1) M. Riecan, V. Paluchova, M. Lopes, K. Brejchova & O. Kuda: Pharmacol. Ther., 231, 107972 (2022).
2) M. M. Yore, I. Syed, P. M. Moraes-Vieira, T. Zhang, M. A. Herman, E. A. Homan, R. T. Patel, J. Lee, S. Chen, O. D. Peroni et al.: Cell, 159, 318 (2014).
3) R. Patel, A. Santoro, P. Hofer, D. Tan, M. Oberer, A. T. Nelson, S. Konduri, D. Siegel, R. Zechner, A. Saghatelian et al.: Nature, 606, 968 (2022).
4) S. Yan, A. Santoro, M. J. Niphakis, A. M. Pinto, C. L. Jacobs, R. Ahmad, R. M. Suciu, B. R. Fonslow, R. A. Herbst-Graham, N. Ngo et al.: Nat. Commun., 15, 4605 (2024).
5) O. Kuda, M. Brezinova, J. Silhavy, V. Landa, V. Zidek, C. Dodia, F. Kreuchwig, M. Vrbacky, L. Balas, T. Durand et al.: Diabetes, 67, 1190 (2018).
6) Y. Kurizaki, Y. Matsuzawa, M. Takahashi, H. Takeda, M. Hasegawa, M. Arita, J. Miyamoto & H. Tsugawa: Anal. Chem., 97, 7861 (2025).
2) T. Kawamura, Y. Ogawa, Y. Nakamura, S. Nakamizo, Y. Ohta, H. Nakano, K. Kabashima, I. Katayama, S. Koizumi, T. Kodama et al.: J. Clin. Invest., 122, 722 (2012).
3) Y. Inoue, S. Hasegawa, S. Ban, T. Yamada, Y. Date, H. Mizutani, S. Nakata, M. Tanaka & N. Hirashima: J. Biol. Chem., 289, 21451 (2014).
4) D. Kumari, N. Nair & R. S. Bedwal: Syst. Biol. Reprod. Med., 57, 233 (2011).
5) S. Swati, Y. Kanwar & N. Nair: International Journal of Zoological Investigations, 8, 136 (2022).
6) H. Ali, M. Ahmed, M. Baig & M. Ali: Pak. J. Med. Sci., 23, 111 (2007).
7) K. G. Sorwell & H. F. Urbanski: J. Neuroendocrinol., 25, 1062 (2013).
15) V. Khou, J. J. Anderson, G. Strange, C. Corrigan, N. Collins, D. S. Celermajer, N. Dwyer, J. Feenstra, M. Horrigan, D. Keating et al.: Respirology, 25, 863 (2020).
16) N. Gregoric, J. Sikonja, A. Janez & M. Jensterle: Diabetes Obes. Metab., 27, 519 (2025).
17) C. V. Calamari, P. Viau, M. Nichi, G. S. Martins, G. Sobral, J. H. Mangueira Dias & C. Alvarenga de Oliveira: Domest. Anim. Endocrinol., 72, 106477 (2020).
1) J. Chandrashekar, C. Kuhn, Y. Oka, D. A. Yarmolinsky, E. Hummler, N. J. Ryba & C. S. Zuker: Nature, 464, 297 (2010).
2) Y. Ishimaru, S. Okada, H. Naito, T. Nagai, A. Yasuoka, I. Matsumoto & K. Abe: Mech. Dev., 122, 1310 (2005).
3) H. Nishihara, Y. Toda, T. Kuramoto, K. Kamohara, A. Goto, K. Hoshino, S. Okada, S. Kuraku, M. Okabe & Y. Ishimaru: Nat. Ecol. Evol., 8, 111 (2024).
4) A. Itoigawa, Y. Toda, S. Kuraku & Y. Ishimaru: Curr. Biol., 34, R271 (2024).
5) X. Li, W. Li, H. Wang, J. Cao, K. Maehashi, L. Huang, A. A. Bachmanov, D. R. Reed, V. Legrand-Defretin, G. K. Beauchamp et al.: PLoS Genet., 1, 27 (2005).
6) R. Li, W. Fan, G. Tian, H. Zhu, L. He, J. Cai, Q. Huang, Q. Cai, B. Li, Y. Bai et al.: Nature, 463, 311 (2010).
1) F. Omori, H. Tajima, S. Asaoka, S. I. Nishiyama, Y. Sowa & I. Kawagishi: Biomolecules, 15, 434 (2025).
2) J. S. Parkinson, G. L. Hazelbauer & J. J. Falke: Trends Microbiol., 23, 257 (2015).
3) N. Lane: Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci., 370, 20140344 (2015).
4) J. Adler: J. Gen. Microbiol., 74, 77 (1973).
5) R. Mesibov & J. Adler: J. Bacteriol., 112, 315 (1972).
6) W. W. Tso & J. Adler: J. Bacteriol., 118, 560 (1974).
7) I. Kawagishi & S. Nishiyama: Methods Mol. Biol., 1593, 259 (2017).
8) J. F. Hess, R. B. Bourret, K. Oosawa, P. Matsumura & M. I. Simon: Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 53, 41 (1988).
9) J. F. Hess, R. B. Bourret & M. I. Simon: Nature, 336, 139 (1988).
10) J. F. Hess, K. Oosawa, N. Kaplan & M. I. Simon: Cell, 53, 79 (1988).
11) A. Buschiazzo & F. Trajtenberg: Annu. Rev. Microbiol., 73, 507 (2019).
12) E. Ishii & Y. Eguchi: Biomolecules, 11, 1524 (2021).
13) K. K. Gosink, R. Kobayashi, I. Kawagishi & C. C. Hase: J. Bacteriol., 184, 1767 (2002).
14) G. H. Wadhams & J. P. Armitage: Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 5, 1024 (2004).
15) K. L. Fredrick & J. D. Helmann: J. Bacteriol., 176, 2727 (1994).
16) T. J. Muff, R. M. Foster, P. J. Liu & G. W. Ordal: J. Bacteriol., 189, 7007 (2007).
17) H. Szurmant & G. W. Ordal: Microbiol. Mol. Biol. Rev., 68, 301 (2004).
18) S. Nishiyama, D. Suzuki, Y. Itoh, K. Suzuki, H. Tajima, A. Hyakutake, M. Homma, S. M. Butler-Wu, A. Camilli & I. Kawagishi: Infect. Immun., 80, 3170 (2012).
19) R. P. Alexander & I. B. Zhulin: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104, 2885 (2007).
20) A. Briegel, D. R. Ortega, E. I. Tocheva, K. Wuichet, Z. Li, S. Chen, A. Muller, C. V. Iancu, G. E. Murphy, M. J. Dobro et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 17181 (2009).
21) C. K. Cassidy, Z. Qin, T. Frosio, K. Gosink, Z. Yang, M. S. P. Sansom, P. J. Stansfeld, J. S. Parkinson & P. Zhang: MBio, 14, 00793-23 (2023).
22) A. I. M. Salah Ud-Din & A. Roujeinikova: Cell. Mol. Life Sci., 74, 3293 (2017).
23) K. Maeda, Y. Imae, J. I. Shioi & F. Oosawa: J. Bacteriol., 127, 1039 (1976).
24) S. Nishiyama, I. N. Maruyama, M. Homma & I. Kawagishi: J. Mol. Biol., 286, 1275 (1999).
25) S. Nishiyama, T. Umemura, T. Nara, M. Homma & I. Kawagishi: Mol. Microbiol., 32, 357 (1999).
26) D. R. Repaske & J. Adler: J. Bacteriol., 145, 1196 (1981).
27) M. D. Manson, W. Boos, P. J. Bassford Jr. & B. A. Rasmussen: J. Biol. Chem., 260, 9727 (1985).
28) A. R. Muok, F. A. Olsthoorn & A. Briegel: Annu. Rev. Microbiol., 78, 169 (2024).
29) S. I. Bibikov, R. Biran, K. E. Rudd & J. S. Parkinson: J. Bacteriol., 179, 4075 (1997).
30) A. Rebbapragada, M. S. Johnson, G. P. Harding, A. J. Zuccarelli, H. M. Fletcher, I. B. Zhulin & B. L. Taylor: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 10541 (1997).
31) E. N. Kort, M. F. Goy, S. H. Larsen & J. Adler: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 72, 3939 (1975).
32) H. C. Berg: “Random Walks in Biology,” Princeton University Press, 1983.
33) H. C. Berg & D. A. Brown: Nature, 239, 500 (1972).
34) H. C. Berg & D. A. Brown: Antibiot. Chemother., 19, 55 (1974).
35) H. C. Berg & P. M. Tedesco: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 72, 3235 (1975).
36) M. R. Alley, J. R. Maddock & L. Shapiro: Genes Dev., 6, 825 (1992).
37) J. R. Maddock & L. Shapiro: Science, 259, 1717 (1993).
38) J. S. Parkinson & D. F. Blair: Science, 259, 1701 (1993).
39) H. Irieda, M. Homma, M. Homma & I. Kawagishi: J. Biol. Chem., 281, 23880 (2006).
40) T. S. Shimizu, N. Le Novere, M. D. Levin, A. J. Beavil, B. J. Sutton & D. Bray: Nat. Cell Biol., 2, 792 (2000).
41) L. N. Lin, J. Li, J. F. Brandts & R. M. Weis: Biochemistry, 33, 6564 (1994).
42) J. J. Falke & G. L. Hazelbauer: Trends Biochem. Sci., 26, 257 (2001).
43) H. Tajima, K. Imada, M. Sakuma, F. Hattori, T. Nara, N. Kamo, M. Homma & I. Kawagishi: J. Biol. Chem., 286, 42200 (2011).
44) S. Nishiyama, Y. Takahashi, K. Yamamoto, D. Suzuki, Y. Itoh, K. Sumita, Y. Uchida, M. Homma, K. Imada & I. Kawagishi: Sci. Rep., 6, 20866 (2016).
45) S. H. Lee, S. M. Butler & A. Camilli: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 6889 (2001).
46) V. Anantharaman & L. Aravind: Trends Biochem. Sci., 25, 535 (2000).
47) M. A. Matilla, D. Martin-Mora, J. A. Gavira & T. Krell: Microbiol. Mol. Biol. Rev., 85, e00151-20 (2021).
48) A. Hyakutake, M. Homma, M. J. Austin, M. A. Boin, C. C. Hase & I. Kawagishi: J. Bacteriol., 187, 8403 (2005).
49) S. M. Butler & A. Camilli: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 5018 (2004).
50) J. Schmidt, M. Musken, T. Becker, Z. Magnowska, D. Bertinetti, S. Moller, B. Zimmermann, F. W. Herberg, L. Jansch & S. Haussler: PLoS One, 6, e18184 (2011).
51) J. C. Fong & F. H. Yildiz: J. Bacteriol., 190, 6646 (2008).
52) J. W. Hickman, D. F. Tifrea & C. S. Harwood: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 14422 (2005).
1) P. R. Rich & A. Marechal: Comp. Biophys., 8, 72 (2012).
2) J. Hirst: Annu. Rev. Biochem., 82, 551 (2013).
3) L. A. Sazanov: Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 16, 375 (2015).
4) R. Baradaran, J. M. Berrisford, G. S. Minhas & L. A. Sazanov: Nature, 494, 443 (2013).
5) V. Zickermann, C. Wirth, H. Nasiri, K. Siegmund, H. Schwalbe, C. Hunte & U. Brandt: Science, 347, 44 (2015).
6) D. Kampjut & L. A. Sazanov: Science, 370, eabc4209 (2020).
7) I. Chung, J. J. Wright, H. R. Bridges, B. S. Ivanov, O. Biner, C. S. Pereira, G. M. Arantes & J. Hirst: Nat. Commun., 13, 2758 (2022).
8) V. Sharma, G. Belevich, A. P. Gamiz-Hernandez, T. Rog, I. Vattulainen, M. L. Verkhovskaya, M. Wikstrom, G. Hummer & V. R. I. Kaila: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 112, 11571 (2015).
9) O. Haapanen & V. Sharma: Curr. Opin. Electrochem., 29, 100741 (2021).
10) A. Cabrera-Orefice, E. G. Yoga, C. Wirth, K. Siegmund, K. Zwicker, S. Guerrero-Castillo, V. Zickermann, C. Hunte & U. Brandt: Nat. Commun., 9, 4500 (2018).
11) K. Okuda, M. Murai, S. Aburaya, W. Aoki & H. Miyoshi: Biochemistry, 55, 470 (2016).
12) H. Ueno, K. Yasuda, N. Hamaguchi-Suzuki, R. Marui, N. Adachi, T. Senda, T. Murata & H. Noji: Nat. Commun., 16, 5410 (2025).
13) M. Murai: Biosci. Biotechnol. Biochem., 84, 1322 (2020).
14) J. R. Molina, Y. Sun, M. Protopopova, S. Gera, M. Bandi, C. Bristow, T. McAfoos, P. Morlacchi, J. Ackroyd, A. A. Agip et al.: Nat. Med., 24, 1036 (2018).
15) A. Tsuji, T. Akao, T. Masuya, M. Murai & H. Miyoshi: J. Biol. Chem., 295, 7481 (2020).
16) I. Chung, R. Serreli, J. B. Cross, M. E. Di Francesco, J. R. Marszalek & J. Hirst: Sci. Adv., 7, eabg4000 (2021).
17) H. R. Bridges, A. J. Y. Jones, M. N. Pollak & J. Hirst: Biochem. J., 462, 475 (2014).
18) H. R. Bridges, J. N. Blaza, Z. Yin, I. Chung, M. N. Pollak & J. Hirst: Science, 379, 351 (2023).
19) Z. He, F. Teng, Y. Yang, R. Guo, M. Wu, F. Han, H. Tian, J. Wang, Y. Hu, Y. Jiang et al.: Nat. Struct. Mol. Biol., 33, 100 (2026).
20) Y. Zhou, J. Zou, J. Xu, Y. Zhou, X. Cen & Y. Zhao: Eur. J. Med. Chem., 251, 115219 (2023).
21) J. N. Blaza, H. R. Bridges, D. Aragao, E. A. Dunn, A. Heikal, G. M. Cook, Y. Nakatani & J. Hirst: Sci. Rep., 7, 40165 (2017).
22) A. Sanz, M. Soikkeli, M. Portero-Otin, A. Wilson, E. Kemppainen, G. McIlroy, S. Ellila, K. K. Kemppainen, T. Tuomela, M. Lakanmaa et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 9105 (2010).
23) O. Juarez & B. Barquera: Biochim. Biophys. Acta Bioenerg., 1817, 1823 (2012).
24) T. Ito, M. Murai, S. Ninokura, Y. Kitazumi, K. G. Mezic, B. F. Cress, M. A. G. Koffas, J. E. Morgan, B. Barquera & H. Miyoshi: J. Biol. Chem., 292, 7727 (2017).
25) J. Kishikawa, M. Ishikawa, T. Masuya, M. Murai, Y. Kitazumi, N. L. Butler, T. Kato, B. Barquera & H. Miyoshi: Nat. Commun., 13, 4082 (2022).
26) M. Ishikawa-Fukuda, T. Seki, J. Kishikawa, T. Masuya, K. Okazaki, T. Kato, B. Barquera, H. Miyoshi & M. Murai: Nat. Commun., 17, 1394 (2026).
1) C. Auger & S. Kajimura: Annu. Rev. Pathol., 18, 71 (2023).
2) T. Yoneshiro, M. Matsushita, J. Sakai & M. Saito: J. Physiol. Anthropol., 44, 11 (2025).
3) A. M. Cypess, B. Cannon, J. Nedergaard, L. Kazak, D. C. Chang, J. Krakoff, Y. H. Tseng, C. Scheele, J. Boucher, N. Petrovic et al.: Cell Metab., 37, 12 (2025).
4) B. J. Lipworth: Br. J. Clin. Pharmacol., 42, 291 (1996).
5) 米代武司,梶村慎吾:実験医学,43, 63 (2024).
6) A. R. P. Verkerke & S. Kajimura: Mol. Cell, 85, 3895 (2025).
7) K. Ikeda, Q. Kang, T. Yoneshiro, J. P. Camporez, H. Maki, M. Homma, K. Shinoda, Y. Chen, X. Lu, P. Maretich et al.: Nat. Med., 23, 1454 (2017).
8) T. Wang, A. K. Sharma, C. Wu, C. I. Maushart, A. Ghosh, W. Yang, P. Stefanicka, Z. Kovanicova, J. Ukropec, J. Zhang et al.: Cell Metab., 36, 2130 (2024).
9) A. Vargas-Castillo, Y. Sun, A. L. Smythers, L. Grauvogel, P. A. Dumesic, M. P. Emont, L. T. Tsai, E. D. Rosen, N. W. Zammit, S. M. Shaffer et al.: Cell Metab., 36, 2146 (2024).
10) M. Saito, Y. Okamatsu-Ogura, M. Matsushita, K. Watanabe, T. Yoneshiro, J. Nio-Kobayashi, T. Iwanaga, M. Miyagawa, T. Kameya, K. Nakada et al.: Diabetes, 58, 1526 (2009).
11) B. P. Leitner, S. Huang, R. J. Brychta, C. J. Duckworth, A. S. Baskin, S. McGehee, I. Tal, W. Dieckmann, G. Gupta, G. M. Kolodny et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 114, 8649 (2017).
12) 米代武司:肥満研究,30, 77 (2024).
13) T. Yoneshiro, S. Aita, M. Matsushita, T. Kayahara, T. Kameya, Y. Kawai, T. Iwanaga & M. Saito: J. Clin. Invest., 123, 3404 (2013).
14) T. Yoneshiro, S. Aita, M. Matsushita, Y. Okamatsu-Ogura, T. Kameya, Y. Kawai, M. Miyagawa, M. Tsujisaki & M. Saito: Obesity (Silver Spring), 19, 1755 (2011).
15) M. Matsushita, T. Yoneshiro, S. Aita, T. Kameya, H. Sugie & M. Saito: Int. J. Obes. (Lond.), 38, 812 (2014).
16) T. Becher, S. Palanisamy, D. J. Kramer, M. Eljalby, S. J. Marx, A. G. Wibmer, S. D. Butler, C. S. Jiang, R. Vaughan, H. Schoder et al.: Nat. Med., 27, 58 (2021).
17) F. Villarroya, R. Cereijo, J. Villarroya & M. Giralt: Nat. Rev. Endocrinol., 13, 26 (2017).
18) C. H. Sponton, T. Hosono, J. Taura, M. P. Jedrychowski, T. Yoneshiro, Q. Wang, M. Takahashi, Y. Matsui, K. Ikeda, Y. Oguri et al.: EMBO Rep., 21, e49828 (2020).
19) K. Ziqubu, P. V. Dludla, S. E. Mabhida, B. U. Jack, S. Keipert, M. Jastroch & S. E. Mazibuko-Mbeje: Metabolism, 150, 155709 (2024).
20) T. Yoneshiro, Q. Wang, K. Tajima, M. Matsushita, H. Maki, K. Igarashi, Z. Dai, P. J. White, R. W. McGarrah, O. R. Ilkayeva et al.: Nature, 572, 614 (2019).
21) A. R. P. Verkerke, D. Wang, N. Yoshida, Z. H. Taxin, X. Shi, S. Zheng, Y. Li, C. Auger, S. Oikawa, J. S. Yook et al.: Cell, 187, 2359 (2024).
22) 米代武司,梶村慎吾:実験医学,43, 68 (2024).
23) T. Yoneshiro, T. Ogawa, N. Okamoto, M. Matsushita, S. Aita, T. Kameya, Y. Kawai, T. Iwanaga & M. Saito: Int. J. Obes. (Lond.), 37, 993 (2013).
24) Y. Ishida, M. Matsushita, T. Yoneshiro, M. Saito, S. Fuse, T. Hamaoka, M. Kuroiwa, R. Tanaka, Y. Kurosawa, T. Nishimura et al.: Int. J. Obes. (Lond.), 48, 1110 (2024).
25) K. Nakayama, H. Miyashita, Y. Yanagisawa & S. Iwamoto: PLoS One, 8, e74720 (2013).
26) T. Nishimura, T. Katsumura, M. Motoi, H. Oota & S. Watanuki: Sci. Rep., 7, 5570 (2017).
27) H. Takahashi, G. Yang, T. Yoneshiro, Y. Abe, R. Ito, C. Yang, J. Nakazono, M. Okamoto-Katsuyama, A. Uchida, M. Arai et al.: Nat. Commun., 13, 5715 (2022).
28) H. Takahashi, R. Ito, Y. Matsumura & J. Sakai: BioEssays, 46, e2300084 (2024).
29) R. Ito, S. Xie, M. Tumenjargal, Y. Sugahara, C. Yang, H. Takahashi, M. Arai, S. I. Inoue, A. Uchida, K. Nakano et al.: iScience, 27, 109398 (2024).
30) T. Yoneshiro, M. Matsushita, S. Fuse-Hamaoka, M. Kuroiwa, Y. Kurosawa, Y. Yamada, M. Arai, Y. Wei, M. Iida, K. Kuma et al.: Nat. Metab., 7, 778 (2025).
31) T. Hamaoka, S. Nirengi, S. Fuse, S. Amagasa, R. Kime, M. Kuroiwa, T. Endo, N. Sakane, M. Matsushita, M. Saito et al.: Front. Endocrinol. (Lausanne), 11, 261 (2020).
32) W. Sun, H. Dong, A. S. Becker, D. H. Dapito, S. Modica, G. Grandl, L. Opitz, V. Efthymiou, L. G. Straub, G. Sarker et al.: Nat. Med., 24, 1372 (2018).