解説
NMRによる実践的な農業メタボロミクス研究に向けて
生産現場から生まれる成分多様性を見るために
Vol.55 No.6 Page. 392 - 399 (published date : 2017年5月20日)
概要原稿
農産物や食品に含まれる成分の多様性は、栽培現場から食卓に至るまでの環境の多様性を反映して変化し,ヒトの健康やヒトを取り巻く生態系の物質循環にも影響すると考えられる.メタボロミクスはサンプル中の成分多様性を包括的に検出するために有効な手段であり,分析機器の性能の向上や解析技術の発展に伴って,かつては曖昧な部分もあった成分多様性の概観をより高感度・高解像度で捉えることが可能になった.今後は,農業・食品産業現場の試料を対象としたメタボロミクスの需要がさらに増すと期待できる.本稿では,農業・栽培を中心に,現場関係者と連携したメタボロミクスを実施するにあたって必要と思われる確認事項を提案し,NMRによる農業メタボロミクスの実施例を紹介し,今後の展望を議論したい.
リファレンス
- 1) H. Tweeddale, L. Notley-McRobb & T. Ferenci: J. Bacteriol., 180, 5109 (1998).
- 2) J. K. Nicholson, J. C. Lindon & E. Holmes: Xenobiotica, 29, 1181 (1999).
- 3) 吉田欣史,久原とみ子,菊地 淳:ぶんせき,7, 371(2009).
- 4) 関山恭代,近山英輔,菊地 淳:ぶんせき,2, 81(2012).
- 5) 及川 彰:化学と生物,51, 615(2013).
- 6) 福先英一郎:バイオインダストリー,32(10), 46(2015).
- 7) T. Tohge & A. R. Fernie: Phytochemistry, 70, 450 (2009).
- 8) J. J. Ellinger, R. A. Chylla, E. L. Ulrich & J. L. Markley: Curr. Metabolomics, 1, 28 (2013).
- 9) M. Valentini, M. Ritota, C. Cafiero, S. Cozzolino, L. Leita & P. Sequi: Magn. Reson. Chem., 49(Suppl. 1), S121 (2011).
- 10) 関山恭代,池田成志,冨田 理:バイオインダストリー,32(10): 10(2015).
- 11) A. Yamazaki, H. Tsuchiya, H. Miyajima, T. Honma & H. Kan: Acta Hortic., 580, 177 (2002).
- 12) L. Lam, R. Soong, A. Sutrisno, R. de Visser, M. J. Simpson, H. L. Wheeler, M. Campbell, W. E. Maas, M. Fey, A. Gorissen et al.: J. Agric. Food Chem., 62, 107 (2014).
- 13) A. Gorissen, N. U. Kraut, R. de Visser, M. de Vries, H. Roelofsen & R. J. Vonk: Food Chem., 127, 192 (2011).
- 14) F. A. Brooks: Bot. Rev., 30, 263 (1964).
- 15) 池田成志,鶴丸博人,大久保 卓,岡崎和之,南澤 究:化学と生物,51, 462(2013).
- 16) S. C. M. Van Wees, S. Van der Ent & C. M. J. Pieterse: Curr. Opin. Plant Biol., 11, 443 (2008).
- 17) S. Moschen, S. Bengoa Luoni, J. A. Di Rienzo, M. P. Caro, T. Tohge, M. Watanabe, J. Hollmann, S. González, M. Rivarola, F. García-García et al.: Plant Biotechnol. J., 14, 719 (2016).
- 18) S. Bernillon, B. Biais, C. Deborde, M. Maucourt, C. Cabasson, Y. Gibon, T. H. Hansen, S. Husted, R. C. H. de Vos, R. Mumm et al.: Metabolomics, 9, 57 (2013).
- 19) S. Witt, L. Galicia, J. Lisec, J. Cairns, A. Tiessen, J. L. Araus, N. Palacios-Rojas & A. R. Fernie: Mol. Plant, 5, 401 (2012).
- 20) D. R. Guevara, M. J. Champigny, A. Tattersall, J. Dedrick, C. E. Wong, Y. Li, A. Labbe, C. L. Ping, Y. Wang, P. Nuin et al.: BMC Plant Biol., 12, 175 (2012).
- 21) F. Gozzo & F. Faoro: J. Agric. Food Chem., 61, 12473 (2013).
- 22) B. Biais, S. Bernillon, C. Deborde, C. Cabasson, D. Rolin, Y. Tadmor, J. Burger, A. A. Schaffer & A. Moing: Methods Mol. Biol., 860, 51 (2012).
- 23) N. Morrison, D. Bearden, J. G. Bundy, T. Collette, F. Currie, M. P. Davey, N. S. Haigh, D. Hancock, O. A. H. Jones, S. Rochfort et al.: Metabolomics, 3, 203 (2007).
- 24) M. R. Viant: Metabolomics, 5, 1 (2009).
- 25) S. Tomita, S. Ikeda, S. Tsuda, N. Someya, K. Asano, J. Kikuchi, E. Chikayama, H. Ono & Y. Sekiyama: Magn. Reson. Chem., 55, 120 (2017).
- 26) S. Sugiura, S. Tsuda, S. Tamiya, A. Itoh, K. Nishiwaki, N. Murakami, Y. Shibuya, M. Hirafuji & S. Nuske: Biosystems Eng., 148, 1 (2016).
- 27) 関山恭代,冨田 理,小野裕嗣,池田成志,浅野賢治,小林 晃,小林有紀:特願2015-109720(2015).
- 28) S. Ikeda, T. Tokida, H. Nakamura, H. Sakai, Y. Usui, T. Okubo, K. Tago, K. Hayashi, Y. Sekiyama, H. Ono et al.: Microbes Environ., 30, 51 (2015).
- 29) S. Tomita, T. Nemoto, Y. Matsuo, T. Shoji, F. Tanaka, H. Nakagawa, H. Ono, J. Kikuchi, M. Ohnishi-Kameyama & Y. Sekiyama: Food Chem., 174, 163 (2015).
- 30) R. Llorach, M. Garcia-Aloy, S. Tulipani, R. Vazquez-Fresno & C. Andres-Lacueva: J. Agric. Food Chem., 60, 8797 (2012).
- 31) D. S. Wishart: Trends Food Sci. Technol., 19, 482 (2008).
本文はトップページからログインをして頂くと表示されます。