セミナー室 / 合成生物学を意識した核酸改変技術の現状と展望

ゲノム育種からエピゲノム育種へ

Vol.54 No.7 Page. 493 - 499 (published date : 2016年6月20日)
小林 一三1,2
  1. 東北大学大学院生命科学研究科
  2. 杏林大学医学部
vol54_7

 

概要原稿

「進化の単位はゲノム配列」というのが現在の生命理解のもとにある考え方であり，それに基づいてゲノム操作によるバイオテクノロジー・育種も進められている．しかし，一分子リアルタイム・シーケンサー（Pac Bio）によるメチロームの解読から，メチロームの予想外の可塑性が明らかになり，多様なエピゲノム状態こそが進化の素単位である可能性が示唆された．適応進化の主役は，DNAメチル化酵素かもしれない．そのような進化を模倣した，エピゲノムを標的にした工学と育種の可能性を探る．

リファレンス

  1. 1) Y. Asakura, H. Kojima & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 39, 9034 (2011).
  2. 2) Y. Furuta, H. Namba-Fukuyo, T. F. Shibata, T. Nishiyama, S. Shigenobu, Y. Suzuki, S. Sugano, M. Hasebe & I. Kobayashi: PLoS Genet., 10, e1004272 (2014).
  3. 3) I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 29, 3742 (2001).
  4. 4) Y. Furuta & I. Kobayashi: “Bacterial Integrative Mobile Genetic Elements,” ed. by A. Roberts & P. Mullany, Landes Bioscience, pp. 85–103, 2013.
  5. 5) T. Naito, K. Kusano & I. Kobayashi: Science, 267, 897 (1995).
  6. 6) A. Mochizuki, K. Yahara, I. Kobayashi & Y. Iwasa: Genetics, 172, 1309 (2006).
  7. 7) K. Ishikawa, E. Fukuda & I. Kobayashi: DNA Res., 17, 325 (2010).
  8. 8) K. Ishikawa, N. Handa & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 37, 3531 (2009).
  9. 9) Y. Furuta, K. Abe & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 38, 2428 (2010).
  10. 10) A. Nobusato, I. Uchiyama, S. Ohashi & I. Kobayashi: Gene, 259, 99 (2000).
  11. 11) M. Sadykov, Y. Asami, H. Niki, N. Handa, M. Itaya, M. Tanokura & I. Kobayashi: Mol. Microbiol., 48, 417 (2003).
  12. 12) Y. Furuta & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 40, 9218 (2012).
  13. 13) I. Mruk & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 42, 70 (2014).
  14. 14) I. Mruk, Y. Liu, L. Ge & I. Kobayashi: Nucleic Acids Res., 39, 5622 (2011).
  15. 15) R. M. Blumenthal & X. Cheng: “Modern Microbial Genetics,” 2nd edition, ed. by R. E. Yasbin and U. N. Streips, Wiley, pp. 177–225, 2002.
  16. 16) T. A. Clark, I. A. Murray, R. D. Morgan, A. O. Kislyuk, K. E. Spittle, M. Boitano, A. Fomenkov, R. J. Roberts & J. Korlach: Nucleic Acids Res., 40, e29 (2012).
  17. 17) Pacific Biosciencesホームページ http://www.pacificbiosciences.com/


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