化学と生物 Vol.52 (2014) No.11
全文PDF :
巻頭言
-
Page. 707 - 707
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
冒頭文
リファレンス
「芸は身を助く」.「芸」を広辞苑で引くと一つ目に「修練によって得た技能,学問,わざ」とあり,その使用例の一つとして冒頭の句が掲載されている.たしかに,これまでアカデミアで修練してきた自分を振り返るとそのようにも思える(少なくとも食い逸れてはいない).とすると学会名称に使われている「農芸」は,「農に関連した技能,学問,わざ」であり,「化学」をつければ「農に関連した技能,学問,わざで,化学に関連する分野」となる.
-
今日の話題
-
Page. 708 - 709
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
90年代以降生命科学の進展は目覚ましく,これらの技術革新を反映させたゲノム創薬への期待は極めて大きい.特に,次世代シークエンサーやマイクロアレイの台頭によってトランスクリプトーム解析などが広く展開されるようになり,パーキンソン病などの神経疾患からがんに至る多くの病態において遺伝子機能の異常が確認されるようになった.
- 1) B. L. Davidson & P. B. McCray, Jr.: Nat. Rev. Genet., 12, 329 (2011).
- 2) M. López-Fraga, N. Wright & A. Jiménez: Infect. Disord. Drug Targets, 8, 262 (2008).
- 3) http://www.fda.gov/NewsEvents/Newsroom/PressAnnouncements, 2013.
- 4) S. L. Beaucage & R. P. Iyer: Tetrahedron, 48, 2223 (1992).
- 5) S. Kim, M. Matsumoto & K. Chiba: Chem. Eur. J., 19, 8615 (2013).
-
-
Page. 710 - 711
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
「乳」は哺乳類に特有の器官である乳腺で作られるが,「成長の速い種の乳にはタンパク質量が多い」「水棲動物など体温維持に多くのカロリーを必要とする種の乳には脂質量が多い」など,その組成は種によって大きく異なる.また,明確な定義はないものの,ヒトやウシの場合,一般に出産後5日目頃までの乳は「初乳」,6~10日頃の乳は「移行乳」,10日目以降の乳は「成熟乳」と呼ばれ,その成分組成は産後経時的に変化する.
- 1) 穴釜雄三:“乳学”,光琳書院,1975, p 8.
- 2) R. G. Jensen: “Handbook of Milk Composition,” Academic Press, 1995.
- 3) N. Kosaka, H. Izumi, K. Sekine & T. Ochiya: Silence, 1, 7 (2010).
- 4) H. Izumi, N. Kosaka, T. Shimizu, K. Sekine, T. Ochiya & M. Takase: J. Dairy Sci., 95, 4831 (2012).
- 5) H. Izumi, N. Kosaka, T. Shimizu, K. Sekine, T. Ochiya & M. Takase: PLoS ONE, 9, e88843 (2014).
- 6) C. Admyre, S. M. Johansson, K. R. Qazi, J. J. Filén, R. Lahesmaa, M. Norman, E. P. Neve, A. Scheynius & S. Gabrielsson: J. Immunol., 179, 1969 (2007).
- 7) H. Valadi, K. Ekström, A. Bossios, M. Sjöstrand, J. J. Lee & J. O. Lötvall: Nat. Cell Biol., 9, 654 (2007).
-
-
Page. 712 - 713
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
放線菌は肥沃な土壌1g中に数百万個体も存在する土壌細菌であり,土壌中の物質変換・環境浄化などに重要な役割を果たしている.今日までに数多くの抗生物質や工業・医薬的に重要な二次代謝産物が発見されているが,微生物代謝産物の約7割が放線菌由来である.放線菌の中で代表的な属はStreptomyces属であり,土壌中の分布において大勢を占めている.
- 1) Y. Ohnishi, S. Kameyama, H. Onaka & S. Horinouchi: Mol. Microbiol., 34, 102 (1999).
- 2) R. Kawachi, T. Akashi, Y. Kamitani, A. Sy, U. Wangchaisoonthorn, T. Nihira & Y. Yamada: Mol. Microbiol., 36, 302 (2000).
- 3) E. Takano, H. Kinoshita, V. Mersinias, G. Bucca, G. Hotchkiss, T. Nihira, C. P. Smith, M. Bibb, W. Wohlleben & K. Chater: Mol. Microbiol., 56, 465 (2005).
- 4) C. Corre, L. Song, S. O'Rourke, K. F. Chater & G. L. Challis: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 17510 (2008).
- 5) S. Kitani, K. T. Miyamoto, S. Takamatsu, E. Herawati, H. Iguchi, K. Nishitomi, M. Uchida, T. Nagamitsu, S. Omura, H. Ikeda et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 16410 (2011).
- 6) S. Mochizuki, K. Hiratsu, M. Suwa, T. Ishii, F. Sugino, K. Yamada & H. Kinashi: Mol. Microbiol., 48, 1501 (2003).
- 7) K. Arakawa, S. Mochizuki, K. Yamada, T. Noma & H. Kinashi: Microbiology, 153, 1817 (2007).
- 8) S. Yamamoto, Y. He, K. Arakawa & H. Kinashi: J. Bacteriol., 190, 1308 (2008).
- 9) T. Suzuki, S. Mochizuki, S. Yamamoto, K. Arakawa & H. Kinashi: Biosci. Biotechnol. Biochem., 74, 819 (2010).
- 10) K. Arakawa, N. Tsuda, A. Taniguchi & H. Kinashi: ChemBioChem, 13, 1447 (2012).
-
-
Page. 714 - 715
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
超好熱菌とは80°C以上で生育する微生物の総称である.その多くはドメイン・アーキアに属し,硫黄成分の豊富な熱水噴出口など,いわゆる原始地球に近い環境に棲息している.超好熱菌は分子系統樹(universal tree)でも根に近いところに位置しており,生命の起源が好熱性生物であるという考えの根拠にもなっている.超好熱性アーキアのPyrococcus属とThermococcus属はともにThermococcales目の絶対嫌気性の従属栄養微生物であり,分子系統的にも近い.
- 1) T. Fukui, H. Atomi, T. Kanai, R. Matsui, S. Fujiwara & T. Imanaka: Genome Res., 15, 352 (2005).
- 2) R. Hidese, R. Nishikawa, L. Gao, M. Katano, T. Imai, S. Kato, T. Kanai, H. Atomi, T. Imanaka & S. Fujiwara: Extremophiles, (2014), in press. 10.1007/s00792-014-0638-9
- 3) S. Fujiwara, R. Aki, M. Yoshida, H. Higashibata, T. Imanaka & W. Fukuda: Appl. Environ. Microbiol., 74, 7306 (2008).
- 4) A. Danno, W. Fukuda, M. Yoshida, R. Aki, T. Tanaka, T. Kanai, T. Imanaka & S. Fujiwara: J. Mol. Biol., 382, 298 (2008).
- 5) Y. Shimada, W. Fukuda, Y. Akada, M. Ishida, J. Nakayama, T. Imanaka & S. Fujiwara: Biochem. Biophys. Res. Commun., 389, 622 (2009).
- 6) L. Gao, A. Danno, S. Fujii, W. Fukuda, T. Imanaka & S. Fujiwara: Appl. Environ. Microbiol., 78, 3806 (2012).
- 7) E. Nagaoka, R. Hidese, T. Imanaka & S. Fujiwara: J. Bacteriol., 195, 3442 (2013).
- 8) T. J. Santangelo, L. Cubonová, K. M. Skinner & J. N. Reeve: J. Bacteriol., 191, 7102 (2009).
- 9) K. Okada, R. Hidese, W. Fukuda, M. Niitsu, K. Takao, Y. Horai, N. Umezawa, T. Higuchi, T. Oshima, Y. Yoshikawa et al.: J. Bacteriol., 196, 1866 (2014).
-
-
Page. 716 - 718
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
生合成されたタンパク質にさまざまな官能基やタンパク質,糖鎖,脂質などが結合する「タンパク質の翻訳後修飾」は,酵素活性,細胞内局在・輸送,構造安定性,分解などを制御する重要な生理機能変換機構である.典型的な翻訳後修飾であるリン酸化やメチル化は,修飾の有または無という1ビットの情報変換を司るが,ユビキチン化は多様な連結様式によって多彩な生理機能発現を可能にしている.
- 1) D. Komander & M. Rape: Annu. Rev. Biochem., 81, 203 (2012).
- 2) T. Kirisako, K. Kamei, S. Murata, M. Kato, H. Fukumoto, M. Kanie, S. Sano, F. Tokunaga, K. Tanaka & K. Iwai: EMBO J., 25, 4877 (2006).
- 3) F. Tokunaga: J. Biochem., 154, 313 (2013).
- 4) F. Tokunaga, T. Nakagawa, M. Nakahara, Y. Saeki, M. Taniguchi, S. Sakata, K. Tanaka, H. Nakano & K. Iwai: Nature, 471, 633 (2011).
- 5) F. Tokunaga, S. Sakata, Y. Saeki, Y. Satomi, T. Kirisako, K. Kamei, T. Nakagawa, M. Kato, S. Murata, S. Yamaoka et al.: Nat. Cell Biol., 11, 123 (2009).
-
解説
-
Page. 719 - 724
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
ヒト型糖鎖構造を意識しながら抗体やワクチンタンパク質を植物で生産することが試みられている.植物におけるN-結合型糖鎖修飾経路を理解することは,ヒト型糖鎖構築設計に重要である.そこで,われわれは植物修飾酵素の遺伝子をクローン化し,異種細胞で生産した組換え酵素を用いて,その基質特異性を調査し,その糖鎖修飾経路を考察した.
- 1) http://www.aist.go.jp/aist_j/topics/to2013/to20131017/to20131017.html
- 2) R. Kornfeld & S. Kornfeld: Annu. Rev. Biochem., 54, 631 (1985).
- 3) B. E. S. Gunning & M. W. Steer: “Plant Cell Biology Structure and Function,” Jones and Bartlett Publishers, 1996, Content 13.
- 4) C. Saint-Jore-Dupas, A. Nebenführ, A. Boulaflous, M. L. Follet-Gueye, C. Plasson, C. Hawes, A. Driouich, L. Faye & V. Gomord: Plant Cell, 18, 3182 (2006).
- 5) H. Kajiura, H. Koiwa, Y. Nakazawa, A. Okazawa, A. Kobayashi, T. Seki & K. Fujiyama: Glycobiology, 20, 235 (2010).
- 6) K. Dohi, J. Isoyama-Tanaka, T. Tokuda & K. Fujiyama: J. Biosci. Bioeng., 109, 388 (2010).
- 7) P. Bencúr, H. Steinkellne, B. Svoboda, J. Mucha, R. Strasser, D. Kolarich, S. Hann, G. Köllensperger, J. Glössl, F. Altmann et al.: Biochem. J., 388, 515 (2005).
- 8) H. Kajiura, T. Okamoto, R. Misaki, Y. Matsuura & K. Fujiyama: J. Biosci. Bioeng., 113, 48 (2012).
- 9) H. Leiter, J. Mucha, E. Staudacher, R. Grimm, J. Glössl & F. Altmann: J. Biol. Chem., 274, 21830 (1999).
- 10) Y. Kimura, S. Hase, Y. Kobayashi, Y. Kyogoku, G. Funatsu & T. Ikenaka: J. Biochem., 101, 1051 (1987).
- 11) L. Faye, K. D. Johnson, A. Sturm & M. J. Chrispeels: Physiol. Plant., 75, 309 (1989).
-
-
Page. 725 - 730
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
MATEファミリーは,原核生物,古細菌,真核生物すべてに広く存在する膜タンパク質輸送体であり,ナトリウムイオンあるいはプロトンの濃度勾配を利用してさまざまな異物を細胞外へと排出することで,細胞の恒常性を維持している.そのため病原性細菌やがん細胞においては,薬剤を排出して薬効を低下させる薬剤耐性の一端を担うものであり,近代医療への脅威となっている.したがって,MATEによる薬剤輸送機構の解明および阻害剤の創出が長らく望まれてきた.しかし,MATEは,さまざまな低分子化合物を排出してしまうので,低分子化合物の阻害剤は薬効をもたないというジレンマがあった.今回,われわれは好熱古細菌由来MATEの単体および基質薬剤・阻害活性ペプチドとの複合体のX線結晶構造を高分解能で決定した.その結果,アスパラギン酸残基のプロトン化に伴って,TM1が大きく折れ曲がることで基質ポケットを縮小して基質を排出する機構を発見し,MATEの輸送機構について新たな仮説を提唱するとともに,ペプチド創薬の道を開いた.
- 1) M. H. Brown, I. T. Paulsen & R. A. Skurray: Mol. Microbiol., 31, 394 (1999).
- 2) K. Damme, A. T. Nies, E. Schaeffeler & M. Schwab: Drug Metab. Rev., 43, 499 (2011).
- 3) Y. Yamagishi et al.: Chem. Biol., 18, 1562 (2011).
- 4) X. He et al.: Nature, 467, 991 (2010).
- 5) Y. Tanaka, C. J. Hipolito, A. D. Maturana, K. Ito, T. Kuroda, T. Higuchi, T. Katoh, H. E. Kato, M. Hattori, K. Kumazaki et al.: Nature, 496, 247 (2013).
- 6) C. J. Law, P. C. Maloney & D. N. Wang: Annu. Rev. Microbiol., 62, 289 (2008).
-
-
Page. 731 - 741
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
ウィント(Wnt)シグナル伝達経路は初期発生における体軸形成から各種組織・器官の形態形成,組織幹細胞の維持,発がんなどのさまざまな生命現象をはじめ,がんや糖尿病,神経疾患において重要な役割を果たしている.Wntシグナルを調節する化合物は,生命現象解明のための分子ツールや,医薬品リード化合物となることが期待できる.本稿では,Wntシグナルについて概説し,Wntシグナルを調節する天然物の探索研究の一端を紹介する.
- 1) J. N. Anastas & R. T. Moon: Nat. Rev. Cancer, 13, 11 (2013).
- 2) 菊池 章:生化學,81, 780 (2009).
- 3) H. Clevers & R. Nusse: Cell, 149, 1192 (2012).
- 4) 小田上剛直,小路弘行:MEDCHEM NEWS, 22(1), 21 (2012).
- 5) J. Hao, A. Ao, L. Zhou, C. K. Murphy, A. Y. Frist, J. J. Keel, C. A. Thorne, K. Kim, E. Lee & C. C. Hong: Cell Reports, 4, 898 (2013).
- 6) J. Gwak, S. G. Hwang, H. S. Park, S. R. Choi, S. H. Park, H. Kim, N. C. Ha, S. J. Bae, J. K. Han, D. E. Kim et al.: Cell Res., 22, 237 (2012).
- 7) S. Wang, J. Yin, D. Chen, F. Nie, X. Song, C. Fei, H. Miao, C. Jing, W. Ma, L. Wang et al.: Nat. Chem. Biol., 9, 579 (2013).
- 8) X. Li, T. Ohtsuki, T. Koyano, T. Kowithayakorn & M. Ishibashi: Chem. Asian J., 4, 540 (2009).
- 9) H. Y. Park, K. Toume, M. A. Arai, S. K. Sadhu, F. Ahmed & M. Ishibashi: ChemBioChem, 15, 872 (2014).
- 10) C. A. Thorne, A. J. Hanson, J. Schneider, E. Tahinci, D. Orton, C. S. Cselenyi, K. K. Jernigan, K. C. Meyers, B. I. Hang, A. G. Waterson et al.: Nat. Chem. Biol., 6, 829 (2010).
- 11) T. Singh & S. K. Katiyar: PLoS ONE, 8, e60749 (2013).
- 12) K. Toume, K. Kamiya, M. A. Arai, N. Mori, S. K. Sadhu, F. Ahmed & M. Ishibashi: Org. Lett., 15, 6106 (2013).
- 13) Q.-G. Tan & X.-D. Luo: Chem. Rev., 111, 7437 (2011).
- 14) S.-G. Liao, H.-D. Chen & J.-M. Yue: Chem. Rev., 109, 1092 (2009).
- 15) N. Nishiya, Y. Oku, Y. Kumagai, Y. Sato, E. Yamaguchi, A. Sasaki, M. Shoji, Y. Ohnishi, H. Okamoto & Y. Uehara: Chem. Biol., 21, 530 (2014).
- 16) N. Mori, K. Toume, M. A. Arai, T. Koyano, T. Kowithayakorn & M. Ishibashi: J. Nat. Med., 65, 234 (2011).
- 17) R. G. Fuentes, K. Toume, M. A. Arai, T. Koyano, T. Kowithayakorn & M. Ishibashi: Heterocycles, 88, 1501 (2014).
- 18) T. Yamaguchi, K. Toume, M. A. Arai, F. Ahmed, S. K. Sadhu & M. Ishibashi: Nat. Prod. Commun., 7, 475 (2012).
- 19) Y. Tamai, K. Toume, M. A. Arai, A. Hayashida, H. Kato, Y. Shizuri, S. Tsukamoto & M. Ishibashi: Heterocycles, 84, 1245 (2012).
- 20) Y. Tamai, K. Toume, M. A. Arai & M. Ishibashi: Heterocycles, 86, 1517 (2012).
- 21) M. S. Abdelfattah, T. Kazufumi & M. Ishibashi: J. Nat. Prod., 73, 1999 (2010).
-
-
Page. 742 - 748
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
本稿は,第7回農芸化学研究企画賞をいただいたことで,その発想に至った経緯とその後の進展についての解説である.専門外の学生諸君や一般の研究者の方々には,自身とは関係のない分野の話かもしれない.しかし,専門外のことが自分の興味や研究領域と重なる機会は誰にでもある.そのようなときに,専門外に手を出す(専門外の方の研究内容を奪うことではない)ことは必要だし,それが自身の研究に深みを与えるものだと確信する.ここでは,味覚・酵素化学・神経伝達・細胞工学・食品化学・健康医学という分野にまたがった研究内容になる.そのつながりを眺めて欲しい.
- 1) H. Ueno, J. J. Likos & D. E. Metzler: Biochemistry, 21, 4387 (1982).
- 2) J. J. Likos, H. Ueno, R. W. Feldhaus & D. E. Metzler: Biochemistry, 21, 4377 (1982).
- 3) A. Martinez del Pozo, M. Merola, H. Ueno, J. M. Manning, K. Tanizawa, K. Nishimura, S. Asano, H. Tanaka, K. Soda, D. Ringe et al.: Biochemistry, 28, 510 (1989).
- 4) A. Martinez del Pozo, M. Merola, H. Ueno, J. M. Manning, K. Tanizawa, K. Nishimura, K. Soda & D. Ringe: J. Biol. Chem., 264, 17784 (1989).
- 5) H. Ueno: J. Mol. Catal., B Enzym., 10, 67 (2000).
- 6) 二ノ宮裕三:化学と生物,45, 419 (2007).
- 7) D. A. Yarmolinsky, C. S. Zuker & N. J. Ryba: Cell, 139, 234 (2009).
- 8) 山本 隆:“知のWebマガジン”,en3.9, http://www.shiojigyo.com/en/archives/index.cfm, 2003.
- 9) R. G. Murray: “The ultrastructure of sensory organs,” Friedmann, 1973, pp. 1–81.
- 10) K. Obata: Protein, Nucleic Acid, and Enzyme, 49, 295 (2004). (Japanese)
- 11) H. Asada, Y. Kawamura, K. Maruyama, H. Kume, R.-G. Ding, N. Kanbara, H. Kuzume, M. Sanbo, T. Yagi & K. Obata: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 6496 (1997).
- 12) J. Chandrashekar, C. Kuhn, Y. Oka, D. A. Yarmolinsky, E. Hummler, N. J. Ryba & C. S. Zuker: Nature, 464, 297 (2010).
- 13) N. Tamamaki, Y. Yanagawa, R. Tomioka, J. Miyazaki, K. Obata & T. Kaneko: J. Comp. Neurol., 467, 60 (2003).
- 14) 橋本壽夫:たばこ塩産業新聞,2008年10月25日,http://www.geocities.jp/t_hashimotoodawara/salt6/salt6-08-10.html, 2008.
- 15) 中村友美,植野洋志:化学と生物,47, 370 (2009).
- 16) K. Wada, Y. Nitta & H. Ueno: 家政学研究(奈良),53, 1 (2006).
- 17) K. Hisaki, K. Wada, K. Shinohara, Y. Nakamura & H. Ueno: Jpn. Taste Smell J., 14, 435 (2007).
- 18) 岩井和夫:化学と生物,29, 99 (1991).
-
セミナー室
-
Page. 749 - 756
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
生物には,さまざまな環境中で生き抜くための戦略の一つとして,多糖を主成分とする細胞壁を保有する細胞からなるものが存在する.われわれが研究対象としているアスペルギルス属糸状菌には,麹菌(Aspergillus oryzae, A. sojae, A. luchuensis, A. kawachii)などの醸造分野で重要な有用菌や,医療分野で問題となっている病原菌(A. fumigatus),カビ毒生産菌(A. flavus, A. parasiticus)などが含まれ,人類の食と安全,健康に密接にかかわっている.
- 1) P. W. de Groot et al.: Fungal Genet. Biol., 46(Suppl. 1), S72 (2009).
- 2) J. P. Latgé et al.: Infect. Immun., 62, 5424 (1994).
- 3) E. A. Leitao et al.: Glycobiology, 13, 681 (2003).
- 4) J. P. Latgé: Med. Mycol., 47(Suppl. 1), S104 (2009).
- 5) B. Tefsen et al.: Glycobiology, 22, 456 (2012).
- 6) M. Goto: Biosci. Biotechnol. Biochem., 71, 1415 (2007).
- 7) Y. Komachi et al.: Mol. Microbiol., 90, 1054 (2013).
- 8) M. Loibl & S. Strahl: Biochim. Biophys. Acta, 1833, 2438 (2013).
- 9) T. Oka et al.: Microbiology, 150, 1973 (2004).
- 10) T. Oka et al.: Microbiology, 151, 3657 (2005).
- 11) M. Goto et al.: Eukaryot. Cell, 8, 1465 (2009).
- 12) A. M. El-Ganiny et al.: Fungal Genet. Biol., 47, 629 (2010).
- 13) R. A. Damveld et al.: Genetics, 178, 873 (2008).
- 14) A. M. El-Ganiny et al.: Fungal Genet. Biol., 45, 1533 (2008).
- 15) P. S. Schmalhorst et al.: Eukaryot. Cell, 7, 1268 (2008).
- 16) J. Engel et al.: J. Biol. Chem., 284, 33859 (2009).
- 17) S. Afroz et al.: Fungal Genet. Biol., 48, 896 (2011).
- 18) J. A. Campbell et al.: Biochem. J., 326, 929 (1997).
- 19) D. Stynen et al.: Infect. Immun., 60, 2237 (1992).
- 20) L. Kremer et al.: J. Biol. Chem., 276, 26430 (2001).
- 21) C. Huang & S. J. Turco: J. Biol. Chem., 268, 24060 (1993).
- 22) M. Lussier et al.: Biochim. Biophys. Acta, 1426, 323 (1993).
- 23) T. Futagami et al.: Eukaryot. Cell, 10, 1504 (2011).
- 24) M. Oppenheimer et al.: Arch. Biochem. Biophys., 502, 31 (2010).
- 25) C. Heiss et al.: J. Biol. Chem., 288, 10994 (2013).
-
-
Page. 757 - 763
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
糸状菌はその名のとおり細長い糸状の細胞(菌糸)を伸長させ増殖する多細胞真核微生物であり,その種は150万を超えると考えられている.その中には,ヒトや家畜,農作物に対して病原性を示すものが存在する一方,食品製造や医薬品製造に利用される有益なものも多く存在する.このような糸状菌の性質は,種の多様性に加え,高度な極性をもった菌糸および環境変化に伴う分化といった形態的特徴が密接に関連している.
- 1) B. Pinan-Lucarré, M. Paoletti, K. Dementhon, B. Coulary-Salin & C. Clavé: Mol. Microbiol., 47, 321 (2003).
- 2) B. Pinan-Lucarré, A. Balguerie & C. Clavé: Eukaryot. Cell, 4, 1765 (2005).
- 3) T. Kikuma, M. Ohneda, M. Arioka & K. Kitamoto: Eukaryot. Cell, 5, 1328 (2006).
- 4) C. Veneault-Fourrey, M. Barooah, M. Egan, G. Wakley & N. J. Talbot: Science, 312, 580 (2006).
- 5) T. Kikuma & K. Kitamoto: FEMS Microbiol. Lett., 316, 61 (2011).
- 6) S. Yanagisawa, T. Kikuma & K. Kitamoto: FEMS Microbiol. Lett., 338, 168 (2013).
- 7) T. Kikuma, M. Arioka & K. Kitamoto: Autophagy, 3, 128 (2007).
- 8) Y. Mabashi, T. Kikuma, J. Maruyama, M. Arioka & K. Kitamoto: Biosci. Biotechnol. Biochem., 70, 1882 (2006).
- 9) J. Maruyama, S. Kikuchi & K. Kitamoto: Fungal Genet. Biol., 43, 642 (2006).
- 10) J. Y. Shoji, T. Kikuma, M. Arioka & K. Kitamoto: PLoS ONE, 5, e15650 (2010).
- 11) S. Kimura, J. Maruyama, T. Kikuma, M. Arioka & K. Kitamoto: Biochem. Biophys. Res. Commun., 406, 464 (2011).
- 12) J. Y. Shoji, M. Arioka & K. Kitamoto: Autophagy, 2, 226 (2006).
- 13) E. Kvam & D. S. Goldfarb: Autophagy, 3, 85 (2007).
- 14) M. He, M. J. Kershaw, D. M. Soanes, Y. Xia & N. J. Talbot: PLoS ONE, 7, e33270 (2012).
- 15) X. H. Liu, H. M. Gao, F. Xu, J. P. Lu, R. J. Devenish & F. C. Lin: Autophagy, 8, 1415 (2012).
- 16) X. H. Liu, J. P. Lu & F. C. Lin: Autophagy, 3, 472 (2007).
- 17) M. Asakura, S. Ninomiya, M. Sugimoto, M. Oku, S. Yamashita, T. Okuno, Y. Sakai & Y. Takano: Plant Cell, 21, 1291 (2009).
- 18) Y. Takano, M. Asakura & Y. Sakai: Autophagy, 5, 1041 (2009).
- 19) D. L. Richie, K. K. Fuller, J. Fortwendel, M. D. Miley, J. W. McCarthy, M. Feldmesser, J. C. Rhodes & D. S. Askew: Eukaryot. Cell, 6, 2437 (2007).
- 20) J. Yoon, T. Kikuma, J. Maruyama & K. Kitamoto: PLoS ONE, 8, e62512 (2013).
- 21) M. Bartoszewska, J. A. Kiel, R. A. Bovenberg, M. Veenhuis & I. J. van der Klei: Appl. Environ. Microbiol., 77, 1413 (2011).
- 22) W. H. Meijer, L. Gidijala, S. Fekken, J. A. Kiel, M. A. van den Berg, R. Lascaris, R. A. Bovenberg & I. J. van der Klei: Appl. Environ. Microbiol., 76, 5702 (2010).
- 23) J. F. Martín, R. V. Ullán & C. García-Estrada: J. Ind. Microbiol. Biotechnol., 39, 367 (2012).
- 24) S. Shiroma, L. N. Jayakody, K. Horie, K. Okamoto & H. Kitagaki: Appl. Environ. Microbiol., 80, 1002 (2014).
- 25) M. J. Kershaw & N. J. Talbot: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 15967 (2009).
- 26) X. H. Liu, J. P. Lu, L. Zhang, B. Dong, H. Min & F. C. Lin: Eukaryot. Cell, 6, 997 (2007).
- 27) G. Park, J. A. Servin, G. E. Turner, L. Altamirano, H. V. Colot, P. Collopy, L. Litvinkova, L. Li, C. A. Jones, F. G. Diala et al.: Eukaryot. Cell, 10, 1553 (2011).
- 28) Z. Duan, Y. Chen, W. Huang, Y. Shang, P. Chen & C. Wang: Autophagy, 9, 538 (2013).
- 29) B. M. Nitsche, A. M. Burggraaf-van Welzen, G. Lamers, V. Meyer & A. F. Ram: Appl. Microbiol. Biotechnol., 97, 8205 (2013).
- 30) B. Dong, X. H. Liu, J. P. Lu, F. S. Zhang, H. M. Gao, H. K. Wang & F. C. Lin: Autophagy, 5, 946 (2009).
- 31) T. B. Liu, X. H. Liu, J. P. Lu, L. Zhang, H. Min & F. C. Lin: Autophagy, 6, 74 (2010).
- 32) O. Voigt & S. Pöggeler: Autophagy, 9, 33 (2013).
- 33) J. P. Lu, X. H. Liu, X. X. Feng, H. Min & F. C. Lin: Curr. Genet., 55, 461 (2009).
- 34) X. H. Liu, J. Yang, R. L. He, J. P. Lu, C. L. Zhang, S. L. Lu & F. C. Lin: Res. Microbiol., 162, 756 (2011).
- 35) L. Zhang, J. Wang, X. Q. Xie, N. O. Keyhani, M. G. Feng & S. H. Ying: Microbiology, 159, 243 (2013).
- 36) N. Nolting, Y. Bernhards & S. Pöggeler: Fungal Genet. Biol., 46, 531 (2009).
- 37) Y. Z. Deng, M. Ramos-Pamplona & N. I. Naqvi: Autophagy, 5, 33 (2009).
- 38) L. Josefsen, A. Droce, T. E. Sondergaard, J. L. Sørensen, J. Bormann, W. Schäfer, H. Giese & S. Olsson: Autophagy, 8, 326 (2012).
- 39) Y. L. Chen, Y. Gao, K. Q. Zhang & C. G. Zou: Environ. Microbiol. Rep., 5, 511 (2013).
- 40) L. N. Nguyen, J. Bormann, G. T. Le, C. Stärkel, S. Olsson, J. D. Nosanchuk, H. Giese & W. Schäfer: Fungal Genet. Biol., 48, 217 (2011).
- 41) Y. He, Y. Z. Deng & N. I. Naqvi: Autophagy, 9, 1818 (2013).
-
-
Page. 764 - 770
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
テルペノイド化合物の多くは植物により生産されるが,カビも数は及ばないもののユニークな構造をもつテルペノイド化合物を生産する.さらにゲノム情報から判断すると眠っている多くの遺伝子が存在すると考えられ,その潜在能力は高いと思われる.それらの生合成に関しては,古くから化合物の単離・構造解析,トレーサー実験による生合成経路の推定が行われてきたが,近年カビのゲノム情報が利用できること,またカビを用いた組換え実験が可能になったことから,遺伝子破壊や異種宿主での発現による生合成遺伝子の同定や組換え酵素を用いたin vitro実験が多用されている.
- 1) H. Kawaide: Biosci. Biotechnol. Biochem., 70, 583 (2006).
- 2) M. Kimura, T. Tokai, N. Takahashi-Ando, S. Ohsato & M. Fujimura: Biosci. Biotechnol. Biochem., 71, 2105 (2007).
- 3) R. H. Proctor & T. M. Hohn: J. Biol. Chem., 268, 4543 (1993).
- 4) J. M. Caruthers, I. Kang, M. J. Rynkiewicz, D. E. Cane & D. W. Christianson: J. Biol. Chem., 275, 25533 (2000).
- 5) E. Y. Shishova, L. Di Costanzo, D. E. Cane & D. W. Christianson: Biochemistry, 46, 1941 (2007).
- 6) B. Felicetti & D. E. Cane: J. Am. Chem. Soc., 126, 7212 (2004).
- 7) H. Oikawa, T. Toyomasu, H. Toshima, S. Ohashi, H. Kawaide, Y. Kamiya, M. Ohtsuka, S. Shinoda, W. Mitsuhashi & T. Sassa: J. Am. Chem. Soc., 123, 5154 (2001).
- 8) R. Fujii, A. Minami, T. Tsukagoshi, N. Sato, T. Sahara, S. Ohgiya, K. Gomi & H. Oikawa: Biosci. Biotechnol. Biochem., 75, 1813 (2011).
- 9) T. Toyomasu: Biosci. Biotechnol. Biochem., 72, 1168 (2008).
- 10) T. Toyomasu, A. Kaneko, T. Tokiwano, Y. Kanno, Y. Kanno, R. Niida, S. Miura, T. Nishioka, C. Ikeda, W. Mitsuhashi et al.: J. Org. Chem., 74, 1541 (2009).
- 11) M. Hashimoto, Y. Higuchi, S. Takahashi, H. Osada, T. Sakaki, T. Toyomasu, T. Sassa, N. Kato & T. Dairi: Bioorg. Med. Chem. Lett., 19, 5640 (2009).
- 12) M. Noike, Y. Ono, Y. Araki, R. Tanio, Y. Higuchi, H. Nitta, Y. Hamano, T. Toyomasu, T. Sassa, N. Kato et al.: PLoS ONE, 7, e42090 (2012).
- 13) Y. Ono, A. Minami, M. Noike, Y. Higuchi, T. Toyomasu, T. Sassa, N. Kato & T. Dairi: J. Am. Chem. Soc., 133, 2548 (2011).
- 14) M. Noike, C. Liu, Y. Ono, Y. Hamano, T. Toyomasu, T. Sassa, N. Kato & T. Dairi: ChemBioChem, 13, 566 (2012).
- 15) C. M. Wang, R. Hopson, X. Lin & D. E. Cane: J. Am. Chem. Soc., 131, 8360 (2009).
- 16) H. Mitsuguchi, Y. Seshime, I. Fujii, M. Shibuya, Y. Ebizuka & T. Kushiro: J. Am. Chem. Soc., 131, 6402 (2009).
- 17) M. Kimura, T. Kushiro, M. Shibuya, Y. Ebizuka & I. Abe: Biochem. Biophys. Res. Commun., 391, 899 (2010).
- 18) R. Chiba, A. Minami, K. Gomi & H. Oikawa: Org. Lett., 15, 594 (2013).
- 19) T. Itoh, K. Tokunaga, Y. Matsuda, I. Fujii, I. Abe, Y. Ebizuka & T. Kushiro: Nat. Chem., 2, 858 (2010).
- 20) T. Itoh, K. Tokunaga, E. K. Radhakrishnan, I. Fujii, I. Abe, Y. Ebizuka & T. Kushiro: ChemBioChem, 13, 1132 (2012).
- 21) Y. Matsuda, T. Awakawa, T. Itoh, T. Wakimoto, T. Kushiro, I. Fujii, Y. Ebizuka & I. Abe: ChemBioChem, 13, 1738 (2012).
- 22) Y. Matsuda, T. Awakawa & I. Abe: Tetrahedron, 69, 8199 (2013).
- 23) Y. Matsuda, T. Awakawa, T. Wakimoto & I. Abe: J. Am. Chem. Soc., 135, 10962 (2013).
- 24) H. C. Lo, R. Entwistle, C. J. Guo, M. Ahuja, E. Szewczyk, J. H. Hung, Y. M. Chiang, B. R. Oakley & C. C. Wang: J. Am. Chem. Soc., 134, 4709 (2012).
- 25) H. C. Lin, Y. Tsunematsu, S. Dhingra, W. Xu, M. Fukutomi, Y. H. Chooi, D. E. Cane, A. M. Calvo, K. Watanabe & Y. Tang: J. Am. Chem. Soc., 136, 4426 (2014).
- 26) S. Saikia, M. J. Nicholson, C. Young, E. J. Parker & B. Scott: Mycol. Res., 112, 184 (2008).
- 27) K. Tagami, C. Liu, A. Minami, M. Noike, T. Isaka, S. Fueki, Y. Shichijo, H. Toshima, K. Gomi, T. Dairi et al.: J. Am. Chem. Soc., 135, 1260 (2013).
- 28) C. Liu, M. Noike, A. Minami, H. Oikawa & T. Dairi: Appl. Microbiol. Biotechnol., 98, 199 (2014).
- 29) C. Liu, A. Minami, M. Noike, H. Toshima, H. Oikawa & T. Dairi: Appl. Environ. Microbiol., 79, 7298 (2013).
- 30) C. Liu, M. Noike, A. Minami, H. Oikawa & T. Dairi: Biosci. Biotechnol. Biochem., 78, 448 (2014).
- 31) T. Motoyama, T. Hayashi, H. Hirota, M. Ueki & H. Osada: Chem. Biol., 19, 1611 (2012).
- 32) S. M. Li: Nat. Prod. Rep., 27, 57 (2010).
- 33) J. Chen, H. Morita, T. Wakimoto, T. Mori, H. Noguchi & I. Abe: Org. Lett., 14, 3080 (2012).
- 34) Y. H. Chooi, P. Wang, J. Fang, Y. Li, K. Wu, P. Wang & Y. Tang: J. Am. Chem. Soc., 134, 9428 (2012).
- 35) J. F. Sanchez, R. Entwistle, J. H. Hung, J. Yaegashi, S. Jain, Y. M. Chiang, C. C. Wang & B. R. Oakley: J. Am. Chem. Soc., 133, 4010 (2011).
- 36) E. Haug-Schifferdecker, D. Arican, R. Brückner & L. Heide: J. Biol. Chem., 285, 16487 (2010).
- 37) Y. Ding, R. M. Williams & D. H. Sherman: J. Biol. Chem., 283, 16068 (2008).
- 38) C. J. Balibar, A. R. Howard-Jones & C. T. Walsh: Nat. Chem. Biol., 3, 584 (2007).
- 39) 浅井禎吾,大島吉輝:化学と生物,51, 13 (2013)
- 40) 中沢威人,恒松雄太,石川格靖,渡辺賢二:生物工学会誌,90, 289 (2012).
-
プロダクトイノベーション
-
Page. 771 - 776
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
RNAは細胞内で遺伝情報を伝達する重要な役割を果たしているが,最近では,non-coding RNA(ncRNA)の発見など,RNAが生体内でさまざまな機能を果たしていることが示唆されている.ncRNAなど細胞内RNAの機能解明を進めるためには,生細胞でRNAがいつ,どのように機能発現をしているかを知る必要がある.しかしながら,生細胞を用いてのRNAイメージングの報告はこれまでのところごく少数に限られ,確立した方法がないのが現状である.
- 1) A. Shibata, H. Abe & Y. Ito: Molecules, 17, 2446 (2012).
- 2) T. N. Grossmann & O. Seitz: J. Am. Chem. Soc., 128, 15596 (2006).
- 3) A. Shibata, T. Uzawa, Y. Nakashima, M. Ito, Y. Nakano, S. Shuto, Y. Ito & H. Abe: J. Am. Chem. Soc., 135, 14172 (2013).
- 4) U. Christensen, N. Jacobsen, V. K. Rajwanshi, J. Wengel & T. Koch: Biochem. J., 354, 481 (2001).
- 5) H. Abe, J. Wang, K. Furukawa, K. Oki, M. Uda, S. Tsuneda & Y. Ito: Bioconjug. Chem., 19, 1219 (2008).
- 6) K. Furukawa, H. Abe, K. Hibino, Y. Sako, S. Tsuneda & Y. Ito: Bioconjug. Chem., 20, 1026 (2009).
- 7) K. Furukawa, H. Abe, Y. Tamura, R. Yoshimoto, M. Yoshida, S. Tsuneda & Y. Ito: Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 50, 12020 (2011).
-
農芸化学@HighSchool
-
白色のカニは何色が好き?
/
竹之前 槙太郎, 日野 裕太, 梶浦 梨央, 中村 眞美, 日野 遥, 渡辺 大雅, 藺牟田 猛, 富山 ひなの, 河野 碧奈美
Page. 777 - 779
(published date : 2014年11月1日 advanced publication : 2014年10月20日)
概要原稿
リファレンス
本研究は,日本農芸化学会2014年度大会(開催地:明治大学)での「ジュニア農芸化学会」において発表され,銅賞を表彰された.宮崎県に生息する絶滅危惧種のカニ,ハクセンシオマネキは繁殖期には白色になる.本研究では,ハクセンシオマネキの色の認識と行動様式について調査し,体色の変化との関係を考察している.非常に興味深い内容であり,本誌編集委員から高い評価を受けた.
- 1) D. Muramatsu: J. Ethol., 29, 3 (2011).
- 2) D. Muramatsu: J. Ethol., 117, 408 (2011).
-