セミナー室 / 植物の生存・成長戦略から見た環境突破力
止まって働くリボソーム
新生ペプチドが司る植物の細胞内恒常性維持機構
Vol.54 No.3 Page. 191 - 197 (published date : 2016年2月20日)
概要原稿
リボソームは細胞内の状態に応答して機敏に遺伝子発現を制御している.翻訳途上の新生ペプチドが細胞内の状態を検知してリボソームの機能を一時停止させることで細胞内の恒常性維持に機能している遺伝子を概観する.
リファレンス
- 1) K. Ito, ed.: “Regulatory Nascent Peptides,” Springer, 2014.
- 2) K. Ito & S. Chiba: Annu. Rev. Biochem., 82, 171 (2013).
- 3) N. Ban, P. Nissen, J. Hansen, P. B. Moore & T. A. Steitz: Science, 289, 905 (2000).
- 4) S. Jenni & N. Ban: Curr. Opin. Struct. Biol., 13, 212 (2003).
- 5) N. Ban, R. Beckmann, J. H. Cate, J. D. Dinman, F. Dragon, S. R. Ellis, D. L. Lafontaine, L. Lindahl, A. Liljas, J. M. Lipton et al.: Curr. Opin. Struct. Biol., 24, 165 (2014).
- 6) H. Nakatogawa & K. Ito: Cell, 108, 629 (2002).
- 7) Y. Chiba, M. Ishikawa, F. Kijima, R. H. Tyson, J. Kim, A. Yamamoto, E. Nambara, T. Leustek, R. M. Wallsgrove & S. Naito: Science, 286, 1371 (1999).
- 8) Y. Chiba, R. Sakurai, M. Yoshino, K. Ominato, M. Ishikawa, H. Onouchi & S. Naito: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100, 10225 (2003).
- 9) K. Ominato, H. Akita, A. Suzuki, F. Kijima, T. Yoshino, M. Yoshino, Y. Chiba, H. Onouchi & S. Naito: J. Biol. Chem., 277, 36380 (2002).
- 10) H. Onouchi, Y. Nagami, Y. Haraguchi, M. Nakamoto, Y. Nishimura, R. Sakurai, N. Nagao, D. Kawasaki, Y. Kadokura & S. Naito: Genes Dev., 19, 1799 (2005).
- 11) N. Onoue, Y. Yamashita, N. Nagao, D. B. Goto, H. Onouchi & S. Naito: J. Biol. Chem., 286, 14903 (2011).
- 12) Y. Yamashita, Y. Kadokura, N. Sotta, T. Fujiwara, I. Takigawa, A. Satake, H. Onouchi & S. Naito: J. Biol. Chem., 289, 12693 (2014).
- 13) Y. Chiba & P. J. Green: J. Plant Biol., 52, 114 (2009).
- 14) Y. Yamashita, I. Lambein, S. Kobayashi, H. Onouchi, Y. Chiba & S. Naito: Genes Genet. Syst., 88, 241 (2013).
- 15) S. Hoshino: Wiley Interdiscip. Rev. RNA, 3, 743 (2012).
- 16) 柳谷耕太,河野憲二:化学と生物,50, 633 (2012).
- 17) A. G. von Arnim, Q. Jia & J. N. Vaughn: Plant Sci., 214, 1 (2014).
- 18) K. Wethmar: Wiley Interdiscip. Rev. RNA, 5, 765 (2014).
- 19) N. Uchiyama-Kadokura, K. Murakami, M. Takemoto, N. Koyanagi, K. Murota, S. Naito & H. Onouchi: Plant Cell Physiol., 55, 1556 (2014).
- 20) A. Raney, G. L. Law, G. J. Mize & D. R. Morris: J. Biol. Chem., 277, 5988 (2002).
- 21) J. Wei, C. Wu & M. S. Sachs: Mol. Cell. Biol., 32, 2396 (2012).
- 22) W. A. Laing, M. Martínez-Sánchez, M. A. Wright, S. M. Bulley, D. Brewster, A. P. Dare, M. Rassam, D. Wang, R. Storey, R. C. Macknight et al.: Plant Cell, 27, 772 (2015).
- 23) F. Rahmani, M. Hummel, J. Schuurmans, A. Wiese-Klinkenberg, S. Smeekens & J. Hanson: Plant Physiol., 150, 1356 (2009).
- 24) R. A. Jorgensen & A. E. Dorantes-Acosta: Front. Plant Sci., 3, 191 (2012).
- 25) H. Takahashi, A. Takahashi, S. Naito & H. Onouchi: Bioinformatics, 28, 2231 (2012).
- 26) I. Ebina, M. Takemoto-Tsutsumi, S. Watanabe, H. Koyama, Y. Endo, K. Kimata, T. Igarashi, K. Murakami, R. Kudo, A. Ohsumi et al.: Nucleic Acids Res., 43, 1562 (2015).
- 27) A. Imai, Y. Hanzawa, M. Komura, K. T. Yamamoto, Y. Komeda & T. Takahashi: Development, 133, 3575 (2006).
- 28) H. Katayama, K. Iwamoto, Y. Kariya, T. Asakawa, T. Kan, H. Fukuda & K. Ohashi-Ito: Curr. Biol., 25, 3144 (2015).
- 29) F. Alatorre-Cobos, A. Cruz-Ramírez, C. A. Hayden, C. Pérez-Torres, A. Chauvin, E. Ibarra-Laclette, E. Alva-Cortés, R. A. Jorgensen & L. Herrera-Estrella: J. Exp. Bot., 63, 5203 (2012).
- 30) K. M. Pajerowska-Mukhtar, W. Wang, Y. Tada, N. Oka, C. L. Tucker, J. P. Fonseca & X. Dong: Curr. Biol., 22, 103 (2012).
- 31) J. Lykke-Andersen & E. J. Bennett: J. Cell Biol., 204, 467 (2014).
- 32) T. Inada: Biochim. Biophys. Acta, 1829, 634 (2013).
- 33) L. R. Cruz-Vera, S. Rajagopal, C. Squires & C. Yanofsky: Mol. Cell, 19, 333 (2005).
- 34) D. H. Goldman, C. M. Kaiser, A. Milin, M. Righini, I. Tinoco Jr. & C. Bustamante: Science, 348, 457 (2015).
- 35) D. Lyumkis, S. Vinterbo, C. S. Potter & B. Carragher: J. Struct. Biol., 184, 417 (2013).
- 36) S. Chiba & K. Ito: Mol. Cell, 47, 863 (2012).
- 37) D. Sohmen, S. Chiba, N. Shimokawa-Chiba, C. A. Innis, O. Berninghausen, R. Beckmann, K. Ito & D. N. Wilson: Nat. Commun., 6, 6941 (2015).
- 38) D. N. Wilson & R. Beckmann: Curr. Opin. Struct. Biol., 21, 274 (2011).
- 39) L. Bischoff, O. Berninghausen & R. Beckmann: Cell Reports, 9, 469 (2014).
- 40) H. Ramu, A. Mankin & N. Vazquez-Laslop: Mol. Microbiol., 71, 811 (2009).
本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。