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デジタルRNAシークエンシング
ゲノムワイドな1分子定量法

Vol.54 No.11 Page. 787 - 788 (published date : 2016年10月20日)
城口 克之1
  1. 理化学研究所生命システム研究センター
vol54_11

 

概要原稿

網羅的に１分子の分解能でRNAの分子数を定量できるデジタルRNAシークエンシングのしくみ．各RNA（cDNA）に異なる配列をもつ分子バーコードを結合させ，増幅後にバーコードの種類の数を数えて，増幅前のRNA（cDNA）の絶対数を計数する．

リファレンス

  1. 1) A. Mortazavi, B. A. Williams, K. McCue, L. Schaeffer & B. Wold: Nat. Methods, 5, 621 (2008).
  2. 2) T. Kivioja, A. Vähärautio, K. Karlsson, M. Bonke, M. Enge, S. Linnarsson & J. Taipale: Nat. Methods, 9, 72 (2012).
  3. 3) K. Shiroguchi, T. Z. Jia, P. A. Sims & X. S. Xie: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 1347 (2012).
  4. 4) B. Vogelstein & K. W. Kinzler: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96, 9236 (1999).
  5. 5) S. Islam, A. Zeisel, S. Joost, G. La Manno, P. Zajac, M. Kasper, P. Lönnerberg & S. Linnarsson: Nat. Methods, 11, 163 (2014).
  6. 6) J. Yu, J. Xiao, X. Ren, K. Lao & X. S. Xie: Science, 311, 1600 (2006).
  7. 7) S. H. Kim, S. Iwai, S. Araki, S. Sakakihara, R. Iino & H. Noji: Lab Chip, 12, 4986 (2012).
  8. 8) 城口克之：JSI Newsletter, 24 (2), 21 (2016).


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