セミナー室 / 合成生物学を意識した核酸改変技術の現状と展望

ゲノム再編集のための遺伝子クラスター単位の構築

Vol.54 No.10 Page. 740 - 746 (published date : 2016年9月20日)
柘植 謙爾1, 板谷 光泰2
  1. 神戸大学大学院科学技術イノベーション研究科
  2. 慶應義塾大学先端生命科学研究所
vol54_10

 

概要原稿

一連の代謝経路など機能単位をクラスター化し，これらを少しずつ導入することによりゲノムを再編集する技術についての方法論と，これを実現するための枯草菌を用いた遺伝子集積法のOGAB法を紹介する．

リファレンス

  1. 1) M. Itaya, K. Tsuge, M. Koizumi & K. Fujita: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 15971 (2005).
  2. 2) D. G. Gibson, G. A. Benders, C. Andrews-Pfannkoch, E. A. Denisova, H. Baden-Tillson, J. Zaveri, T. B. Stockwell, A. Brownley, D. W. Thomas, M. A. Algire et al.: Science, 319, 1215 (2008).
  3. 3) C. Lartigue, J. Glass, N. Alperovich, R. Pieper, P. P. Parmar, C. A. Hutchison 3rd, H. O. Smith & J. C. Venter: Science, 317, 632 (2007).
  4. 4) D. G. Gibson, J. I. Glass, C. Lartigue, V. N. Noskov, R. Y. Chuang, M. A. Algire, G. A. Benders, M. G. Montague, L. Ma, M. M. Moodie et al.: Science, 329, 52 (2010).
  5. 5) F. Jacob & J. Monod: J. Mol. Biol., 3, 318 (1961).
  6. 6) T. Nishizaki, K. Tsuge, M. Itaya, N. Doi & H. Yanagawa: Appl. Environ. Microbiol., 73, 1355 (2007).
  7. 7) A. Hiroe, K. Tsuge, C. T. Nomura, M. Itaya & T. Tsuge: Appl. Environ. Microbiol., 78, 3177 (2012).
  8. 8) K. Tsuge, K. Matsui & M. Itaya: J. Biotechnol., 129, 592 (2007).
  9. 9) S. Yang, S. C. Sleight & H. M. Sauro: Nucleic Acids Res., 41, e33 (2013).
  10. 10) S. F. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. W. Myers & D. J. Lipman: J. Mol. Biol., 215, 403 (1990).
  11. 11) M. Kanehisa & S. Goto: Nucleic Acids Res., 28, 27 (2000).
  12. 12) M. Araki, R. S. Cox 3rd, H. Makiguchi, T. Ogawa, T. Taniguchi, K. Miyaoku, M. Nakatsui, K. Y. Hara & A. Kondo: Bioinformatics, 31, 905 (2015).
  13. 13) N. Ishii, Y. Suga, A. Hagiya, H. Watanabe, H. Mori, M. Yoshino & M. Tomita: FEBS Lett., 581, 413 (2007).
  14. 14) M. Bujara, M. Schümperli, R. Pellaux, M. Heinemann & S. Panke: Nat. Biol. Chem., 7, 271 (2011).
  15. 15) G. Muskhelishvili & A. Travers: Cell. Mol. Life Sci., 70, 4555 (2013).
  16. 16) W. C. Winkler & R. R. Breaker: Annu. Rev. Microbiol., 59, 487 (2005).
  17. 17) 遠藤玉樹，杉本直己：化学，68, 47 (2013).
  18. 18) R. C. Brewster, D. L. Jones & R. Phillips: PLOS Comput. Biol., 8, e1002811 (2012).
  19. 19) H. M. Salis, E. A. Mirsky & C. A. Voigt: Nat. Biotechnol., 27, 946 (2009).
  20. 20) P. M. Sharp & W. H. Li: Nucleic Acids Res., 15, 1281 (1987).
  21. 21) G. Cannarozzi, N. N. Schraudolph, M. Faty, P. von Rohr, M. T. Friberg, A. C. Roth, P. Gonnet, G. Gonnet & Y. Barral: Cell, 141, 355 (2010).
  22. 22) K. Nakahigashi, Y. Takai, Y. Shiwa, M. Wada, M. Honma, H. Yoshikawa, M. Tomita, A. Kanai & H. Mori: BMC Genomics, 15, 1115 (2014).
  23. 23) B. F. Pfleger, D. J. Pitera, C. D. Smolke & J. D. Keasling: Nat. Biotechnol., 24, 1027 (2006).
  24. 24) A. Das, S. H. Yoon, S. H. Lee, J.-Y. Kim, D.-K. Oh & S.-W. Kim: Appl. Microbiol. Biotechnol., 77, 705 (2007).
  25. 25) K. Temme, D. Zhao & C. A. Voigt: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 7085 (2012).
  26. 26) S. Ma, N. Tang & J. Tian: Curr. Opin. Chem. Biol., 16, 260 (2012).
  27. 27) D. G. Gibson, G. A. Benders, K. C. Axelrod, J. Zaveri, M. A. Algire, M. Moodie, M. G. Montague, J. C. Venter, H. O. Smithb & C. A. Hutchison: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 20404 (2008).
  28. 28) C. Engler, R. Gruetzner, R. Kandzia & S. Marillonnet: PLoS ONE, 4, e5553 (2009).
  29. 29) D. G. Gibson, L. Young, R. Y. Chuang, J. C. Venter, C. A. Hutchison 3rd & H. O. Smith: Nat. Methods, 6, 343 (2009).
  30. 30) K. Tsuge, K. Matsui & M. Itaya: Nucleic Acids Res., 31, e133 (2003).
  31. 31) K. Tsuge, Y. Sato, Y. Kobayashi, M. Gondo, M. Hasebe, T. Togashi, M. Tomita & M. Itaya: Sci. Rep, 5, 10655 (2015).
  32. 32) C. A. Hutchison III, R. Y. Chuang, V. N. Noskov, N. Assad-Garcia, T. J. Deerinck, M. H. Ellisman, J. Gill, K. Kannan, B. J. Karas, L. Ma et al.: Science, 351, aad6253 (2016).


本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。