解説

アーキアにおける補酵素A(coenzyme A)の生合成機構

Vol.54 No.2 Page. 85 - 93 (published date : 2016年1月20日)
冨田 宏矢1, 横大路 裕介1, 跡見 晴幸1,2
  1. 京都大学大学院工学研究科合成・生物化学専攻
  2. JST, CREST
vol54_2

 

概要原稿

アーキアは真核生物やバクテリアとは区別される第3のドメインを構成し,真核生物やバクテリアには見られない数多くの生命機能・生命機構を有する.本稿では全生物に共通して存在する補酵素Aに焦点を当て,アーキアにおけるその生合成経路や制御機構の興味深い特徴について,バクテリアや真核生物のものとの違いを中心に紹介する.

リファレンス

  1. 1) C. R. Woese & G. E. Fox: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74, 5088 (1977).
  2. 2) L. J. Magrum, K. R. Luehrsen & C. R. Woese: J. Mol. Evol., 11, 1 (1978).
  3. 3) C. R. Woese, J. Maniloff & L. B. Zablen: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77, 494 (1980).
  4. 4) G. E. Fox, E. Stackebrandt, R. B. Hespell, J. Gibson, J. Maniloff, T. A. Dyer, R. S. Wolfe, W. E. Balch, R. S. Tanner, L. J. Magrum et al.: Science, 209, 457 (1980).
  5. 5) C. R. Woese, L. J. Magrum & G. E. Fox: J. Mol. Evol., 11, 245 (1978).
  6. 6) C. R. Woese, O. Kandler & M. L. Wheelis: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 4576 (1990).
  7. 7) C. A. Francis, J. M. Beman & M. M. Kuypers: ISME J., 1, 19 (2007).
  8. 8) S. Leininger, T. Urich, M. Schloter, L. Schwark, J. Qi, G. W. Nicol, J. I. Prosser, S. C. Schuster & C. Schleper: Nature, 442, 806 (2006).
  9. 9) H. Atomi, T. Fukui, T. Kanai, M. Morikawa & T. Imanaka: Archaea, 1, 263 (2004).
  10. 10) M. Morikawa, Y. Izawa, N. Rashid, T. Hoaki & T. Imanaka: Appl. Environ. Microbiol., 60, 4559 (1994).
  11. 11) T. Fukui, H. Atomi, T. Kanai, R. Matsumi, S. Fujiwara & T. Imanaka: Genome Res., 15, 352 (2005).
  12. 12) R. Matsumi, K. Manabe, T. Fukui, H. Atomi & T. Imanaka: J. Bacteriol., 189, 2683 (2007).
  13. 13) T. Sato, T. Fukui, H. Atomi & T. Imanaka: J. Bacteriol., 185, 210 (2003).
  14. 14) T. Sato, T. Fukui, H. Atomi & T. Imanaka: Appl. Environ. Microbiol., 71, 3889 (2005).
  15. 15) N. Kresge, R. D. Simoni & R. L. Hill: J. Biol. Chem., 280, e18 (2005).
  16. 16) F. Lipmann: J. Biol. Chem., 160, 173 (1945).
  17. 17) F. Lipmann & N. O. Kaplan: J. Biol. Chem., 162, 743 (1946).
  18. 18) U. Genschel: Mol. Biol. Evol., 21, 1242 (2004).
  19. 19) R. Leonardi, Y. M. Zhang, C. O. Rock & S. Jackowski: Prog. Lipid Res., 44, 125 (2005).
  20. 20) C. Spry, K. Kirk & K. J. Saliba: FEMS Microbiol. Rev., 32, 56 (2008).
  21. 21) World Health Organization: In “Vitamin and mineral requirements in human nutrition (Second edition),” pp. 180–182, 2004.
  22. 22) Y. Yokooji, H. Tomita, H. Atomi & T. Imanaka: J. Biol. Chem., 284, 28137 (2009).
  23. 23) H. Katoh, H. Tamaki, Y. Tokutake, S. Hanada & S. Chohnan: J. Biosci. Bioeng., 115, 372 (2013).
  24. 24) M. Takagi, H. Tamaki, Y. Miyamoto, R. Leonardi, S. Hanada, S. Jackowski & S. Chohnan: J. Bacteriol., 192, 233 (2010).
  25. 25) H. Tomita, Y. Yokooji, T. Ishibashi, T. Imanaka & H. Atomi: J. Bacteriol., 194, 5434 (2012).
  26. 26) T. Ishibashi, H. Tomita, Y. Yokooji, T. Morikita, B. Watanabe, J. Hiratake, A. Kishimoto, A. Kita, K. Miki, T. Imanaka et al.: Extremophiles, 16, 819 (2012).
  27. 27) W. J. Song & S. Jackowski: J. Biol. Chem., 269, 27051 (1994).
  28. 28) M. Yun, C. G. Park, J. Y. Kim, C. O. Rock, S. Jackowski & H. W. Park: J. Biol. Chem., 275, 28093 (2000).
  29. 29) C. O. Rock, H. W. Park & S. Jackowski: J. Bacteriol., 185, 3410 (2003).
  30. 30) D. S. Vallari, S. Jackowski & C. O. Rock: J. Biol. Chem., 262, 2468 (1987).
  31. 31) R. B. Calder, R. S. Williams, G. Ramaswamy, C. O. Rock, E. Campbell, S. E. Unkles, J. R. Kinghorn & S. Jackowski: J. Biol. Chem., 274, 2014 (1999).
  32. 32) R. Leonardi, Y. M. Zhang, A. Lykidis, C. O. Rock & S. Jackowski: FEBS Lett., 581, 4639 (2007).
  33. 33) C. O. Rock, M. A. Karim, Y. M. Zhang & S. Jackowski: Gene, 291, 35 (2002).
  34. 34) Y. M. Zhang, C. O. Rock & S. Jackowski: J. Biol. Chem., 280, 32594 (2005).
  35. 35) H. Tomita, T. Imanaka & H. Atomi: Mol. Microbiol., 90, 307 (2013).
  36. 36) J. E. Cronan Jr.: J. Bacteriol., 141, 1291 (1980).
  37. 37) J. M. Williamson & G. M. Brown: J. Biol. Chem., 254, 8074 (1979).
  38. 38) R. Zrenner, H. Riegler, C. R. Marquard, P. R. Lange, C. Geserick, C. E. Bartosz, C. T. Chen & R. D. Slocum: New Phytol., 183, 117 (2009).
  39. 39) W. H. White, P. L. Gunyuzlu & J. H. Toyn: J. Biol. Chem., 276, 10794 (2001).
  40. 40) W. H. White, P. L. Skatrud, Z. Xue & J. H. Toyn: Genetics, 163, 69 (2003).
  41. 41) H. Tomita, Y. Yokooji, T. Ishibashi, T. Imanaka & H. Atomi: J. Bacteriol., 196, 1222 (2014).
  42. 42) H. W. Kim, Y. Kashima, K. Ishikawa & N. Yamano: Biosci. Biotechnol. Biochem., 73, 224 (2009).
  43. 43) H. Atomi, H. Tomita, T. Ishibashi, Y. Yokooji & T. Imanaka: Biochem. Soc. Trans., 41, 427 (2013).
  44. 44) T. Kupke & W. Schwarz: J. Biol. Chem., 281, 5435 (2006).
  45. 45) J. Armengaud, B. Fernandez, V. Chaumont, F. Rollin-Genetet, S. Finet, C. Marchetti, H. Myllykallio, C. Vidaud, J. L. Pellequer, S. Gribaldo et al.: J. Biol. Chem., 278, 31078 (2003).
  46. 46) M. Nálezkova, A. de Groot, M. Graf, P. Gans & L. Blanchard: Protein Expr. Purif., 39, 296 (2005).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。