全文PDF :
英文要旨および目次PDF :

巻頭言

実験動物個体を用いた栄養学研究の中で思うこと  /  堀尾 文彦

Page. 807 - 807 (published date : 2015年11月20日)

冒頭文

リファレンス

私が大学4年（38年前）の卒論研究で農芸化学科栄養化学研究室を希望したのは，「食と健康」にかかわる実験研究に触れたいという理由からである．卒業して大学院修士課程に進学し，さらに，折りしもこの時期はオイルショックと重なっていたことも影響してか博士課程に進学した．

 

今日の話題

超耐熱性βグルコシダーゼの結晶構造解析  /  中林 誠, 石川 一彦

Page. 808 - 811 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

タンパク質工学的手法によりタンパク質会合体構造をほぐすことで，超耐熱性β グルコシダーゼの高品質結晶調製および高分解能結晶構造解析に成功した．この手法はタンパク質の高品質結晶を得るための新しい考え方と言える．その手法と原理を紹介する．

1. 1) D. Pantazatos, J. S. Kim, H. E. Klock, R. C. Stevens, I. A. Wilson, S. A. Lesley & V. L. Woods, Jr.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 751 (2004).
2. 2) G. Spraggon, D. Pantazatos, H. E. Klock, I. A. Wilson, V. L. Woods, Jr. & S. A. Lesley: Protein Sci., 13, 3187 (2004).
3. 3) Z. S. Derewenda: Structure, 12, 529 (2004).
4. 4) D. R. Banatao, D. Cascio, C. S. Crowley, M. R. Fleissner, H. L. Tienson & T. O. Yeates: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 16230 (2006).
5. 5) A. Laganowsky, M. Zhao, A. B. Soriaga, M. R. Sawaya, D. Cascio & T. O. Yeates: Protein Sci., 20, 1876 (2011).
6. 6) H. Yamada, T. Tamada, M. Kosaka, K. Miyata, S. Fujiki, M. Tano, M. Moriya, M. Yamanishi, E. Honjo, H. Tada et al.: Protein Sci., 16, 1389 (2007).
7. 7) M. W. Bauer, E. J. Bylina, R. V. Swanson & R. M. Kelly: J. Biol. Chem., 271, 23749 (1996).
8. 8) T. Kaper, J. H. Lebbink, J. Pouwels, J. Kopp, G. E. Schulz, J. Oost & W. M. Vos: Biochemistry, 39, 4963 (2000).
9. 9) Y. Kado, T. Inoue & K. Ishikawa: Acta Crystallogr. Sect. F: Struct. Biol. Cryst. Commun., 67, 1473 (2011).
10. 10) M. Nakabayashi, M. Kataoka, Y. Mishima, Y. Maeno & K. Ishikawa: Acta Crystallogr. D: Biol. Crystallogr., 70, 877 (2014).

細胞壁ペクチンのホウ酸架橋率は植物のホウ素欠乏の有用な診断指標となる  /  松永 俊朗

Page. 812 - 814 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

今世紀初めに，植物の必須微量元素ホウ素の主な機能は，ペクチンのホウ酸架橋による細胞壁構造の安定化であることが解明された．その知見に基づいて考案した，ホウ酸架橋率を指標とする植物のホウ素欠乏診断法の有用性を，ホウ素欠乏による黒変障害ソラマメに適用して実証した．

1. 1) R. W. Bell: Plant Soil, 193, 149 (1997).
2. 2) 間藤　徹：化学と生物，35, 864 (1997).
3. 3) M. A. O'Neill, T. Ishii, P. Albersheim & A. G. Darvill: Annu. Rev. Plant Biol., 55, 109 (2004).
4. 4) H. Funakawa & K. Miwa: Front. Plant Sci., 6, 223 (2015).
5. 5) T. Matsunaga & T. Ishii: Anal. Sci., 22, 1125 (2006).
6. 6) 松永俊朗，樗木直也：土肥誌，85, 453 (2014).

生合成に着想を得たインドールアルカロイドの新規合成法  /  川村 智祥, 山本 芳彦

Page. 815 - 817 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

最近，北海道大学の大栗らのグループは，生合成経路として提唱されているデヒドロセコジンのDiels?Alder反応に着想を得て，骨格多様性を備えたインドールアルカロイドの合成法を開発した．この研究について解説する．

1. 1) H. Mizoguchi, H. Oikawa & H. Oguri: Nat. Chem., 6, 57 (2014).
2. 2) A. I. Scott: Acc. Chem. Res., 3, 151 (1970).
3. 3) C. Kan-Fan, G. Massiot, A. Ahond, B. C. Das, H.-P. Husson, P. Potier, A. I. Scott & C.-C. Wei: J. Chem. Soc., Chem. Commun., 164 (1974).
4. 4) H. Mizoguchi, R. Watanabe, S. Minami, H. Oikawa & H. Oguri: Org. Biomol. Chem., 13, 5955 (2015).
5. 5) J. Shimokawa: Tetrahedron Lett., 55, 6156 (2014).

農薬散布とアスペルギルス薬剤耐性に関連はあるのか？  /  加納 塁

Page. 818 - 819 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

アゾール系薬剤に対する耐性Aspergillus fumigatusの分離報告が増加しているため，アゾール系農薬（テトラコナゾール）を散布している圃場において分離を行い，アゾール耐性株が存在するか調査したところ，耐性株の検出に至らなかった．

1. 1) P. E. Verweij, E. Snelders, G. Kema, E. Mellado & W. J. Melcher: Lancet Infect. Dis., 9, 789 (2009).
2. 2) M. Enserink: Science, 326, 1173 (2009).
3. 3) P. Bowyer & D. W. Denning: Pest Manag. Sci., 70, 173 (2014).
4. 4) L. Lelièvre, M. Groh, C. Angebault, A. C. Maherault, E. Didier & M. E. Bougnoux: Med. Mal. Infect., 43, 139 (2013).
5. 5) R. Kano, E. Kohata, A. Tateishi, S. Y. Murayama, D. Hirose, Y. Shibata, Y. Kosuge, H. Inoue, H. Kamata & A. Hasegawa: Med. Mycol., 53, 174 (2015).

動物界で見つかった「新規オルガネラ」進化  /  中鉢 淳

Page. 820 - 821 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

アブラムシが，細菌から獲得した遺伝子を発現し，産物タンパク質を共生細菌に輸送することが明らかとなった．オルガネラの成立過程と同様の進化が，動物界でも起きていることを示す，世界初の発見である．

1. 1) S. D. Dyall, M. T. Brown & P. J. Johnson: Science, 304, 253 (2004).
2. 2) P. J. Keeling: Curr. Biol., 21, R623 (2011).
3. 3) E. C. Nowack & A. R. Grossman: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 5340 (2012).
4. 4) N. A. Moran, J. P. McCutcheon & A. Nakabachi: Annu. Rev. Genet., 42, 165 (2008).
5. 5) A. Nakabachi, S. Shigenobu, N. Sakazume, T. Shiraki, Y. Hayashizaki, P. Carninci, H. Ishikawa, T. Kudo & T. Fukatsu: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 5477 (2005).
6. 6) N. Nikoh & A. Nakabachi: BMC Biol., 7, 12 (2009).
7. 7) N. Nikoh, J. P. McCutcheon, T. Kudo, S. Miyagishima, N. A. Moran & A. Nakabachi: PLoS Genet., 6, e1000827 (2010).
8. 8) A. Nakabachi, K. Ishida, Y. Hongoh, M. Ohkuma & S. Miyagishima: Curr. Biol., 24, R640 (2014).

古典的分析化学手法の現代天然物化学研究への活用  /  濱野 吉十, 木元 久, 高橋 正和, 片野 肇

Page. 822 - 825 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

現代の天然物化学の研究に，溶液内イオン平衡に基礎を置く，いわば古典的な分析化学手法を活用し，天然有機化合物の分離と分析，さらに生合成研究を加速させた事例を記したい．特に，ポリ酸の溶液内反応に基づく比色分析と，カラムクロマトグラフィーを使用せずに溶液操作のみによる天然物の単離精製法について触れる．

1. 1) H. Katano, R. Tanaka, C. Maruyama & Y. Hamano: Anal. Biochem., 421, 308 (2012).
2. 2) H. Katano, H. Watanabe, M. Takakuwa, C. Maruyama & Y. Hamano: Anal. Sci., 29, 1095 (2013).
3. 3) H. Katano, K. Uematsu, C. Maruyama & Y. Hamano: Anal. Sci., 30, 17 (2014).
4. 4) H. Katano, S. Taira, K. Uematsu, H. Kimoto & Y. Hamano: Anal. Sci., 29, 1095 (2013).
5. 5) H. Katano, M. Takakuwa, T. Itoh & T. Hibi: Biosci. Biotechnol. Biochem., 79, 1057 (2015).
6. 6) H. Katano, C. Maruyama & Y. Hamano: Int. J. Polym. Anal. Charact., 16, 542 (2012).
7. 7) C. Maruyama, J. Toyoda, Y. Kato, M. Izumikawa, M. Takagi, K. Shin-ya, H. Katano, T. Utagawa & Y. Hamano: Nat. Chem. Biol., 8, 791 (2012).
8. 8) H. Katano, T. Yoneoka, N. Kito, C. Maruyama & Y. Hamano: Anal. Sci., 28, 1153 (2012).
9. 9) Y. Hamano, N. Kito, A. Kita, Y. Imokawa, K. Yamanaka, C. Maruyama & H. Katano: Appl. Environ. Microbiol., 80, 4993 (2014).
10. 10) H. Katano, A. Fujiwara & H. Kimoto: J. Chitin Chitosan Sci., 2, 75 (2014).
11. 11) H. Katano, N. Okamoto, M. Takakuwa, S. Taira, T. Kambe & M. Takahashi: Anal. Sci., 31, 85 (2015).

解説

ナス科植物の自家不和合性  /  円谷 徹之, 久保 健一, 高山 誠司

Page. 826 - 833 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

自家不和合性は，遺伝的に制御された植物の自殖を防ぐ機構である．多様な植物がさまざまな仕組みの自家不和合性を進化させてきたことが明らかになってきている．われわれは，ナス科植物のペチュニアを材料に，自家不和合性の仕組みを分子レベルで明らかにすることを目指してきた．この植物では，雌ずい側因子としてRNA分解酵素（S-RNase）が，雄ずい側因子として多数のF-boxタンパク質群（SLFs）が，自家不和合性における自他識別にかかわっていることが明らかにされてきた．さらに最近われわれは，SLFsを含むユビキチンリガーゼ複合体が非自己S-RNaseをユビキチン化し，プロテアソームによる分解を誘導することで，非自己花粉管の伸長停止を回避していることを明らかにした．本稿では，最近の生化学的知見を中心に解説する．

1. 1) S. Takayama & A. Isogai: Annu. Rev. Plant Biol., 56, 467 (2005).
2. 2) M. Iwano & S. Takayama: Curr. Opin. Plant Biol., 15, 78 (2012).
3. 3) 掛田克行，佐々英徳，土屋　亨，相井城太郎：育種学研究，16, 53-60 (2014).
4. 4) H. Sawada, M. Morita & M. Iwano: Biochem. Biophys. Res. Commun., 450, 1142 (2014).
5. 5) K.-i. Kubo, T. Entani, A. Takara, N. Wang, A. M. Fields, Z. Hua, M. Toyoda, S. Kawashima, T. Ando, A. Isogai et al.: Science, 330, 796 (2010).
6. 6) K.-i. Kubo, T. Paape, M. Hatakeyama, T. Entani, A. Takara, K. Kajihara, M. Tsukahara, R. Shimizu-Inatsugi, K. K. Shimizu & S. Takayama: Nat. Plants, 1, 14005 (2015).
7. 7) J. S. Williams, J. P. Der, C. W. de Pamphilis & T.-h. Kao: Plant Cell, 26, 2873 (2014).
8. 8) 久保健一，円谷徹之，高山誠司：S-RNase型の自家不和合性における協調的な非自己認識系．ライフサイエンス新着論文レビュー， (2010).
9. 9) 久保健一，円谷徹之，高山誠司：化学と生物，51, 7 (2013).
10. 10) Z. Hua & R. D. Vierstra: Annu. Rev. Plant Biol., 62, 299 (2011).
11. 11) T. Entani, K.-i. Kubo, S. Isogai, Y. Fukao, M. Shirakawa, A. Isogai & S. Takayama: Plant J., 78, 1014 (2014).
12. 12) Z. Hua & T.- Kao: Plant Cell, 18, 2531 (2006).
13. 13) L. Zhao, J. Huang, Z. Zhao, Q. Li, T. L. Sims & Y. Xue: Plant J., 62, 52 (2010).
14. 14) S. Li, P. Sun, J. S. Williams & T.-h. Kao: Plant Reprod., 27, 31 (2014).
15. 15) W. Li & R. T. Chetelat: Science, 330, 1827 (2010).
16. 16) W. Li & R. T. Chetelat: Genetics, 196, 439 (2013).
17. 17) W. H. Shen, Y. Parmentier, H. Hellmann, E. Lechner, A. Dong, J. Masson, F. Granier, L. Lepiniec, M. Estelle & P. Genschik: Mol. Biol. Cell, 13, 1916 (2002).
18. 18) E. P. Risseeuw, T. E. Daskalchuk, T. W. Banks, E. Liu, J. Cotelesage, H. Hellmann, M. Estelle, D. E. Somers & W. L. Crosby: Plant J., 34, 753 (2003).
19. 19) H. Kong, L. L. Landherr, M. W. Frohlich, J. Leebens-Mack, H. Ma & C. W. de Pamphilis: Plant J., 50, 873 (2007).
20. 20) K. Marrocco, A. Lecureuil, P. Nicolas & P. Guerche: Plant Mol. Biol., 52, 715 (2003).
21. 21) N. Takahashi, H. Kuroda, T. Kuromori, T. Hirayama, M. Seki, K. Shinozaki, H. Shimada & M. Matsui: Plant Cell Physiol., 45, 83 (2004).
22. 22) C. Xu, M. Li, J. Wu, H. Guo, Q. Li, Y. Zhang, J. Chai, T. Li & Y. Xue: Plant Mol. Biol., 81, 245 (2013).
23. 23) J. M. Gange, J. Smalle, D. J. Gingerich, J. M. Walker, S.-D. Yoo, S. Yanagisawa & R. D. Vierstra: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 6803 (2004).
24. 24) J. Stuttmann, E. Lechner, R. Guérois, J. E. Parker, L. Nussaume, P. Genschik & L. D. Noël: J. Biol. Chem., 284, 7920 (2009).
25. 25) F. S. Maraschin, J. Memelink & R. Offringa: Plant J., 59, 100 (2009).
26. 26) W. Liu, J. Fan, J. Li, Y. Song, Q. Li, Y. Zhang & Y. Xue: Front. Genet., 5, 228 (2014).
27. 27) N. Boivin, D. Morse & M. Cappadocia: J. Cell Sci., 127, 4123 (2014).
28. 28) R. Tao & A. F. Iezzoni: Sci. Hortic. (Amsterdam), 124, 423 (2010).

等温滴定型カロリメトリーを用いた生体分子間相互作用解析  /  北奥 喜仁, 大沼 貴之

Page. 834 - 842 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

生体分子間の相互作用解析法として等温滴定型カロリメトリー（Isothermal Titration Calorimetry; ITC）が古くから用いられている．近年，検出感度の向上と測定サンプルの微量化を達成した測定装置が市販されるようになったことから，今後その利用頻度はさらに高くなっていくものと思われる．ITC測定は，一度の測定で相互作用の熱力学的パラメータのフルセットを得ることができるという点において，表面プラズモン共鳴法やその他の分光学的方法による相互作用解析系とは一線を画している．本稿では筆者らが行った糖質加水分解酵素–基質間相互作用解析の例を中心に，ITC測定の原理と一般的な使用法に加えて，酵素の基質結合メカニズムに迫るより詳細な解析法について述べる．

1. 1) T. Wiseman, S. Williston, J. F. Brandts & L. N. Lin: Anal. Biochem., 179, 131 (1989).
2. 2) W. B. Turnbull & A. H. Daranas: J. Am. Chem. Soc., 125, 14859 (2003).
3. 3) T. Taira, Y. Mahoe, N. Kawamoto, S. Onaga, H. Iwasaki, T. Ohnuma & T. Fukamizo: Glycobiology, 21, 644 (2011).
4. 4) T. Ohnuma, M. Sørlie, T. Fukuda, N. Kawamoto, T. Taira & T. Fukamizo: FEBS J., 278, 3991 (2011).
5. 5) T. Ohnuma, N. Umemoto, T. Nagata, S. Shinya, T. Numata, T. Taira & T. Fukamizo: Biochim. Biophys. Acta, 1844, 793 (2014).
6. 6) B. M. Baker & K. P. Murphy: J. Mol. Biol., 268, 557 (1997).
7. 7) J. D. Dunitz: Science, 264, 670 (1994).
8. 8) G. Zolotnitsky, U. Cogan, N. Adir, V. Solomon, G. Shoham & Y. Shoham: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 11275 (2004).
9. 9) R. Fraczkiewicz & W. Braun: J. Comput. Chem., 19, 319 (1998).
10. 10) H. Naghibi, A. Tamura & J. M. Sturtevant: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 5597 (1995).
11. 11) I. Haq, J. E. Ladbury, B. Z. Chowdhry, T. C. Jenkins & J. B. Chaires: J. Mol. Biol., 271, 244 (1997).
12. 12) T. Ohnuma, T. Numata, T. Osawa, M. Mizuhara, K. M. Vårum & T. Fukamizo: Plant Mol. Biol., 75, 291 (2011).
13. 13) T. Ohnuma, T. Numata, T. Osawa, M. Mizuhara, O. Lampela, A. H. Juffer, K. Skriver & T. Fukamizo: Planta, 234, 123 (2011).
14. 14) T. Taira, H. Hayashi, Y. Tajiri, S. Onaga, G. Uechi, H. Iwasaki, T. Ohnuma & T. Fukamizo: Glycobiology, 19, 1452 (2009).
15. 15) T. Taira, M. Fujiwara, N. Dennhart, H. Hayashi, S. Onaga, T. Ohnuma, T. Letzel, S. Sakuda & T. Fukamizo: Biochim. Biophys. Acta, 1804, 668 (2010).
16. 16) N. Umemoto, Y. Kanda, T. Ohnuma, T. Osawa, T. Numata, S. Sakuda, T. Taira & T. Fukamizo: Plant J. (in press).
17. 17) G. Vaaje-Kolstad, S. J. Horn, M. Sørlie & V. G. Eijsink: FEBS J., 280, 3028 (2013).
18. 18) K. Igarashi, T. Uchihashi, T. Uchiyama, H. Sugimoto, M. Wada, K. Suzuki, S. Sakuda, T. Ando, T. Watanabe & M. Samejima: Nat. Commun., 5, 3975 (2014).
19. 19) N. N. Jr. Aronson, B. A. Halloran, M. F. Alexeyev, X. E. Zhou, Y. Wang, E. J. Meehan & L. Chen: Biosci. Biotechnol. Biochem., 70, 243 (2006).
20. 20) F. H. Cederkvist, S. F. Saua, V. Karlsen, S. Sakuda, V. G. Eijsink & M. Sørlie: Biochemistry, 46, 12347 (2007).
21. 21) J. Baban, S. Fjeld, S. Sakuda, V. G. Eijsink & M. Sørlie: J. Phys. Chem. B, 114, 6144 (2010).
22. 22) D. M. van Aalten, D. Komander, B. Synstad, S. Gåseidnes, M. G. Peter & V. G. Eijsink: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 8979 (2001).
23. 23) Y. Papanikolau, G. Tavlas, C. E. Vorgias & K. Petratos: Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 59, 400 (2003).
24. 24) M. Ogata, N. Umemoto, T. Ohnuma, T. Numata, A. Suzuki, T. Usui & T. Fukamizo: J. Biol. Chem., 288, 6072 (2013).
25. 25) H. Ohtaka, A. Velázquez-Campoy, D. Xie & E. Freire: Protein Sci., 11, 1908 (2002).
26. 26) W. H. J. Ward & G. A. Holdgate: Prog. Med. Chem., 38, 309 (2001).
27. 27) S. Bale, J. P. Julien, Z. A. Bornholdt, C. R. Kimberlin, P. Halfmann, M. A. Zandonatti, J. Kunert, G. J. Kroon, Y. Kawaoka, I. J. MacRae et al.: PLoS Pathog., 8, e1002916 (2012).
28. 28) D. W. Abbott & A. B. Boraston: Methods Enzymol., 50, 211 (2012).
29. 29) N. Karim & S. Kidokoro: Netsu Sokutei, 33, 27 (2006)
30. 30) I. M. Krokeide, G. H. V. Eijsink & M. Sørlie: Thermochim. Acta, 454, 144 (2007).

毒のないジャガイモはつくることができるのか？  /  梅基 直行

Page. 843 - 849 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

グリコアルカロイドは，管理を誤ることでジャガイモに増加・蓄積し，ヒトや家畜に中毒を起こす潜在的な危険物質である．従来の育種ではグリコアルカロイドをなくすことができないとされてきた．近年，この生合成にかかわる遺伝子が同定されつつある．われわれと競合グループの成果，今後の見通しについて解説する．

1. 1) 厚生労働省：自然毒のリスクプロファイル：高等植物：ジャガイモ，
2. 2) 日本中毒情報センター：保健師・薬剤師・看護師向け中毒情報，ジャガイモ，
3. 3) 農林水産省：食品中のソラニンやチャコニンに関する詳細情報，
4. 4) K. F. McCue, P. V. Allen, L. V. Shepherd, A. Blake, M. M. Maccree, D. R. Rockhold, R. G. Novy, D. Stewart, H. V. Davies & W. R. Belknap: Phytochemistry, 68, 327 (2007).
5. 5) K. F. McCue, P. V. Allen, L. V. Shepherd, A. Blake, J. Whitworth, M. M. Maccree, D. R. Rockhold, D. Stewart, H. V. Davies & W. R. Belknap: Phytochemistry, 67, 1590 (2006).
6. 6) K. F. McCue, L. V. T. Shepherd, P. V. Allen, M. M. Maccree, D. R. Rockhold, D. L. Corsini, H. V. Davies & W. R. Belknap: Plant Sci., 168, 267 (2005).
7. 7) E. Heftmann, E. R. Lieber & R. D. Bennett: Phytochemistry, 6, 225 (1967).
8. 8) K. Kaneko, S. Terada, N. Yoshida & H. Mitsuhashi: Phytochemistry, 16, 791 (1977).
9. 9) DFCI: Gene Index,
10. 10) 梅基直行，佐々木勝徳：PCT/JP2010/064744 (2010).
11. 11) 梅基直行，佐々木勝徳：特願2010-194590 (2010).
12. 12) M. del Rosario Abraham-Juarez, M. del Carmen Rocha-Granados, M. G. Lopez, R. F. Rivera-Bustamante & N. Ochoa-Alejo: Planta, 227, 681 (2008).
13. 13) K. Ohyama, A. Okawa, Y. Moriuchi & Y. Fujimoto: Phytochemistry, 89, 26 (2013).
14. 14) 梅基直行：PCT/JP2012/079955 (2012).
15. 15) 梅基直行，大山　清：PCT/JP2012/080443 (2012).
16. 16) M. Itkin, U. Heinig, O. Tzfadia, A. J. Bhide, B. Shinde, P. D. Cardenas, S. E. Bocobza, T. Unger, S. Malitsky, R. Finkers et al.: Science, 341, 175 (2013).
17. 17) 梅基直行：特願2013-127901 (2013).
18. 18) L. Arnqvist, P. C. Dutta, L. Jonsson & F. Sitbon: Plant Physiol., 131, 1792 (2003).
19. 19) S. Sawai, K. Ohyama, S. Yasumoto, H. Seki, T. Sakuma, T. Yamamoto, Y. Takebayashi, M. Kojima, H. Sakakibara, T. Aoki et al.: Plant Cell, 26, 3763 (2014).
20. 20) H. Seki, K. Ohyama, S. Sawai, M. Mizutani, T. Ohnishi, H. Sudo, T. Akashi, T. Aoki, K. Saito & T. Muranaka: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 14204 (2008).
21. 21) H. R. Waterham, J. Koster, G. J. Romeijn, R. C. Hennekam, P. Vreken, H. C. Andersson, D. R. FitzPatrick, R. I. Kelley & R. J. Wanders: Am. J. Hum. Genet., 69, 685 (2001).
22. 22) ドウニポンポン，ブルノーデュマ，ロベルトスパリーノ：特願2007-512255 (2005).
23. 23) U. Klahre, T. Noguchi, S. Fujioka, S. Takatsuto, T. Yokota, T. Nomura, S. Yoshida & N. H. Chua: Plant Cell, 10, 1677 (1998).
24. 24) L. Schultz, L. H. Kerckhoffs, U. Klahre, T. Yokota & J. B. Reid: Plant Mol. Biol., 47, 491 (2001).
25. 25) M. O'Brien, S. C. Chantha, A. Rahier & D. P. Matton: Plant Physiol., 139, 734 (2005).
26. 26) S. Shimizu & H. Mori: Plant Physiol., 112, 862 (1996).
27. 27) 梅基直行，大塚雅子：PCT/JP2013/058418 (2013).
28. 28) R. Elias, B. J. Till, C. Mba & B. Al-Safadi: BMC Res. Notes, 2, 141 (2009).
29. 29) Y. Wang, X. Cheng, Q. Shan, Y. Zhang, J. Liu, C. Gao & J. L. Qiu: Nat. Biotechnol., 32, 947 (2014).
30. 30) H. W. Nutzmann & A. Osbourn: Curr. Opin. Biotechnol., 26, 91 (2014).
31. 31) M. Itkin, I. Rogachev, N. Alkan, T. Rosenberg, S. Malitsky, L. Masini, S. Meir, Y. Iijima, K. Aoki, R. de Vos et al.: Plant Cell, 23, 4507 (2011).
32. 32) Potato Genome Sequencing Consortium: Nature, 475, 189 (2011).
33. 33) T. Itoh, T. Tamura & T. Matsumoto: Steroids, 30, 425 (1977).
34. 34) E. J. Behrman & V. Gopalan: J. Chem. Educ., 82, 1791 (2005).
35. 35) S. L. Sinden, L. L. Sanford, W. W. Cantelo & K. L. Deahl: Environ. Entomol., 15, 1057 (1986).
36. 36) N. Kozukue & S. Mizuno: J. Jpn. Soc. Hortic. Sci., 54(Suppl. 2), 496 (1985).
37. 37) J. J. Tewksbury & G. P. Nabhan: Nature, 412, 403 (2001).
38. 38) 大山修一，山本紀夫，近藤　史：国立民族学博物館調査報告，84, 177 (2009).
39. 39) Pepper Institute: The Pepper Genome Database
40. 40) G. H. Villarino, A. Bombarely, J. J. Giovannoni, M. J. Scanlon & N. S. Mattson: PLoS ONE, 9, e94651 (2014).
41. 41) K. Tamura, G. Stecher, D. Peterson, A. Filipski & S. Kumar: Mol. Biol. Evol., 30, 2725 (2013).

質量分析法を利用したRNA–タンパク質複合体のトータル解析  /  泉川 桂一, 石川 英明, 吉川 治孝, 礒辺 俊明, 高橋 信弘

Page. 850 - 859 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

生体内ではRNAとタンパク質は，お互いに相互作用し合いRNA–タンパク質複合体としてさまざまな生理機能を発揮する．その際，タンパク質が翻訳後修飾でその機能が制御されているのと同様に，RNAは転写後修飾によって機能が制御されている．RNAにも100種類を超える転写後修飾が知られ，RNAの生体内での真の機能をこれらの修飾情報を知ることなく理解することはできない．ここに，RNA–タンパク質複合体のトータル解析の必要性がある．本稿では，最近開発された質量分析法とゲノムワイドな検索エンジンを基礎とした直接的なRNA解析法を紹介し，プロテオミクスの手法によるタンパク質の直接解析法と合わせたRNA–タンパク質複合体のトータル解析について概説する．

1. 1) J. I. Harris, M. A. Naughton & F. Sanger: Arch. Biochem. Biophys., 65, 427 (1956).
2. 2) A. S. Deshmukh et al.: Mol. Cell Proteomics, pii: mcp.M114.044222 (2015).
3. 3) A. C. Gavin, P. Aloy, P. Grandi, R. Krause, M. Boesche, M. Marzioch, C. Rau, L. J. Jensen, S. Bastuck, B. Dümpelfeld et al.: Nature, 440, 631 (2006).
4. 4) F. H. Crick: J. Mol. Biol., 38, 367 (1968).
5. 5) N. Ban, P. Nissen, J. Hansen, P. B. Moore & T. A. Steitz: Science, 289, 905 (2000).
6. 6) B. T. Wimberly, D. E. Brodersen, W. M. Clemons Jr., R. J. Morgan-Warren, A. P. Carter, C. Vonrhein, T. Hartsch & V. Ramakrishnan: Nature, 407, 327 (2000).
7. 7) J. Ule, K. B. Jensen, M. Ruggiu, A. Mele, A. Ule & R. B. Darnell: Science, 302, 1212 (2003).
8. 8) D. D. Licatalosi, A. Mele, J. J. Fak, J. Ule, M. Kayikci, S. W. Chi, T. A. Clark, A. C. Schweitzer, J. E. Blume, X. Wang et al.: Nature, 456, 464 (2008).
9. 9) A. C. Jungkamp et al.: Cell, 141, 129 (2010).
10. 10) J. König, K. Zarnack, G. Rot, T. Curk, M. Kayikci, B. Zupan, D. J. Turner, N. M. Luscombe & J. Ule: Nat. Struct. Mol. Biol., 17, 909 (2010).
11. 11) S. Granneman, G. Kudla, E. Petfalski & D. Tollervey: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 9613 (2009).
12. 12) S. W. Chi, J. B. Zang, A. Mele & R. B. Darnell: Nature, 460, 479 (2009).
13. 13) Y. C. Yang, C. Di, B. Hu, M. Zhou, Y. Liu, N. Song, Y. Li, J. Umetsu & Z. J. Lu: BMC Genomics, 16, 51 (2015).
14. 14) Y. Furuichi Y et al.: Nature, 253, 374 (1975).
15. 15) J. Rozenski et al.: Nucleic Acids Res., 27 (Database issue), 196 (1999).
16. 16) A. Czerwoniec, S. Dunin-Horkawicz, E. Purta, K. H. Kaminska, J. M. Kasprzak, J. M. Bujnicki, H. Grosjean & K. Rother: Nucleic Acids Res., 37(Database), D118 (2009).
17. 17) D. Dominissini, S. Moshitch-Moshkovitz, S. Schwartz, M. Salmon-Divon, L. Ungar, S. Osenberg, K. Cesarkas, J. Jacob-Hirsch, N. Amariglio, M. Kupiec et al.: Nature, 485, 201 (2012).
18. 18) K. Chen, Z. Lu, X. Wang, Y. Fu, G. Z. Luo, N. Liu, D. Han, D. Dominissini, Q. Dai, T. Pan et al.: Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 54, 1587 (2015).
19. 19) E. Jeffrey et al.: Nucleic Acids Res., 40, 5023 (2012).
20. 20) P. F. Crain: Methods Enzymol., 193, 782 (1990).
21. 21) S. C. Pomerantz & J. A. McCloskey: Methods Enzymol., 193, 796 (1990).
22. 22) M. Taoka, Y. Yamauchi, Y. Nobe, S. Masaki, H. Nakayama, H. Ishikawa, N. Takahashi & T. Isobe: Nucleic Acids Res., 37, e140 (2009).
23. 23) M. Taucher & K. Breuker: Angew. Chem., 51, 11289 (2012).
24. 24) H. Nakayama. et al.: Anal. Chem., PMID, 25662820 (2015).
25. 25) H. Yoshikawa et al.: Mol. Cell Proteomics, 10, M110.006148 (2011).
26. 26) J. Cox et al.: J. Proteome Res., 10, 1794 (2011).
27. 27) R. Matthiesen & F. Kirpekar: Nucleic Acids Res., 37, e48 (2009).
28. 28) H. Nakayama, M. Akiyama, M. Taoka, Y. Yamauchi, Y. Nobe, H. Ishikawa, N. Takahashi & T. Isobe: Nucleic Acids Res., 37, e47 (2009).
29. 29) A. Nyakas, L. C. Blum, S. R. Stucki, J. L. Reymond & S. Schürch: J. Am. Soc., Mass Spectrom., 24, 249 (2013).
30. 30) P. J. Sample: “RoboOligo,” Software for RNA-based Data Analysis, The Ohio State University,
31. 31) Y. Yamauchi, M. Taoka, Y. Nobe, K. Izumikawa, N. Takahashi, H. Nakayama & T. Isobe: J. Chromatogr. A, 1312, 87 (2013).
32. 32) M. Taoka, M. Ikumi, H. Nakayama, S. Masaki, R. Matsuda, Y. Nobe, Y. Yamauchi, J. Takeda, N. Takahashi & T. Isobe: Anal. Chem., 82, 7795 (2010).
33. 33) R. A. Sauterer, R. J. Feeney & G. W. Zieve: Exp. Cell Res., 176, 344 (1988).
34. 34) D. J. Battle, M. Kasim, J. Yong, F. Lotti, C. K. Lau, J. Mouaikel, Z. Zhang, K. Han, L. Wan & G. Dreyfuss: Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 71, 313 (2006).
35. 35) H. Ishikawa, Y. Nobe, K. Izumikawa, H. Yoshikawa, N. Miyazawa, G. Terukina, N. Kurokawa, M. Taoka, Y. Yamauchi, H. Nakayama et al.: Nucleic Acids Res., 42, 2708 (2014).
36. 36) T. Chen et al.: Cell Stem Cell., pii: S1934-5909(15)00017-X doi: 10.1016/j.stem. (2015).

セミナー室

ストリゴラクトン研究の進展と環境応答における役割  /  亀岡 啓, 経塚 淳子

Page. 860 - 865 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

2008年にストリゴラクトンが植物ホルモンであることが報告されて以来，その生合成，信号伝達，進化などに関する研究が急速に進展した．また，環境に合わせて植物の成長を最適化するために重要な役割を果たしていることも明らかになってきた．

1. 1) C. E. Cook, L. P. Whichard, B. Turner, M. E. Wall & G. H. Egley: Science, 154, 1189 (1966).
2. 2) K. Akiyama, K. Matsuzaki & H. Hayashi: Nature, 435, 824 (2005).
3. 3) M. Umehara, A. Hanada, S. Yoshida, K. Akiyama, T. Arite, N. Takeda-Kamiya, H. Magome, Y. Kamiya, K. Shirasu, K. Yoneyama et al.: Nature, 455, 195 (2008).
4. 4) V. Gomez-Roldan, S. Fermas, P. B. Brewer, V. Puech-Pagès, E. A. Dun, J. P. Pillot, F. Letisse, R. Matusova, S. Danoun, J. C. Portais et al.: Nature, 455, 189 (2008).
5. 5) Y. Seto, H. Kameoka, S. Yamaguchi & J. Kyozuka: Plant Cell Physiol., 53, 1843 (2012).
6. 6) A. Alder, M. Jamil, M. Marzorati, M. Bruno, M. Vermathen, P. Bigler, S. Ghisla, H. Bouwmeester, P. Beyer & S. Al-Babili: Science, 335, 1348 (2012).
7. 7) Y. Seto, A. Sado, K. Asami, A. Hanada, M. Umehara, K. Akiyama & S. Yamaguchi: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, 1640 (2014).
8. 8) S. Abe, A. Sado, K. Tanaka, T. Kisugi, K. Asami, S. Ota, H. I. Kim, K. Yoneyama, X. Xie, T. Ohnishi et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, 18084 (2014).
9. 9) Y. Zhang, A. D. van Dijk, A. Scaffidi, G. R. Flematti, M. Hofmann, T. Charnikhova, F. Verstappen, J. Hepworth, S. van der Krol, O. Leyser et al.: Nat. Chem. Biol., 10, 1028 (2014).
10. 10) A. Scaffidi, M. T. Waters, E. L. Ghisalberti, K. W. Dixon, G. R. Flematti & S. M. Smith: Plant J., 76, 1 (2013).
11. 11) T. Kretzschmar, W. Kohlen, J. Sasse, L. Borghi, M. Schlegel, J. B. Bachelier, D. Reinhardt, R. Bours, H. J. Bouwmeester & E. Martinoia: Nature, 483, 341 (2012).
12. 12) J. Sasse, S. Simon, C. Gübeli, G. W. Liu, X. Cheng, J. Friml, H. Bouwmeester, E. Martinoia & L. Borghi: Curr. Biol., 25, 647 (2015).
13. 13) C. Hamiaux, R. S. Drummond, B. J. Janssen, S. E. Ledger, J. M. Cooney, R. D. Newcomb & K. C. Snowden: Curr. Biol., 22, 2032 (2012).
14. 14) L. Jiang, X. Liu, G. Xiong, H. Liu, F. Chen, L. Wang, X. Meng, G. Liu, H. Yu, Y. Yuan et al.: Nature, 504, 401 (2013).
15. 15) F. Zhou, Q. Lin, L. Zhu, Y. Ren, K. Zhou, N. Shabek, F. Wu, H. Mao, W. Dong, L. Gan et al.: Nature, 504, 406 (2013).
16. 16) P. M. Delaux, X. Xie, R. E. Timme, V. Puech-Pages, C. Dunand, E. Lecompte, C. F. Delwiche, K. Yoneyama, G. Bécard & N. Séjalon-Delmas: New Phytol., 195, 857 (2012).
17. 17) D. C. Nelson, A. Scaffidi, E. A. Dun, M. T. Waters, G. R. Flematti, K. W. Dixon, C. A. Beveridge, E. L. Ghisalberti & S. M. Smith: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 8897 (2011).
18. 18) Z. Hu, H. Yan, J. Yang, S. Yamaguchi, M. Maekawa, I. Takamure, N. Tsutsumi, J. Kyozuka & M. Nakazono: Plant Cell Physiol., 51, 1136 (2010).
19. 19) G. R. Flematti, E. L. Ghisalberti, K. W. Dixon & R. D. Trengove: Science, 305, 977 (2004).
20. 20) M. T. Waters, D. C. Nelson, A. Scaffidi, G. R. Flematti, Y. K. Sun, K. W. Dixon & S. M. Smith: Development, 139, 1285 (2012).
21. 21) J. P. Stanga, S. M. Smith, W. R. Briggs & D. C. Nelson: Plant Physiol., 163, 318 (2013).
22. 22) C. E. Conn, R. Bythell-Douglas, D. Neumann, S. Yoshida, B. Whittington, J. H. Westwood, K. Shirasu, C. S. Bond, K. A. Dyer & D. C. Nelson: Science, 349, 5540 (2015).
23. 23) J. A. López-Ráez, T. Charnikhova, V. Gómez-Roldán, R. Matusova, W. Kohlen, R. De Vos, F. Verstappen, V. Puech-Pages, G. Bécard, P. Mulder et al.: New Phytol., 178, 863 (2008).
24. 24) E. Mayzlish-Gati, C. De-Cuyper, S. Goormachtig, T. Beeckman, M. Vuylsteke, P. B. Brewer, C. A. Beveridge, U. Yermiyahu, Y. Kaplan, Y. Enzer et al.: Plant Physiol., 160, 1329 (2012).
25. 25) W. Kohlen, T. Charnikhova, Q. Liu, R. Bours, M. A. Domagalska, S. Beguerie, F. Verstappen, O. Leyser, H. Bouwmeester & C. Ruyter-Spira: Plant Physiol., 155, 974 (2011).
26. 26) M. Umehara, A. Hanada, H. Magome, N. Takeda-Kamiya & S. Yamaguchi: Plant Cell Physiol., 51, 1118 (2010).
27. 27) S. Ito, T. Nozoye, E. Sasaki, M. Imai, Y. Shiwa, M. Shibata-Hatta, T. Ishige, K. Fukui, K. Ito, H. Nakanishi et al.: PLoS ONE, 10, e0119724 (2015).
28. 28) H. Sun, J. Tao, S. Liu, S. Huang, S. Chen, X. Xie, K. Yoneyama, Y. Zhang & G. Xu: J. Exp. Bot., 65, 6735 (2014).
29. 29) K. Yoneyama, X. Xie, H. I. Kim, T. Kisugi, T. Nomura, H. Sekimoto, T. Yokota & K. Yoneyama: Planta, 235, 1197 (2012).
30. 30) R. S. Drummond, B. J. Janssen, Z. Luo, C. Oplaat, S. E. Ledger, M. W. Wohlers & K. C. Snowden: Plant Physiol., 168, 735 (2015).
31. 31) D. Osuna, B. Usadel, R. Morcuende, Y. Gibon, O. E. Bläsing, M. Höhne, M. Günter, B. Kamlage, R. Trethewey, W. R. Scheible et al.: Plant J., 49, 463 (2007).

テクノロジーイノベーション

超好熱菌由来の新規DNAポリメラーゼの発見とその産業利用  /  北林 雅夫, 小松原 秀介, 今中 忠行

Page. 866 - 871 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

KOD DNAポリメラーゼは，DNA合成の伸長能力が高くPCRの正確性が高いユニークな特性をもっている．開発当初はその特性の制御が難しく使いづらかったが，現在はさまざまな改良を重ね最も使いやすいPCR酵素の一つとなっている．

1. 1) M. Takagi, M. Nishioka, H. Kakihara, M. Kitabayashi, H. Inoue, B. Kawakami, M. Oka & T. Imanaka: Appl. Environ. Microbiol., 63, 4504 (1997).
2. 2) H. Hashimoto, M. Nishioka, S. Fujiwara, M. Takagi, T. Imanaka, T. Inoue & Y. Kai: J. Mol. Biol., 306, 469 (2001).
3. 3) T. Kuroita, H. Matsumura, N. Yokota, M. Kitabayashi, H. Hashimoto, T. Inoue, T. Imanaka & Y. Kai: J. Mol. Biol., 351, 291 (2005).
4. 4) H. Mizuguchi, M. Nakatsuji, S. Fujiwara, M. Takagi & T. Imanaka: J. Biochem., 126, 762 (1999).
5. 5) H. H. Hogrefe, C. J. Hansen, B. R. Scott & K. B. Nielson: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 596 (2002).
6. 6) M. Kitabayashi, Y. Nishiya, M. Esaka, M. Itakura & T. Imanaka: Biosci. Biotechnol. Biochem., 66, 2194 (2002).
7. 7) W. Abu Al-Soud & P. Rådström: J. Clin. Microbiol., 38, 4463 (2000).
8. 8) Z. Zhang, M. B. Kermekchiev & W. M. Barnes: J. Mol. Diagn., 12, 152 (2010).

バイオサイエンススコープ

生物多様性条約と科学のかかわり（第3回）  /  白江 英之

Page. 872 - 876 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

最近技術の進展が著しい合成生物学に対し，現状日本を含めた各国がこの合成生物学に対して，どのような規制を設定し，そのリスク管理に対処しているのかを報告する．

1. 1) 「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」(平成15年6月18日法律第97号，.
2. 2) 「細胞を創る」研究会
3. 3) 薬事・食品衛生審議会食品衛生分科会新開発食品調査部会(2013)(http://www.mhlw.go.jp/stf/shingi/2r9852000002tccm-att/2r9852000002tck7.pdf#search=‘DP321381’)「食品として利用される作物の３世代前に、GMTを用いているものの、その後の栽培用の種子（F1世代）及び食品として利用される作物（F2世代）には組換えDNAは含まれないとされている．．．．当該食品は，食品衛生法上の規格基準に基づく安全性審査の対象である「遺伝子組換え食品」には該当しないと結論した．」
4. 4) Intellia Therapeutics, Inc.:
5. 5) Editas Medicine, Inc.:
6. 6) CRISPR Therapeutics:
7. 7) S. Bar-Yam, J. Byers-Corbin, R. Casagrande, F. Eichler, A. Lin, M. Oesterreicher, P. Regardh, R. D. Turlington & K. A. Oye: Synberc and iGEM Version 9.1 (2012).
8. 8) 米国の遺伝子組換え技術の規制法の正式名（TSCA: Toxic Substances Control Act, FIFRA: Federal Insecticide, Fungicide, and Rodenticide Act, RCRA: the Resource Conservation and Recovery Act; CERCLA: the Comprehensive Environmental Response, Compensation, and Liability Act, ESA: the Endangered Species ActおよびFDCA: Federal Food, Drug, and Cosmetic Act）
9. 9) 米国の省庁の正式名(EPA: Environmental Protection Agency, USDA; US Department of Agriculture, FDA: Food and Drug Administration)
10. 10) NIHガイドライン
11. 11) 米国環境省の遺伝子組換え実験の規制の種類（MCAN: Microbial Commercial Activity Notice微生物商業利用通知書，TERA: TSCA Environmental Release Application, 実験的意図的放出申請書）
12. 12) 欧州委員会の閉鎖系での遺伝子組み換え技術の規制（指令90/219/ECC）
13. 13) 欧州委員会の開放系での遺伝子組換え技術の規制（指令2001/18/ECC）
14. 14) 欧州委員会の遺伝子組換え食品・飼料に関する規制（規則1829/2003）
15. 15) 欧州委員会のGMOのトレーサビリティと表示に関する規制（規則1830/2003）
16. 16) Environmental Protection Authority (NZ): ldquo;Determination of whether or not any organism in a new organism under section 26 of the Hazardous Substances and New Organisms (HSNO Act 1996),” on April 19, 2013.

トップランナーに聞く

ノボザイムズ ジャパン株式会社研究開発部門 ジーンテクノロジー部部長 兼 開発戦略担当 髙木 忍 氏  /  石神 健, 西村 麻里江, 松藤 寛

Page. 877 - 881 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

ノボザイムズ ジャパン株式会社は，産業用酵素などで世界をリードするノボザイムズ社の日本法人である．開発された酵素は，洗剤から繊維，食品に至るまで日常生活に密着した産業分野で利用されている．ここで研究開発部門の部長として活躍されている髙木忍さんに，本企画初めての女性トップランナーとして，外資系会社でのご経験や女性リーダーとしての考え方，若者に望むことなどについて熱く語っていただきました．

 

農芸化学@HighSchool

微生物酵素による色素脱色作用に関する研究  /  伊藤 夢人, 古谷 秀斗, 井原 進一

Page. 882 - 883 (published date : 2015年11月20日)

概要原稿

リファレンス

本研究は， 日本農芸化学会2015年度大会（開催： 岡山大学津島キャンパス） の「ジュニア農芸化学会2015」で発表されたものである．発表者らは，地域産業に貢献しうる研究を展開している．具体的には，タオルや製紙の生産過程で出る染料廃水を処理するため，微生物酵素を活用した染料の脱色に取り組んでいる．今回の発表は，発表者らの先輩たちが残した成果をさらに発展させるものである

1. 1) 学校法人神奈川大学広報委員会　全国高校生理科・科学論文大賞専門委員会編：“未来の科学者との対話X—第10回神奈川大学全国高校生理科・科学論文大賞受賞作品集—”日刊工業新聞，2012.
2. 2) 特許第5504396号，2014.3.28.