1) Y. Shigeri, M. Nakata, H. Y. Kubota, N. Tomari, Y. Yamamoto, K. Uegaki, Y. Haramoto, C. Bumb, Y. Tanaka, T. Kinumi et al.: Zool. Sci., 38, 8 (2021).
2) M. Schor, J. L. Reid, C. E. MacPhee & N. R. Stanley-Wall: Trends Biochem. Sci., 41, 610 (2016).
3) M. Oke, R. T. Ching, L. G. Carter, K. A. Johnson, H. Liu, S. A. McMahon, M. F. White, C. Bloch Jr., C. H. Botting, M. A. Walsh et al.: Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 47, 7853 (2008).
4) S. Brozio, E. M. O'Shaughnessy, S. Woods, I. Hall-Barrientos, P. E. Martin, M. W. Kennedy, D. A. Lamprou & P. A. Hoskisson: R. Soc. Open Sci., 8, 210048 (2021).
1) C. Yokoyama, X. Wang, M. R. Briggs, A. Admon, J. Wu, X. Hua, J. L. Goldstein & M. S. Brown: Cell, 75, 187 (1993).
2) X. Wang, R. Sato, M. S. Brown, X. Hua & J. L. Goldstein: Cell, 77, 53 (1994).
3) H. Shimano, J. D. Horton, I. Shimomura, R. E. Hammer, M. S. Brown & J. L. Goldstein: J. Clin. Invest., 99, 846 (1997).
4) J. L. Goldstein, R. A. DeBose-Boyd & M. S. Brown: Cell, 124, 35 (2006).
5) J. Inoue & R. Sato: Biomol. Concepts, 4, 417 (2013).
6) P. Ferre, F. Phan & F. Foufelle: Biochem. J., 478, 3723 (2021).
7) S. Miyata, M. Kodaka, A. Kikuchi, Y. Matsunaga, K. Shoji, Y. C. Kuan, M. Iwase, K. Takeda, R. Katsuta, K. Ishigami et al.: Sci. Rep., 12, 8715 (2022).
8) J. Inoue, S. Miyata, M. Shimizu & R. Sato: Biosci. Biotechnol. Biochem., 82, 1591 (2018).
9) S. Miyata, J. Inoue, M. Shimizu & R. Sato: J. Biol. Chem., 290, 20565 (2015).
10) S. Kamisuki, Q. Mao, L. Abu-Elheiga, Z. Gu, A. Kugimiya, Y. Kwon, T. Shinohara, Y. Kawazoe, S. Sato, K. Asakura et al.: Chem. Biol., 16, 882 (2009).
11) J. J. Tang, J. G. Li, W. Qi, W. W. Qiu, P. S. Li, B. L. Li & B. L. Song: Cell Metab., 13, 44 (2011).
12) Y. Zhang, C. Wan, Z. Song, W. Meng, S. Wang & Z. Lan: Biosci. Biotechnol. Biochem., 86, 1220 (2022).
13) A. Pandyra, P. J. Mullen, M. Kalkat, R. Yu, J. T. Pong, Z. Li, S. Trudel, K. S. Lang, M. D. Minden, A. D. Schimmer et al.: Cancer Res., 74, 4772 (2014).
14) J. Longo, P. J. Mullen, R. Yu, J. E. Leeuwen, M. Masoomian, D. T. S. Woon, Y. Wang, E. X. Chen, R. J. Hamilton, J. M. Sweet et al.: Mol. Metab., 25, 119 (2019).
15) S. Miyata, J. Inoue, M. Shimizu & R. Sato: FEBS Lett., 586, 1778 (2012).
16) S. Miyata, J. Inoue, M. Shimizu & R. Sato: Biosci. Biotechnol. Biochem., 80, 1006 (2016).
17) X. Z. Zou, J. F. Hao & X. H. Zhou: Front. Oncol., 11, 796152 (2021).
18) D. B. Ma, X. Y. Liu, H. Jia, Y. Zhang, Q. Jiang, H. Sun, X. Li, F. Sun, Y. Chai, F. Feng et al.: Front. Pharmacol., 13, 895744 (2022).
19) T. Furuta, Y. Mizukami, L. Asano, K. Kotake, S. Ziegler, H. Yoshida, M. Watanabe, S. Sato, H. Waldmann, M. Nishikawa et al.: ACS Chem. Biol., 14, 1860 (2019).
20) F. Kawagoe, A. Mendoza, Y. Hayata, L. Asano, K. Kotake, S. Mototani, S. Kawamura, S. Kurosaki, Y. Akagi, Y. Takemoto et al.: J. Med. Chem., 64, 5689 (2021).
21) Z. G. Zheng, S. T. Zhu, H. M. Cheng, X. Zhang, G. Cheng, P. M. Thu, S. P. Wang, H. J. Li, M. Ding, L. Qiang et al.: Autophagy, 17, 1592 (2021).
22) M. Iwase, K. Watanabe, M. Shimizu, T. Suzuki, Y. Yamamoto, J. Inoue & R. Sato: Biosci. Biotechnol. Biochem., 83, 1740 (2019).
23) Y. Chen, J. Wang, Y. Wang, P. Wang, Z. Zhou, R. Wu, Q. Xu, H. You, Y. Liu, L. Wang et al.: Nat. Commun., 13, 246 (2022).
1) N. D. Rawlings, A. J. Barrett, P. D. Thomas, X. Huang, A. Bateman & R. D. Finn: Nucleic Acids Res., 46, D624 (2018).
2) W. Ogasawara, G. Kobayashi, H. Okada & Y. Morikawa: J. Bacteriol., 178, 6288 (1996).
3) W. Ogasawara, K. Ochiai, K. Ando, K. Yano, M. Yamasaki, H. Okada & Y. Morikawa: J. Bacteriol., 178, 1283 (1996).
4) A. Banbula, J. Yen, A. Oleksy, P. Mak, M. Bugno, J. Travis & J. Potempa: J. Biol. Chem., 276, 6299 (2001).
5) Y. Ohara-Nemoto, Y. Shimoyama, S. Kimura, A. Kon, H. Haraga, T. Ono, T. K. Nemoto: J. Biol. Chem., 286, 38115 (2011).
6) S. M. A. Rouf, Y. Ohara-Nemoto, T. Hoshino, T. Fujiwara, T. Ono & T. K. Nemoto: Biochimie, 95, 824 (2013).
7) Y. Sakamoto, Y. Suzuki, I. Iizuka, C. Tateoka, S. Roppongi, M. Fujimoto, K. Inaka, H. Tanaka, M. Yamada, K. Ohta et al.: Sci. Rep., 5, Articlr number 11151 (2015).
8) S. M. A. Rouf, Y. Ohara-nemoto, T. Ono, Y. Shimoyama, S. Kimura, K. Takayuki, T. K. Nemoto & K. Takayuki: FEBS Open Bio, 3, 177 (2013).
9) A. Nakamura, Y. Suzuki, Y. Sakamoto, S. Roppongi, C. Kushibiki, N. Yonezawa, M. Takahashi, Y. Shida, H. Gouda, T. Nonaka et al.: Sci. Rep., 11, Articlr number 7929 (2021).
10) Y. Suzuki, Y. Sakamoto, N. Tanaka, H. Okada, Y. Morikawa & W. Ogasawara: Sci. Rep., 4, Articlr number 4292 (2014).
11) Y. Sakamoto, Y. Suzuki, I. Iizuka, C. Tateoka, S. Roppongi, H. Okada, T. Nonaka, Y. Morikawa, K. T. Nakamura, W. Ogasawara et al.: Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun., 70, 221 (2014).
12) Y. Sakamoto, Y. Suzuki, I. Iizuka, C. Tateoka, S. Roppongi, M. Fujimoto, K. Inaka, H. Tanaka, M. Masaki, K. Ohta et al.: Sci. Rep., 4, Articlr number 4977 (2014).
13) T. K. Nemoto & Y. Ohara-Nemoto: Jpn. Dent. Sci. Rev., 52, 22 (2016).
14) S. G. Dashper, L. Brownfield, N. Slakeski, P. S. Zilm, A. H. Rogers & E. C. Reynolds: J. Bacteriol., 183, 4142 (2001).
15) K. E. Nelson, R. D. Fleischmann, R. T. DeBoy, I. T. Paulsen, D. E. Fouts, J. A. Eisen, S. C. Daugherty, R. J. Dodson, A. S. Durkin, M. Gwinn et al.: J. Bacteriol., 185, 5591 (2003).
16) Y. Sakamoto, Y. Suzuki, A. Nakamura, Y. Watanabe, M. Sekiya, S. Roppongi, C. Kushibiki, I. Iizuka, O. Tani, H. Sakashita et al.: Sci. Rep., 9, Articlr number 13587 (2019).
2) K. J. van Wijk & S. Baginsky: Plant Physiol., 155, 1578 (2011).
3) S. Greiner, H. Golczyk, I. Malinova, T. Pellizzer, R. Bock, T. Borner & R. G. Herrmann: Plant J., 102, 730 (2020).
4) T. Takami, N. Ohnishi, Y. Kurita, S. Iwamura, M. Ohnishi, M. Kusaba, T. Mimura & W. Sakamoto: Nat. Plants, 4, 1044 (2018).
5) Z. Svab, P. Hajdukiewicz & P. Maliga: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 8526 (1990).
6) Q. Rascon-Cruz, C. D. Gonzalez-Barriga, B. F. Iglesias-Figueroa, J. C. Trejo-Munoz, T. Siqueiros-Cendon, S. R. Sinagawa-Garcia, S. Arevalo-Gallegos & E. A. Espinoza-Sanchez: Electron. J. Biotechnol., 51, 95 (2021).
7) T. Yoshizumi, K. Oikawa, J. A. Chuah, Y. Kodama & K. Numata: Biomacromolecules, 19, 1582 (2018).
8) M. Odahara, Y. Horii, J. Itami, K. Watanabe & K. Numata: Front. Plant Sci., 13, 989310 (2022).
9) S.-Y. Kwak, T. T. S. Lew, C. J. Sweeney, V. B. Koman, M. H. Wong, K. Bohmert-Tatarev, K. D. Snell, J. S. Seo, N.-H. Chua & M. S. Strano: Nat. Nanotechnol., 14, 447 (2019).
10) A. Jakubiec, A. Sarokina, S. Choinard, F. Vlad, I. Malcuit & A. P. Sorokin: Nat. Plants, 7, 932 (2021).
11) J. M. Staub & P. Maliga: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 7468 (1994).
12) A. Occhialini, A. C. Pfotenhauer, L. Li, S. A. Harbison, A. J. Lail, J. N. Burris, C. Piasecki, A. A. Piatek, H. Daniell, C. N. Stewart Jr. et al.: Plant Biotechnol. J., 20, 360 (2022).
13) I. Nakazato, M. Okuno, H. Yamamoto, Y. Tamura, T. Itoh, T. Shikanai, H. Takanashi, N. Tsutsumi & S.-I. Arimura: Nat. Plants, 7, 906 (2021).
14) I. Nakazato, M. Okuno, T. Itoh, N. Tsutsumi & S.-I. Arimura: Plant J., 115, 1151 (2023).
15) B.-C. Kang, S. J. Bae, S. Lee, J. S. Lee, A. Kim, H. Lee, G. Baek, H. Seo, J. Kim & J.-S. Kim: Nat. Plants, 7, 899 (2021).
16) R. Li, S. N. Char, B. Liu, H. Liu, X. Li & B. Yang: Mol. Plant, 14, 1412 (2021).
17) H. Daniell, C. S. Lin, M. Yu & W.-J. Chang: Genome Biol., 17, 134 (2016).
18) N. Ahmad, F. Michoux, A. G. Lossl & P. J. Nixon: J. Exp. Bot., 67, 5945 (2016).
19) I. Khan & H. Daniell: Curr. Opin. Colloid Interface Sci., 54, 101452 (2021).
20) P. S. Lakshmi, D. Verma, X. Yang, B. Lloyd & H. Daniell: PLoS One, 8, e54708 (2013).
21) H. Daniell, V. Rai & Y. Xiao: Plant Biotechnol. J., 17, 1357 (2019).
22) H. Daniell, R. Singh, V. Mangu, S. K. Nair, G. Wakade & N. Balashova: Biomaterials, 298, 122142 (2023).
23) H. Daniell, V. Mangu, B. Yakubov, J. Park, P. Habibi, Y. Shi, P. A. Gonnella, A. Fisher, T. Cook, L. Zeng et al.: Biomaterials, 233, 119750 (2020).
24) H. Daniell, S. K. Nair, N. Esmaeili, G. Wakade, N. Shahid, P. K. Ganesan, M. R. Islam, A. Shepley-McTaggart, S. Feng, E. N. Gary et al.: Mol. Ther., 30, 1966 (2022).
25) H. Daniell, S. K. Nair, H. Guan, Y. Guo, R. J. Kulchar, M. D. T. Torres, M. Shahed-Al-Mahmud, G. Wakade, Y.-M. Liu, A. D. Marques et al.: Biomaterials, 288, 121671 (2022).
26) Y. Nakahira, K. Mizuno, H. Yamashita, M. Tsuchikura, K. Takeuchi, T. Shiina & H. Kawakami: Front Plant Sci., 12, 717952 (2021).
27) T. Hasunuma, S. Miyazawa, S. Yoshimura, Y. Shinzaki, K. Tomizawa, K. Shindo, S.-K. Choi, N. Misawa & C. Miyake: Plant J., 55, 857 (2008).
28) P. Fuentes, F. Zhou, A. Erban, D. Karcher, J. Kopka & R. Bock: eLife, 5, e13664 (2016).
29) K. Bohmert-Tatarev, S. McAvoy, S. Daughtry, O. P. Peoples & K. D. Snell: Plant Physiol., 155, 1690 (2011).
30) A. Krichevsky, B. Meyers, A. Vainstein, P. Maliga & V. Citovsky: PLoS One, 5, e15461 (2010).
31) E. A. Mudd, P. Madesis, E. M. Avila & A. Day: Methods Mol. Biol., 1132, 107 (2014).
32) T. Tungsuchat-Huang & P. Maliga: Methods Mol. Biol., 1132, 205 (2014).
1) B. S. McEwen: Ann. N. Y. Acad. Sci., 840, 33 (1998).
2) K. Itoh, J. Mimura & M. Yamamoto: Antioxid. Redox Signal., 13, 1665 (2010).
3) K. Itoh, P. Ye, T. Matsumiya, K. Tanji & T. Ozaki: J. Clin. Biochem. Nutr., 56, 91 (2015).
4) L. Ibrahim, C. Stanton, K. Nutsch, T. Nguyen, C. Li-Ma, Y. Ko, G. C. Lander, R. L. Wiseman & M. J. Bollong: Cell Chem. Biol., 30, 1295 (2023).
5) G. Tong, Y. Chen, X. Chen, J. Fan, K. Zhu, Z. Hu, S. Li, J. Zhu, J. Feng, Z. Wu et al.: Nat. Commun., 14, 6107 (2023).
6) L. Zhu, S. He, L. Huang, D. Ren, T. Nie, K. Tao, L. Xia, F. Lu, Z. Mao & Q. Yang: Aging Cell, 21, e13616 (2022).
7) Y. Wu, Y. W. Lim, D. A. Stroud, N. Martel, T. E. Hall, H. P. Lo, C. Ferguson, M. T. Ryan, K. A. McMahon & R. G. Parton: Dev. Cell, 58, 376 (2023).
8) K. Hashimoto, A. N. Simmons, R. Kajino-Sakamoto, Y. Tsuji & J. Ninomiya-Tsuji: Antioxid. Redox Signal., 25, 953 (2016).
9) M. Yamada, M. Iwata, E. Warabi, H. Oishi, V. A. Lira & M. Okutsu: FASEB J., 33, 8022 (2019).
10) D. H. Lee, J. S. Park, Y. S. Lee, J. Han, D. K. Lee, S. W. Kwon, D. H. Han, Y. H. Lee & S. H. Bae: Autophagy, 16, 1949 (2020).
11) L. C. Bailey-Downs, M. Mitschelen, D. Sosnowska, P. Toth, J. T. Pinto, P. Ballabh, M. N. Valcarcel-Ares, J. Farley, A. Koller, J. C. Henthorn et al.: J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci., 67, 313 (2012).
12) S. Shimizu, J. Mimura, T. Hasegawa, E. Shimizu, S. Imoto, M. Tsushima, S. Kasai, H. Yamazaki, Y. Ushida, H. Suganuma et al.: PLoS One, 15, e0236834 (2020).
13) Y. Honkura, H. Matsuo, S. Murakami, M. Sakiyama, K. Mizutari, A. Shiotani, M. Yamamoto, I. Morita, N. Shinomiya, T. Kawase et al.: Sci. Rep., 6, 19329 (2016).
14) M. Tsushima, J. Liu, W. Hirao, H. Yamazaki, H. Tomita & K. Itoh: Arch. Pharm. Res., 43, 286 (2020).
15) F. J. Schopfer & N. K. H. Khoo: Trends Endocrinol. Metab., 30, 505 (2019).
16) J. Blay-Cadanet, A. Pedersen & C. K. Holm: Front. Immunol., 12, 635738 (2021).
17) M. J. Bollong, G. Lee, J. S. Coukos, H. Yun, C. Zambaldo, J. W. Chang, E. N. Chin, I. Ahmad, A. K. Chatterjee, L. L. Lairson et al.: Nature, 562, 600 (2018).
18) A. Fiore, L. Zeitler, M. Russier, A. Gross, M. K. Hiller, J. L. Parker, L. Stier, T. Kocher, S. Newstead & P. J. Murray: Mol. Cell, 82, 920 (2022).
19) R. Gacesa, W. C. Dunlap, D. J. Barlow, R. A. Laskowski & P. F. Long: Sci. Rep., 6, 27740 (2016).
20) T. K. Blackwell, M. J. Steinbaugh, J. M. Hourihan, C. Y. Ewald & M. Isik: Free Radic. Biol. Med., 88(Pt B), 290 (2015).
21) G. M. Castiglione, Z. Xu, L. Zhou & E. J. Duh: Nat. Commun., 11, 2476 (2020).
22) K. Yumimoto, S. Sugiyama, S. Motomura, D. Takahashi & K. I. Nakayama: Sci. Adv., 9, eadg2379 (2023).
23) D. Harman: J. Gerontol., 11, 298 (1956).
24) G. A. Shilovsky: Biochemistry (Mosc.), 87, 70 (2022).
25) L. C. D. Pomatto, T. Dill, B. Carboneau, S. Levan, J. Kato, E. M. Mercken, K. J. Pearson, M. Bernier & R. de Cabo: Free Radic. Biol. Med., 152, 650 (2020).
26) K. J. Pearson, K. N. Lewis, N. L. Price, J. W. Chang, E. Perez, M. V. Cascajo, K. L. Tamashiro, S. Poosala, A. Csiszar, Z. Ungvari et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 2325 (2008).
27) K. N. Lewis, E. Wason, Y. H. Edrey, D. M. Kristan, E. Nevo & R. Buffenstein: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 112, 3722 (2015).
28) N. Kubben, W. Zhang, L. Wang, T. C. Voss, J. Yang, J. Qu, G. H. Liu & T. Misteli: Cell, 165, 1361 (2016).
29) C. K. Ewe, G. Alok & J. H. Rothman: Dev. Biol., 471, 34 (2021).
30) S. Kasai, S. Shimizu, Y. Tatara, J. Mimura & K. Itoh: Biomolecules, 10, 320 (2020).
31) A. Kim, J. H. Koo, J. M. Lee, M. S. Joo, T. H. Kim, H. Kim, D. W. Jun & S. G. Kim: FASEB J., 36, e22170 (2022).
32) A. Kanwal, V. B. Pillai, S. Samant, M. Gupta & M. P. Gupta: FASEB J., 33, 10872 (2019).
33) A. P. Gureev, E. A. Shaforostova & V. N. Popov: Front. Genet., 10, 435 (2019).
34) E. Balsa, E. A. Perry, C. F. Bennett, M. Jedrychowski, S. P. Gygi, J. G. Doench & P. Puigserver: Nat. Commun., 11, 2714 (2020).
35) K. Ameri & A. L. Harris: Int. J. Biochem. Cell Biol., 40, 14 (2008).
36) S. Kasai, H. Yamazaki, K. Tanji, M. J. Engler, T. Matsumiya & K. Itoh: J. Clin. Biochem. Nutr., 64, 1 (2019).
37) X. Guo, G. Aviles, Y. Liu, R. Tian, B. A. Unger, Y. T. Lin, A. P. Wiita, K. Xu, M. A. Correia & M. Kampmann: Nature, 579, 427 (2020).
38) E. Fessler, E. M. Eckl, S. Schmitt, I. A. Mancilla, M. F. Meyer-Bender, M. Hanf, J. Philippou-Massier, S. Krebs, H. Zischka & L. T. Jae: Nature, 579, 433 (2020).
39) J. Li, L. Gao, J. Chen, W. W. Zhang, X. Y. Zhang, B. Wang, C. Zhang, Y. Wang, Y. C. Huang, H. Wang et al.: Environ. Int., 167, 107393 (2022).
40) J. Mimura, A. Inose-Maruyama, S. Taniuchi, K. Kosaka, H. Yoshida, H. Yamazaki, S. Kasai, N. Harada, R. J. Kaufman, S. Oyadomari et al.: Int. J. Mol. Sci., 20, 1706 (2019).
41) P. Ye, J. Mimura, T. Okada, H. Sato, T. Liu, A. Maruyama, C. Ohyama & K. Itoh: Mol. Cell. Biol., 34, 3421 (2014).
42) Z. H. Zong, Z. X. Du, N. Li, C. Li, Q. Zhang, B. Q. Liu, Y. Guan & H. Q. Wang: Biochim. Biophys. Acta, 1823, 1395 (2012).
43) J. K. C. Kress, C. Jessen, A. Hufnagel, W. Schmitz, T. N. Xavier da Silva, A. Ferreira Dos Santos, L. Mosteo, C. R. Goding, J. P. Friedmann Angeli & S. Meierjohann: Cell Rep., 42, 112724 (2023).
44) P. Toboz, M. Amiri, N. Tabatabaei, C. R. Dufour, S. H. Kim, C. Fillebeen, C. E. Ayemoba, A. Khoutorsky, M. Nairz, L. Shao et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 119, e2121251119 (2022).
45) X. Song & D. Long: Front. Neurosci., 14, 267 (2020).
1) T. Kawai, M. V. Autieri & R. Scalia: Am. J. Physiol. Cell Physiol., 320, C375 (2021).
2) L. Sidossis & S. Kajimura: J. Clin. Invest., 125, 478 (2015).
3) J. Nedergaard, V. Golozoubova, A. Matthias, A. Asadi, A. Jacobsson & B. Cannon: Biochim. Biophys. Acta, 1504, 82 (2001).
4) T. Suganami, J. Nishida & Y. Ogawa: Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol., 25, 2062 (2005).
5) T. Sakamoto, N. Takahashi, Y. Sawaragi, S. Naknukool, R. Yu, T. Goto & T. Kawada: Am. J. Physiol. Cell Physiol., 304, C729 (2013).
6) T. Sakamoto, T. Nitta, L. Maruno, Y. S. Yeh, H. Kuwata, K. Tomita, T. Goto, N. Takahashi & T. Kawada: Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., 310, E676 (2016).
7) J. M. Monk, D. M. Liddle, A. L. Hutchinson & L. E. Robinson: Methods Mol. Biol., 2184, 111 (2020).
8) T. Goto, S. Naknukool, R. Yoshitake, Y. Hanafusa, S. Tokiwa, Y. Li, T. Sakamoto, T. Nitta, M. Kim, N. Takahashi et al.: Cytokine, 77, 107 (2016).
9) J. Wang, L. Zhang, L. Dong, X. Hu, F. Feng & F. Chen: J. Agric. Food Chem., 67, 14056 (2019).
10) M. L. Bonet, J. Mercader & A. Palou: Biochimie, 134, 99 (2017).
11) J. Wang, D. Li, P. Wang, X. Hu & F. Chen: J. Nutr. Biochem., 70, 105 (2019).
12) S. Yoshino, M. Kim, R. Awa, H. Kuwahara, Y. Kano & T. Kawada: Food Sci. Nutr., 2, 634 (2014).