今日の話題

ヘムと共有結合するタンパク質の構造予測
AlphaFold3が起こしたブレイクスルー

Vol.63 No.10 Page. 434 - 437 (published date : 2025年10月1日)
藤井 創太郎1
  1. 広島大学大学院統合生命科学研究科食品生命科学プログラム
vol63_10

 

概要原稿

シトクロムcは，補因子であるヘムと共有結合して機能する．近年台頭するAIがどれほどの精度でヘムの位置を含んだ構造予測を可能としているのか，我々の研究と共に解説する．

リファレンス

  1. 1) Y. Sambongi & S. J. Ferguson:FEBS Lett.,340, 65 (1994).
  2. 2) J. Jumper, R. Evans, A. Pritzel, T. Green, M. Figurnov, O. Ronneberger, K. Tunyasuvunakool, R. Bates, A. Zidek, A. Potapenkoet al.:Nature,596, 583 (2021).
  3. 3) M. Baek, F. DiMaio, I. Anishchenko, J. Dauparas, S. Ovchinnikov, G. R. Lee, J. Wang, Q. Cong, L. N. Kinch, R. D. Schaefferet al.:Science,373, 871 (2021).
  4. 4) T. Yoshimi, S. Fujii, H. Oki T. Igawa, H. R. Adams, K. Ueda, K. Kawahara, T. Ohkubo, M. A. Hough & Y. Sambongi:Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun.,78, 217 (2022).
  5. 5) H. X. Kondo & Y. Takano:Chem. Lett.,53, upae148 (2024).
  6. 6) M. L. Hekkelman, I. de Vries, R. P. Joosten & A. Perrakis:Nat. Methods,20, 205 (2023).
  7. 7) R. Krishna, J. Wang, W. Ahern, P. Sturmfels, P. Venkatesh, I. Kalvet, G. R. Lee, F. S. Morey-Burrows, I. Anishchenko, I. R. Humphreyset al.:Science,384, eadl2528 (2024).
  8. 8) J. Abramson, J. Adler, J. Dunger, R. Evans, T. Green, A. Pritzel, O. Ronneberger, L. Willmore, A. J. Ballard, J. Bambricket al.:Nature,630, 493 (2024).
  9. 9) M. Masanari, S. Fujii, K. Kawahara, H. Oki, H. Tsujino, T. Maruno, Y. Kobayashi, T. Ohkubo, S. Wakai & Y. Sambongi:Biosci. Biotechnol. Biochem.,80, 2365 (2016).
  10. 10) H. R. Adams, S. Fujii, H. E. Pfalzgraf, P. Smyth, C. R. Andrew & M. A. Hough:Eur. J. Biochem.,30, 181 (2025).
  11. 11) M. M. Bollmeyer, R. E. Coleman, S. H. Majer, S. D. Ferrao & K. M. Lancaster:J. Am. Chem. Soc.,145, 14404 (2023).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。