セミナー室 / 植物細胞壁の情報処理システム

木材腐朽担子菌のゲノム・ポストゲノム解析から植物細胞壁と分解酵素の共進化を考える

Vol.53 No.6 Page. 381 - 388 (published date : 2015年5月20日)
堀 千明1, 五十嵐 圭日子2, 鮫島 正浩2
  1. 理化学研究所環境資源科学研究センター
  2. 東京大学大学院農学生命科学研究科
vol53_6

 

概要原稿

本稿では，筆者らがかかわってきた木材腐朽担子菌のゲノム・ポストゲノム解析の動向について解説すると同時に，細胞壁を壊されないように進化する植物と，より強力な分解力を手に入れようとする腐朽菌の「いたちごっこ」を紹介したい．

リファレンス

  1. 1) R. Hartig: “Die Zersetzungserscheinungen des Holzes der Nadelholzbaume und der Eiche in Forstlicher, Botanischer und Chemischer Richtung,” Springer, 1876.
  2. 2) J. J. Worrall, S. E. Anagnost & R. A. Zabel: Mycologia, 89, 199 (1997).
  3. 3) M. Tien & T. K. Kirk: Science, 221, 661 (1983).
  4. 4) P. Kersten & D. Cullen: Fungal Genet. Biol., 44, 77 (2007).
  5. 5) B. L. Cantarel, P. M. Coutinho, C. Rancurel, T. Bernard, V. Lombard & B. Henrissat: Nucleic Acids Res., 37 (Database), D233 (2009).
  6. 6) A. Levasseur, F. Piumi, P. M. Coutinho, C. Rancurel, M. Asther, M. Delattre, B. Henrissat, P. Pontarotti, M. Asther & E. Record: Fungal Genet. Biol., 45, 638 (2008).
  7. 7) A. Levasseur, E. Drula, V. Lombard, P. M. Coutinho & B. Henrissat: Biotech. Biofuels, 6, 41 (2013).
  8. 8) G. Vaaje-Kolstad, B. Westereng, S. J. Horn, Z. Liu, H. Zhai, M. Sørlie & V. G. H. Eijsink: Science, 330, 219 (2010).
  9. 9) R. J. Quinlan, M. D. Sweeney, L. Lo Leggio, H. Otten, J.-C. N. Poulsen, K. S. Johansen, K. B. R. M. Krogh, C. I. Jørgensen, M. Tovborg, A. Anthonsen et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 15079 (2011).
  10. 10) C. M. Phillips, W. T. Beeson IV, J. H. Cate & M. A. Marletta: ACS Chem. Biol., 6, 1399 (2011).
  11. 11) B. Westereng, T. Ishida, G. Vaaje-Kolstad, M. Wu, V. G. H. Eijsink, K. Igarashi, M. Samejima, J. Ståhlberg, S. J. Horn & M. Sandgren: PLoS ONE, 6, e27807 (2011).
  12. 12) H. Matsumura, K. Umezawa, K. Takeda, N. Sugimoto, T. Ishida, M. Samejima, H. Ohno, M. Yoshida, K. Igarashi & N. Nakamura: PLoS ONE, 9, e104851 (2014).
  13. 13) D. Martinez, L. F. Larrondo, N. Putnam, M. D. S. Gelpke, K. Huang, J. Chapman, K. G. Helfenbein, P. Ramaiya, J. C. Detter, F. Larimer et al.: Nat. Biotechnol., 22, 695 (2004).
  14. 14) R. Riley, A. A. Salamov, D. W. Brown, L. G. Nagy, D. Floudas, B. W. Held, A. Levasseur, V. Lombard, E. Morin, R. Otillar et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, 9923 (2014).
  15. 15) I. V. Grigoriev, R. Nikitin, S. Haridas, A. Kuo, R. Ohm, R. Otillar, R. Riley, A. Salamov, X. Zhao, F. Korzeniewski et al.: Nucleic Acids Res., 42(D1), D699 (2014).
  16. 16) A. Vanden Wymelenberg, G. Sabat, D. Martinez, A. S. Rajangam, T. T. Teeri, J. Gaskell, P. J. Kersten & D. Cullen: J. Biotechnol., 118, 17 (2005).
  17. 17) A. Vanden Wymelenberg, P. Minges, G. Sabat, D. Martinez, A. Aerts, A. Salamov, I. Grigoriev, H. Shapiro, N. Putnam, P. Belinky et al.: Fungal Genet. Biol., 43, 343 (2006).
  18. 18) A. Abbas, H. Koc, F. Liu & M. Tien: Curr. Genet., 47, 49 (2005).
  19. 19) S. Sato, F. Liu, H. Koc & M. Tien: Microbiology, 153, 3023 (2007).
  20. 20) S. Sato, F. A. Feltus, P. Iyer & M. Tien: Curr. Genet., 55, 273 (2009).
  21. 21) M. Shimizu, T. Fujii, S. Masuo, K. Fujita & N. Takaya: Proteomics, 9, 7 (2009).
  22. 22) C. Hori, K. Igarashi, A. Katayama & M. Samejima: FEMS Microbiol. Lett., 321, 14 (2011).
  23. 23) C. Hori, H. Suzuki, K. Igarashi & M. Samejima: Appl. Environ. Microbiol., 78, 3770 (2012).
  24. 24) R. A. Blanchette: Annu. Rev. Phytopathol., 29, 381 (1991).
  25. 25) E. Fernandez-Fueyo, F. J. Ruiz-Dueñas, P. Ferreira, D. Floudas, D. S. Hibbett, P. Canessa, L. F. Larrondo, T. Y. James, D. Seelenfreund, S. Lobos et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 5458 (2012).
  26. 26) C. Hori, J. Gaskell, K. Igarashi, P. Kersten, M. Mozuch, M. Samejima & D. Cullen: Appl. Environ. Microbiol., 80, 2062 (2014).
  27. 27) D. Martinez, J. Challacombe, I. Morgenstern, D. Hibbett, M. Schmoll, C. P. Kubicek, P. Ferreira, F. J. Ruiz-Duenas, A. T. Martinez, P. Kersten et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 1954 (2009).
  28. 28) A. Vanden Wymelenberg, J. Gaskell, M. Mozuch, G. Sabat, J. Ralph, O. Skyba, S. D. Mansfield, R. A. Blanchette, D. Martinez, I. Grigoriev et al.: Appl. Environ. Microbiol., 76, 3599 (2010).
  29. 29) D. C. Eastwood, D. Floudas, M. Binder, A. Majcherczyk, P. Schneider, A. Aerts, F. O. Asiegbu, S. E. Baker, K. Barry, M. Bendiksby et al.: Science, 333, 762 (2011).
  30. 30) C. Hori, J. Gaskell, K. Igarashi, M. Samejima, D. Hibbett, B. Henrissat & D. Cullen: Mycologia, 105, 1412 (2013).
  31. 31) A. Vanden Wymelenberg, J. Gaskell, M. Mozuch, S. S. Bondurant, G. Sabat, J. Ralph, O. Skyba, S. D. Mansfield, R. A. Blanchette, I. V. Grigoriev et al.: Appl. Environ. Microbiol., 77, 4499 (2011).
  32. 32) S. Mahajan & E. R. Master: Appl. Microbiol. Biotechnol., 86, 1903 (2010).
  33. 33) H. Suzuki, J. Macdonald, K. Syed, A. Salamov, C. Hori, A. Aerts, B. Henrissat, A. Wiebenga, P. A. Vankuyk, K. Barry et al.: BMC Genomics, 13, 444 (2012).
  34. 34) C. Hori, T. Ishida, K. Igarashi, M. Samejima, H. Suzuki, E. Master, P. Ferreira, F. J. Ruiz-Duenas, B. Held, P. Canessa et al.: PLoS Genetics, 10, e1004759 (2014).
  35. 35) D. Floudas, M. Binder, R. Riley, K. Barry, R. A. Blanchette, B. Henrissat, A. T. Martínez, R. Otillar, J. W. Spatafora, J. S. Yadav et al.: Science, 336, 1715 (2012).
  36. 36) 横山隆亮，西谷和彦：植物科学最前線，5, 45 (2014).
  37. 37) C. Kremer, F. Pettolino, A. Bacic & A. Drinnan: Planta, 219, 1023 (2004).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。