Harris : Appl. Environ. Microbiol., 50, 1107 (1985).
  8. 8) S. Hara, R. V. Desyatkin, T. Morishita, R. Hatano & Y. Hashidoko : Soil Sci. Plant Nutr., 57, 716 (2010).
  9. 9) S. Hara, R. Isoda, T. Tahvanainen & Y. Hashidoko : PLoS ONE, 7, e41142 (2012).
  10. 10) 理化学研究所プレスリリース http://www.riken.jp/~/media/riken/pr/press/2000/20000907_1/20000907_1.pdf


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