セミナー室 / 糖質関連酵素の最近の進歩

糖質加水分解酵素ファミリー内の機能の保存性と多様性

Vol.53 No.2 Page. 120 - 126 (published date : 2015年1月20日)
奥山 正幸1
  1. 北海道大学大学院農学研究院応用生命科学部門
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概要原稿

一見異なる触媒反応であってもGHファミリー内ではGH13のように，触媒機構や立体構造は保存されているのが一般的である．一方，同一GHファミリーに分類される酵素でも，GH31，GH97のように機能がファミリー内で多様化している例もある．これらを知っておくことは配列類似性をもとに構造や機能を類推する上で有用であると考える．

リファレンス

  1. 1) V. Lombard, H. R. Ramulu, E. Drula, P. M. Coutinho & B. Henrissat: Nucleic Acids Res., 42 (Detabase issue), D490 (2013).
  2. 2) R. M. Kelly, H. Leemhuis & L. Dijkhuizen: Biochemistry, 46, 11216 (2007).
  3. 3) K. Ito, S. Ito, K. Ishino, A. S. Ibuka & H. Sakai: Biochim. Biophys. Acta, 1774, 443 (2007).
  4. 4) K. Yamamoto, H. Miyake, M. Kusunoki & S. Osaki: J. Biosci. Bioeng., 112, 545 (2011).
  5. 5) H. J. Rozeboom, S. Yu, S. Madrid, K. H. Kalk, R. Zhang & B. W. Dijskstra: J. Biol. Chem., 288, 26764 (2013).
  6. 6) T. M. Gloster, J. P. Turkenburg, J. R. Potts, B. Henrissat & G. J. Davies: Chem. Biol., 15, 1058 (2008).
  7. 7) M. Kitamura, M. Okuyama, F. Tanzawa, H. Mori, Y. Kitago, N. Watanabe, A. Kimura, I. Tanaka & M. Yao: J. Biol. Chem., 283, 36328 (2008).
  8. 8) M. Okuyama, M. Kitamura, H. Hondoh, M. S. Kang, H. Mori, A. Kimura, I. Tanaka & M. Yao: J. Mol. Biol., 392, 1232 (2009).
  9. 9) A. E. Todd, C. A. Orengo & J. M. Thornton: J. Mol. Biol., 307, 1113 (2001).


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