化学と生物 Vol.53 (2015) No.11
全文PDF :
英文要旨および目次PDF :
巻頭言
-
白金耳
/
小川 順
Page. 725 - 725
(published date : 2015年10月20日)
冒頭文
リファレンス
どうもデスクワークは性に合わない.気分転換にラボへ足を運ぶ.最近めっきり自分で手を動かすことも減り,新型の機器など,まるで挑むように立ちはだかるかに思える.心和むのは,クリーンベンチ.いそいそといつもの作業に取り掛かる.白金耳の作製.落ち着くひとときである.
-
今日の話題
-
Page. 726 - 728
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
キチンオリゴ糖は植物の免疫応答を誘導する.イネのキチン受容体CEBiPとキチンオリゴ糖の相互作用をNMRで解析した結果,2分子のCEBiPが1分子のキチンオリゴ糖をサンドイッチ状に挟んで二量体形成することが,シグナル伝達の起動につながることがわかった.
- 1) 賀来華江,新屋友規,渋谷直人:化学と生物,50, 52 (2012).
- 2) T. Liu, Z. Liu, C. Song, Y. Hu, Z. Han, J. She, F. Fan, J. Wang, C. Jin, J. Chang et al.: Science, 336, 1160 (2012).
- 3) T. Shinya, N. Motoyama, A. Ikeda, M. Wada, K. Kamiya, M. Hayafune, H. Kaku & N. Shibuya: Plant Cell Physiol., 53, 1696 (2012).
- 4) C. Faulkner, E. Petutschnig, Y. Benitez-Alfonso, M. Beck, S. Robatzek, V. Lipka & A. J. Maule: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 110, 9166 (2013).
- 5) Y. Cao, Y. Liang, K. Tanaka, C. T. Nguyen, R. P. Jedrzejczak, A. Joachimiak & G. Stacey: eLife, 10, 7554 (2014).
- 6) M. Hayafunea, R. Berisiob, R. Marchettic, A. Silipoc, M. Kayamaa, Y. Desakia, S. Arimaa, F. Squegliab, A. Ruggierob, K. Tokuyasud et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, E404 (2014).
- 7) K. Tokuyasu, Y. Mori, Y. Kitagawa & K. Hayashi: United States Patent 6,437,107 (1999).
- 8) K. Yamaguchi, K. Yamada, K. Ishikawa, S. Yoshimura, N. Hayashi, K. Uchihashi, N. Ishihama, M. Kishi-Kaboshi, A. Takahashi, S. Tsuge et al.: Cell Host Microbe, 13, 347 (2013).
- 9) T. Shinya, K. Yamaguchi, Y. Desaki, K. Yamada, T. Narisawa, Y. Kobayashi, K. Maeda, M. Suzuki, T. Tanimoto, J. Takeda et al.: Plant J., 79, 56 (2014).
- 10) R. Willmann, H. M. Lajunen, G. Erbs, M. A. Newman, D. Kolb, K. Tsuda, F. Katagiri, J. Fliegmann, J. J. Bono, J. V. Cullimore et al.: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 19824 (2011).
- 11) Y. Kouzai, S. Mochizuki, K. Nakajima, Y. Desaki, M. Hayafune, H. Miyazaki, N. Yokotani, K. Ozawa, E. Minami, H. Kaku et al.: Mol. Plant Microbe Interact., 27, 975 (2014).
- 12) K. Miyata, T. Kozaki, Y. Kouzai, K. Ozawa, K. Ishii, E. Asamizu, Y. Okabe, Y. Umehara, A. Miyamoto, Y. Kobae et al.: Plant Cell Physiol., 55, 1864 (2014).
-
-
Page. 729 - 730
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
糖鎖修飾はタンパク質の機能発現にしばしば重要な役割を果たしている.植物には特有のO-結合型糖鎖が見いだされているが,その修飾の第一段階を担う糖転移酵素群がこの数年で相次いで同定され,注目を集めている.
- 1) D. T. Lamport, M. J. Kieliszewski, Y. Chen & M. C. Cannon: Plant Physiol., 156, 11 (2011).
- 2) Y. Matsubayashi: Annu. Rev. Plant Biol., 65, 385 (2014).
- 3) M. Ellis, J. Egelund, C. J. Schultz & A. Bacic: Plant Physiol., 153, 403 (2010).
- 4) M. Ogawa-Ohnishi, W. Matsushita & Y. Matsubayashi: Nat. Chem. Biol., 9, 726 (2013).
- 5) S. Okamoto, H. Shinohara, T. Mori, Y. Matsubayashi & M. Kawaguchi: Nat. Commun., 4, 2191 (2013).
- 6) F. Saito, A. Suyama, T. Oka, O. T. Yoko, K. Matsuoka, Y. Jigami & Y. I. Shimma: J. Biol. Chem., 289, 20405 (2014).
- 7) D. Basu, Y. Liang, X. Liu, K. Himmeldirk, A. Faik, M. Kieliszewski, M. Held & A. M. Showalter: J. Biol. Chem., 288, 10132 (2013).
- 8) M. Ogawa-Ohnishi & Y. Matsubayashi: Plant J., 81, 736 (2015).
- 9) R. Leonard, N. Wopfner, M. Pabst, J. Stadlmann, B. O. Petersen, J. O. Duus, M. Himly, C. Radauer, G. Gadermaier, E. Razzazi-Fazeli et al.: J. Biol. Chem., 285, 27192 (2010).
- 10) L. Brecker, D. Wicklein, H. Moll, E. C. Fuchs, W. M. Becker & A. Petersen: Carbohydr. Res., 340, 657 (2005).
- 11) N. Gupta, B. M. Martin, D. D. Metcalfe & P. V. Rao: J. Allergy Clin. Immunol., 98, 903 (1996).
-
-
Page. 731 - 733
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
ショウジョウバエ11種および哺乳類16種において,ゲノム内の遺伝子重複率が高い種ほど,生息地内の多様性が高いという関係が見られた.ゲノム内の遺伝子重複は,多様な環境への適応力に寄与して いることが示唆される.
- 1) S. E. Williams, L. P. Shoo, J. L. Isaac, A. A. Hoffman & G. Langham: PLoS Biol., 6, e325 (2008).
- 2) M. Pigliucci: Nat. Rev. Genet., 9, 75 (2008).
- 3) D. J. Futuyma: Evolution, 64, 1865 (2010).
- 4) T. Makino & M. Kawata: Mol. Biol. Evol., 29, 3169 (2012).
- 5) S. C. Tamate, M. Kawata & T. Makino: Mol. Biol. Evol., 31, 1779 (2014).
- 6) Y. Van de Peer, S. Maere & A. Meyer: Nat. Rev. Genet., 10, 725 (2009).
- 7) M. Satake, M. Kawata, A. McLysaght & T. Makino: DNA Res., 19, 305 (2012).
- 8) T. Makino, A. McLysaght & M. Kawata: Nat. Commun., 4, 2283 (2013).
- 9) A. McLysaght, T. Makino, H. Grayton, M. Tropeano, K. Mitchell, E. Vassos & D. A. Collier: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, 361 (2014).
- 10) E. M. Tsuda & M. Kawata: PLOS Comput. Biol., 6, e1000873 (2010).
- 11) F. A. Kondrashov: Proc. Biol. Sci., 279, 5048 (2012).
- 12) D. Brawand, C. E. Wagner, Y. I. Li, M. Malinsky, I. Keller, S. Fan, O. Simakov, A. Y. Ng, Z. W. Lim, E. Bezault et al.: Nature, 513, 375 (2014).
-
-
Page. 734 - 736
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
植物ケミカルバイオロジー研究によって,ブラシノステロイド(BR)の抑制的な情報伝達因子BSS1を同定し,BSS1タンパク質がBR欠損状況で「集合」して複合体となることによって草丈伸長が抑制され,BR添加状況で複合体が「拡散」してタンパク質単体となることによって草丈伸長が促進される,という新しい植物草丈制御機構を明らかとした.
- 1) J. Li & J. Chory: Cell, 90, 929 (1997).
- 2) T. Asami & S. Yoshida: Trends Plant Sci., 9, 348 (1999).
- 3) Z. Wang, T. Nakano, J. Gendron, J. He, M. Chen, D. Vafeados, Y. Yang, S. Fujioka, S. Yoshida, T. Asami et al.: Dev. Cell, 2, 505 (2002).
- 4) J. X. He, J. M. Gendron, Y. Sun, S. S. Gampala, N. Gendron, C. Q. Sun & Z. Y. Wang: Science, 307, 1634 (2005).
- 5) Y. Sun, X. Y. Fan, D. M. Cao, W. Tang, K. He, J. Y. Zhu, J. X. He, M. Y. Bai, S. Zhu, E. Oh et al.: Dev. Cell, 19, 765 (2010).
- 6) S. Shimada, T. Komatsu, A. Yamagami, M. Nakazawa, M. Matsui, H. Kawaide, M. Natsume, H. Osada, T. Asami & T. Nakano: Plant Cell, 27, 375 (2015).
-
-
Page. 737 - 740
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
臓器・個体レベルの生命現象の理解には,生物としての基本要素である細胞同士のつながりを解析することが必要である.本稿では,組織透明化により可能となった網羅的1細胞解像度イメージングについて紹介する.
- 1) E. A. Susaki, K. Tainaka, D. Perrin, F. Kishino, T. Tawara, T. M. Watanabe, C. Yokoyama, H. Onoe, M. Eguchi, S. Yamaguchi, T. Abe, H. Kiyonari, Y. Shimizu, A. Miyawaki, H. Yokota, H. R. Ueda: Cell, 157, 726 (2014).
- 2) K. Tainaka, S. I. Kubota, T. Q. Suyama, E. A. Susaki, D. Perrin, M. Ukai-Tadenuma, H. Ukai & H. R. Ueda: Cell, 159, 911 (2014).
- 3) P. Osten & T. W. Margrie: Nat. Methods, 10, 515 (2013).
- 4) W. Spalteholz: “Über das Durchsichtigmachen von menschlichen und tierischen Präparaten,” S. Hirzel, Leipzig, 1914.
- 5) J. A. Dent, A. G. Polson & M. W. Klymkowsky: Development, 105, 61 (1989).
- 6) H. Hama, H. Kurokawa, H. Kawano, R. Ando, T. Shimogori, H. Noda, K. Fukami, A. Sakaue-Sawano & A. Miyawaki: Nat. Neurosci., 14, 1481 (2011).
- 7) M. T. Ke, S. Fujimoto & T. Imai: Nat. Neurosci., 16, 1154 (2013).
-
-
Page. 741 - 743
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
ある種の組換えタンパク質は,発現誘導に伴い細胞毒性を発揮し,難生産性となる.この難生産性を回避し,解析が可能な程度のタンパク質収量を得る簡単な方法(高密度菌体懸濁液を用いた難生産性タンパク質の生産法)を紹介する.
- 1) PEGS (the Essential Protein Engineering Summit):
- 2) タカラバイオ社シャペロンプラスミドセット
- 3) タカラバイオ社pColdベクターシリーズ
- 4) メルクミリポア社Rosetta2 competent cells:
- 5) K. Kimata, M. Yamaguchi, Y. Saito, H. Hata, K. Miyake, T. Yamane, Y. Nakagawa, A. Yano, K. Ito & Y. Kawarasaki: J. Biosci. Bioeng., 113, 154 (2012).
- 6) T. Kurose, Y. Saito, K. Kimata, Y. Nakagawa, A. Yano, K. Ito & Y. Kawarasaki: J. Biosci. Bioeng., 117, 659 (2014).
- 7) K. S. Wong, M. K. Cheung, C. H. Au & H. S. Kuwan: PLoS ONE, 8, e66426 (2013).
-
解説
-
Page. 744 - 750
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
「産業のビタミン」とも呼ばれる希土類元素(レアアース)は,さまざまなエレクトロニクス製品などの性能向上に必要不可欠な金属であることから,私たちの生活とかかわりが深い重要金属元素に数えられる.しかし,これまでレアアースが自然界において生態系や生物の生命活動にどのように関与するか,その生物学的意義はほとんど研究されていない.このようななか,近年,メタノールを唯一の炭素源として生育できるMethylobacterium属細菌がレアアースを要求する新規なメタノール代謝系をもつことが見いだされ,そのメタノール代謝の鍵酵素がレアアースを補因子とする新規なメタノール脱水素酵素(MDH)であることが明らかとなった.またレアアースを要求するMethylobacterium属細菌が自然界に普遍的に生息すること,さらにはMethylobacterium属細菌のみならず,根粒菌やメタン酸化細菌などからもレアアース依存的MDHの存在が報告されていることなど,レアアースを要求するC1代謝系は単なる一部のメチロトローフ細菌群に限った性質ではなく,広く自然界に分布する一般的かつ基盤的代謝系である可能性が示されている.本解説では,この新規なレアアース依存的なメタノール代謝系についてM. extorquens AM1株を中心に解説し,鍵酵素レアアース依存型MDHの機能と新規なメタノール代謝系の生物学的意義について説明する.
- 1) 日本化学会編:化学便覧 基礎編,改訂4版,2002, p. 51.
- 2) G. Tyler: Plant Soil, 267, 191 (2004).
- 3) G. Pagano, M. Guida, F. Tommasi & R. Oral: Ecotoxicol. Environ. Saf., 115C, 40 (2015).
- 4) D. Liu, X. Wang, X. Zhang & Z. Gao: Plant Soil Environ., 59, 196 (2013).
- 5) Z. Hu, H. Richter, G. Sparovek & E. Schnug: J. Plant Nutr., 27, 183 (2004).
- 6) 日比慶久,奥田雅代,佐久間隆介,岩間智徳,河合啓一:環境技術,40, 108 (2011).
- 7) A. Hiraishi, K. Furuhata, A. Matsumoto, K. A. Koike, M. Fukuyama & K. Tabuchi: Appl. Environ. Microbiol., 61, 2099 (1995).
- 8) D. Abanda-Nkpwatt, M. Musch, J. Tschiersch, M. Boettner & W. Schwab: J. Exp. Bot., 57, 4025 (2006).
- 9) M. Madhaiyan, B. V. Suresh Reddy, R. Anandham, M. Senthilkumar, S. Poonguzhali, S. P. Sundaram & T. Sa: Curr. Microbiol., 53, 270 (2006).
- 10) M. Senthilkumar, M. Madhaiyan, S. Sundaram & S. Kannaiyan: Microbiol. Res., 164, 92 (2009).
- 11) J. A. Vorholt: Nat. Rev. Microbiol., 10, 828 (2012).
- 12) T. Nakagawa, R. Mitsui, A. Tani, K. Sasa, S. Tashiro, T. Iwama, T. Hayakawa & K. Kawai: PLoS ONE, 7, e50480 (2012).
- 13) Y. Hibi, K. Asai, H. Arafuka, M. Hamajima, T. Iwama & K. Kawai: J. Biosci. Bioeng., 111, 547 (2011).
- 14) D. Y. Nunn, D. Day & C. Anthony: Biochem. J., 260, 857 (1989).
- 15) S. Schmidt, P. Christen, P. Kiefer & J. A. Vorholt: Microbiology, 156, 2575 (2010).
- 16) L. Chistoserdova & M. E. Lidstrom: Microbiology, 143, 1729 (1997).
- 17) N. Delmotte, C. Knief, S. Chaffron, G. Innerebner, B. Roschitzki, R. Schlapbach, C. von Mering & J. A. Vorholt: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 16428 (2009).
- 18) S. M. Sowell, P. E. Abraham, M. Shah, N. C. Verberkmoes, D. P. Smith, D. F. Barofsky & S. J. Giovannoni: ISME J., 5, 856 (2011).
- 19) E. Skovran, A. D. Palmer, A. M. Rountree, N. M. Good & M. E. Lidstrom: J. Bacteriol., 193, 6032 (2011).
- 20) G. Bosch, T. Wang, E. Latypova, M. G. Kalyuzhnaya, M. Hackett & L. Chistoserdova: Microbiology, 155, 1103 (2009).
- 21) A. Lapidus, A. Clum, K. Labutti, M. G. Kaluzhnaya, S. Lim, D. A. Beck, T. Glavina Del Rio, M. Nolan, K. Mavromatis, M. Huntemann et al.: J. Bacteriol., 193, 375 (2011).
- 22) T. Kaneko, Y. Nakamura, S. Sato, K. Minamisawa, T. Uchiumi, S. Sasamoto, A. Watanabe, K. Idesawa, M. Iriguchi, K. Kawashima et al.: DNA Res., 9, 189 (2002).
- 23) N. Sudtachat, N. Ito, M. Itakura, S. Masuda, S. Eda, H. Mitsui, Y. Kawaharada & K. Minamisawa: Appl. Environ. Microbiol., 75, 5012 (2009).
- 24) A. Pol, K. Heijmans, H. R. Harhangi, D. Tedesco, M. S. Jetten & H. J. Op den Camp: Nature, 450, 874 (2007).
- 25) A. F. Khadem, A. S. Wieczorek, A. Pol, S. Vuilleumier, H. R. Harhangi, P. F. Dunfield, M. G. Kalyuzhnaya, J. C. Murrell, K. J. Francoijs, H. G. Stunnenberg et al.: J. Bacteriol., 194, 3729 (2012).
- 26) C. Mackenzie, M. Choudhary, F. W. Larimer, P. F. Predki, S. Stilwagen, J. P. Armitage, R. D. Barber, T. J. Donohue, J. P. Hosler, J. E. Newman et al.: Photosynth. Res., 70, 19 (2001).
- 27) J. T. Keltjens, A. Pol, J. Reimann & H. J. M. Op den Camp: Appl. Microbiol. Biotechnol., 98, 6163 (2014).
- 28) N. A. Fitriyanto, M. Fushimi, M. Matsunaga, A. Pertiwiningrum, T. Iwama & K. Kawai: J. Biosci. Bioeng., 111, 613 (2011).
- 29) A. Pol, T. R. Barends, A. Dietl, A. F. Khade, J. Eygensteyn, M. S. Jetten & H. J. Op den Camp: Environ. Microbiol., 16, 255 (2014).
- 30) J. A. Bogart, A. J. Lewis & E. J. Schelter: Chemistry, 21, 1743 (2015).
- 31) M. Nemecek-Marshall, R. C. MacDonald, J. J. Franzen, C. L. Wojciechowski & R. Fall: Plant Physiol., 108, 1359 (1995).
- 32) G. Tyler & T. Olsson: Biol. Trace Elem. Res., 106, 177 (2005).
- 33) X. Guo, Q. Zhou, T. Lu, M. Fang & X. Huang: Ann. Bot. (Lond.), 100, 1459 (2007).
- 34) N. A. Fitriyanto, M. Nakamura, S. Muto, K. Kato, T. Yabe, T. Iwama, K. Kawai & A. Pertiwiningrum: J. Biosci. Bioeng., 111, 146 (2011).
- 35) K. Kawai, G. Wang, S. Okamoto & K. Ochi: FEMS Microbiol. Lett., 274, 311 (2007).
- 36) K. Ochi, Y. Tanaka & S. Tojo: J. Ind. Microbiol. Biotechnol., 41, 403 (2014).
-
-
Page. 751 - 755
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
この世で最初の細胞が生まれたとき,そこには遺伝情報を司る核酸と,それを包み込む膜が存在したという.そうであれば,膜の損傷を修復する細胞創傷治癒機構は生命誕生の瞬間から必要とされただろう.細胞創傷治癒は進化的に保存された機構だが,その全貌を俯瞰するには至っていない.出芽酵母を用いて細胞創傷治癒機構に関与する遺伝子の網羅的同定を試みた結果,驚いたことに,細胞創傷治癒と分裂老化に関与する生物学的プロセスの多くは共通であり,細胞創傷治癒が分裂老化を導くことが示唆された.既知の細胞老化の原因であるSirtuin,テロメア,Tor,ミトコンドリア,プロテアソームなどの欠損に加え,細胞損傷治癒も細胞老化を促進する新たなメカニズムであると考えられる.
- 1) R. Bashir, S. Britton, T. Strachan, S. Keers, E. Vafiadaki, M. Lako, I. Richard, S. Marchand, N. Bourg, Z. Argov et al.: Nat. Genet., 20, 37 (1998).
- 2) K. J. Sonnemann & W. M. Bement: Annu. Rev. Cell Dev. Biol., 27, 237 (2011).
- 3) N. W. Andrews, P. E. Almeida & M. Corrotte: Trends Cell Biol., 24, 734 (2014).
- 4) A. J. Jimenez, P. Maiuri, J. Lafaurie-Janvore, S. Divoux, M. Piel & F. Perez: Science, 343, 1247136 (2014).
- 5) K. Kono, Y. Saeki, S. Yoshida, K. Tanaka & D. Pellman: Cell, 150, 151 (2012).
- 6) K. Kono: unpublished results.
- 7) V. D. Longo, G. S. Shadel, M. Kaeberlein & B. Kennedy: Cell Metab., 16, 18 (2012).
- 8) Saccharomyces GENOME DATABASE:
- 9) D. A. Sinclair: Methods Mol. Biol., 1048, 49 (2013).
-
-
Page. 756 - 762
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
細菌は環境変化に応じて細胞間でコミュニケーションを行う.この結果,病原性の獲得やバイオフィルムの形成といった問題が生じる.細菌細胞間のコミュニケーションに必要なシグナル分子としてはN-アシル-L-ホモセリンラクトンなどが有名であるが,2004年以降新たなシグナル物質として,ポリアミンが注目を集めている.これまでに多くの細菌において,運動性細胞への分化,バイオフィルムの形成および分解,病原性の獲得がポリアミンによって仲介される細胞間コミュニケーションによって引き起こされることが報告されている.本稿では,近年の研究の進展をさまざまな細菌におけるポリアミン代謝系・輸送系・センサーについての遺伝学的・生化学的知見とともに概説する.
- 1) C. W. Tabor & H. Tabor: Microbiol. Rev., 49, 81 (1985).
- 2) A. E. Pegg: Biochem. J., 234, 249 (1986).
- 3) J. Lee, V. Sperandio, D. E. Frantz, J. Longgood, A. Camilli, M. A. Phillips & A. J. Michael: J. Biol. Chem., 284, 9899 (2009).
- 4) Y. Terui, M. Ohnuma, K. Hiraga, E. Kawashima & T. Oshima: Biochem. J., 388, 427 (2005).
- 5) K. Igarashi & K. Kashiwagi: Biochem. Biophys. Res. Commun., 271, 559 (2000).
- 6) K. Igarashi & K. Kashiwagi: J. Biochem., 139, 11 (2006).
- 7) M. H. Park, K. Nishimura, C. F. Zanelli & S. R. Valentini: Amino Acids, 38, 491 (2010).
- 8) Y. Nakada, Y. Jiang, T. Nishijyo, Y. Itoh & C. D. Lu: J. Bacteriol., 183, 6517 (2001).
- 9) J. L. Llacer, L. M. Polo, S. Tavarez, B. Alarcon, R. Hilario & V. Rubio: J. Bacteriol., 189, 1254 (2007).
- 10) M. Ohnuma, Y. Terui, M. Tamakoshi, H. Mitome, M. Niitsu, K. Samejima, E. Kawashima & T. Oshima: J. Biol. Chem., 280, 30073 (2005).
- 11) R. Pistocchi, K. Kashiwagi, S. Miyamoto, E. Nukui, Y. Sadakata, H. Kobayashi & K. Igarashi: J. Biol. Chem., 268, 146 (1993).
- 12) T. Furuchi, K. Kashiwagi, H. Kobayashi & K. Igarashi: J. Biol. Chem., 266, 20928 (1991).
- 13) S. Kurihara, Y. Tsuboi, S. Oda, H. G. Kim, H. Kumagai & H. Suzuki: J. Bacteriol., 191, 2776 (2009).
- 14) S. Kurihara, H. Suzuki, M. Oshida & Y. Benno: J. Biol. Chem., 286, 10185 (2011).
- 15) K. Kashiwagi, S. Miyamoto, F. Suzuki, H. Kobayashi & K. Igarashi: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 4529 (1992).
- 16) A. J. Driessen, E. J. Smid & W. N. Konings: J. Bacteriol., 170, 4522 (1988).
- 17) G. Sturgill & P. N. Rather: Mol. Microbiol., 51, 437 (2004).
- 18) P. N. Rather: Environ. Microbiol., 7, 1065 (2005).
- 19) L. Hobley, C. Harkins, C. E. MacPhee & N. R. Stanley-Wall: FEMS Microbiol. Rev., (2015).
- 20) J. Njoroge & V. Sperandio: EMBO Mol. Med., 1, 201 (2009).
- 21) C. N. Patel, B. W. Wortham, J. L. Lines, J. D. Fetherston, R. D. Perry & M. A. Oliveira: J. Bacteriol., 188, 2355 (2006).
- 22) M. Burrell, C. C. Hanfrey, E. J. Murray, N. R. Stanley-Wall & A. J. Michael: J. Biol. Chem., 285, 39224 (2010).
- 23) A. Sakamoto, Y. Terui, T. Yamamoto, T. Kasahara, M. Nakamura, H. Tomitori, K. Yamamoto, A. Ishihama, A. J. Michael, K. Igarashi et al.: Int. J. Biochem. Cell Biol., 44, 1877 (2012).
- 24) S. Kurihara, H. Suzuki, Y. Tsuboi & Y. Benno: FEMS Microbiol. Lett., 294, 97 (2009).
- 25) S. Kurihara, Y. Sakai, H. Suzuki, A. Muth, O. Phanstiel 4th & P. N. Rather: J. Biol. Chem., 288, 15668 (2013).
- 26) S. R. Cockerell, A. C. Rutkovsky, J. P. Zayner, R. E. Cooper, L. R. Porter, S. S. Pendergraft, Z. M. Parker, M. W. McGinnis & E. Karatan: Microbiology, 160, 832 (2014).
- 27) E. Karatan, T. R. Duncan & P. I. Watnick: J. Bacteriol., 187, 7434 (2005).
- 28) M. W. McGinnis, Z. M. Parker, N. E. Walter, A. C. Rutkovsky, C. Cartaya-Marin & E. Karatan: FEMS Microbiol. Lett., 299, 166 (2009).
- 29) L. Steindler & V. Venturi: FEMS Microbiol. Lett., 266, 1 (2007).
- 30) M. Boyer & F. Wisniewski-Dye: FEMS Microbiol. Ecol., 70, 1 (2009).
- 31) Y. Terui, S. D. Saroj, A. Sakamoto, T. Yoshida, K. Higashi, S. Kurihara, H. Suzuki, T. Toida, K. Kashiwagi & K. Igarashi: Amino Acids, 46, 661 (2014).
- 32) P. Shah & E. Swiatlo: Infect. Immun., 74, 5888 (2006).
- 33) I. Kolodkin-Gal, S. Cao, L. Chai, T. Bottcher, R. Kolter, J. Clardy & R. Losick: Cell, 149, 684 (2012).
- 34) L. Hobley, S. H. Kim, Y. Maezato, S. Wyllie, A. H. Fairlamb, N. R. Stanley-Wall & A. J. Michael: Cell, 156, 844 (2014).
- 35) M. Goytia, V. L. Dhulipala & W. M. Shafer: FEMS Microbiol. Lett., 343, 64 (2013).
-
-
Page. 763 - 773
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
地球温暖化やその影響が顕在化し,CO2排出抑制につながる新たなエネルギー削減技術の開発が求められている.発酵産業においても同様で,耐熱性微生物を用いることによって省エネ型の高温発酵が可能になり,これが次世代型の発酵技術として期待される.その実現のため,安定な高温発酵系の構築に向けた基盤的情報として耐熱性発酵微生物のもつ耐熱性分子機構の把握は不可欠となる.
- 1) 松下一信,赤田倫治,山田 守:化学と生物,46, 472 (2008).
- 2) 村田正之,高坂智之,サビトリー・リムトン,山田 守:ケミカルエンジニヤリング,66, 1(2015).
- 3) M. Murata, H. Fujimoto, K. Nishimura, K. Charoensuk, H. Nagamitsu, S. Raina, T. Kosaka, T. Oshima, N. Ogasawara & M. Yamada: PLoS ONE, 6, e20063 (2011).
- 4) T. Baba, T. Ara, M. Hasegawa, Y. Takai, Y. Okumura, M. Baba, K. A. Datsenko, M. Tomita, B. L. Wanner & H. Mori: Mol. Syst. Biol., 2, 1 (2006).
- 5) N. Kusukawa, T. Yura, C. Ueguchi & K. Ito: EMBO J., 8, 3517 (1989).
- 6) A. Saeki, G. Theeragool, K. Matsushita, H. Toyama, N. Lotong & O. Adachi: Biosci. Biotechnol. Biochem., 61, 138 (1997).
- 7) S. Moonmangmee, H. Toyama, O. Adachi, G. Theeragool, N. Lotong & K. Matsushita: Biosci. Biotechnol. Biochem., 65, 777 (2002).
- 8) A. Deeraksa, S. Moonmangmee, H. Toyama, M. Yamada, O. Adachi & K. Matsushita: Microbiology, 151, 4111 (2005).
- 9) W. Soemphol, A. Deeraksa, M. Matsutani, T. Yakushi, H. Toyama, O. Adachi, M. Yamada & K. Matsushita: Biosci. Biotechnol. Biochem., 75, 1921 (2011).
- 10) W. Soemphol, M. Tatsuno, T. Okada, M. Matsutani, N. Kataoka, T. Yakushi & K. Matsushita: J. Biotechnol., 211, 46 (2015).
- 11) Y. Azuma, A. Hosoyama, M. Matsutani, N. Furuya, H. Horikawa, T. Harada, H. Hirakawa, S. Kuhara, K. Matsushita, N. Fujita et al.: Nucleic Acids Res., 37, 5768 (2009).
- 12) P. S. Panesar, S. S. Marwaha & J. F. Kennedy: J. Chem. Technol. Biotechnol., 81, 623 (2006).
- 13) M. X. He, B. Wu, H. Qin, Z. Y. Ruan, F. R. Tan, J. L. Wang, Z. X. Shui, L. C. Dai, Q. L. Zhu, K. Pan et al.: Biotechnol. Biofuels, 7, 101 (2014).
- 14) X. Zhang, T. Wang, W. Zhou, X. Jia & H. Wang: Microb. Cell Fact., 12, 41 (2013).
- 15) T. Hayashi, T. Kato & K. Furukawa: Appl. Environ. Microbiol., 78, 5622 (2012).
- 16) K. Charoensuk, A. Irie, N. Lertwattanasakul, K. Sootsuwan, P. Thanonkeo & M. Yamada: J. Mol. Microbiol. Biotechnol., 20, 70 (2011).
- 17) P. Thanonkeo, P. Laopaiboon, K. Sootsuwan & M. Yamada: Biotechnology, 6, 112 (2007).
- 18) K. O'Connor, S. A. Fletcher & L. N. Csonka: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 17522 (2009).
- 19) A. H. Tong, M. Evangelista, A. B. Parsons, H. Xu, G. D. Bader, N. Pagé, M. Robinson, S. Raghibizadeh, C. W. Hogue, H. Bussey et al.: Science, 294, 2364 (2001).
- 20) B. M. A. Abdel-Banat, H. Hoshida, A. Ano, S. Nonklang & R. Akada: Appl. Microbiol. Biotechnol., 85, 861 (2010).
- 21) N. Lertwattanasakul, T. Kosaka, A. Hosoyama, Y. Suzuki, N. Rodrussamee, M. Matsutani, M. Murata, N. Fujimoto, Suprayogi, K. Tsuchikane et al.: Biotechnol. Biofuels, 8, 47 (2015).
- 22) T. Yarimizu, S. Nonklang, J. Nakamura, S. Tokuda, T. Nakagawa, S. Lorreungsil, S. Sutthikhumpha, C. Pukahuta, T. Kitagawa, M. Nakamura et al.: Yeast, 30, 485 (2013).
- 23) 功刀 滋,斉藤正治:“大学への橋渡し 生化学”,化学同人,2007.
- 24) H. Hoshida, N. Murakami, A. Suzuki, R. Tamura, J. Asakawa, B. M. Abdel-Banat, S. Nonklang, M. Nakamura & R. Akada: Yeast, 31, 29 (2014).
- 25) B. W. Davies, M. A. Kohanski, L. A. Simmons, J. A. Winkler, J. J. Collins & G. C. Walker: Mol. Cell, 36, 845 (2009).
-
-
Page. 774 - 781
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
ムスクは,官能的で魅惑的な香りを有し,古代から人間社会で香料以上の役割を担ってきた.天然ムスクであるムスコンは現在希少であり,その代替となるべく多くの合成ムスク香料が開発されてきたが,なかには毒性を指摘されるものもあり,問題となっている.当研究室では,ムスコンの受容体をマウスやヒト,4種の霊長類で同定し,それらのさまざまなムスク香料に対する構造活性相関を調べた.ヒトのムスコン受容体であるOR5AN1の応答性は,私たちが実際にムスク香料を嗅いだときの感覚とよく一致しており,ヒトのムスクの匂い受容の鍵となる受容体であることがわかった.これらの結果は,より良い新規ムスク香料の開発に貢献すると期待される.
- 1) C. Fehr, J. Galindo, R. Haubrichs & R. Perret: Helv. Chim. Acta, 72, 1537 (1989).
- 2) 森 立之:“神農本草経”,有明書房,1980.
- 3) J. E. Amoore: Nature, 198, 271 (1963).
- 4) H. Walbaum: Prakt. Chem., 73, 488 (1906).
- 5) W. C. Agosta: Chem. Commun., (1992).
- 6) D. W. Tristram: “Pheromones and animal behaviour,” University of Oxford, 2003.
- 7) L. Ruzicka: Helv. Chim. Acta, 9, 715 (1926).
- 8) L. Ruzicka: Helv. Chim. Acta, 9, 1008 (1926).
- 9) 近藤恭司:“実験動物としての食虫目トガリネズミ科動物の生物学”,学会出版センター,1985.
- 10) 田中 茂:香料,257, 49 (2013).
- 11) T. Luckenbach & D. Epel: Environ. Health Perspect., 113, A803 (2005).
- 12) H. Nakata: Environ. Sci. Technol., 39, 3430 (2005).
- 13) H. Ippen: Int. Arch. Occup. Environ. Health, 66, 283 (1994).
- 14) H. P. Hutter, P. Wallner, H. Moshammer, W. Hartl, R. Sattelberger, G. Lorbeer & M. Kundi: Sci. Total Environ., 407, 4821 (2009).
- 15) K. Taylor, M. Weisskopf & J. Shine: Environ. Health, 13, 14 (2014).
- 16) L. Buck & R. Axel: Cell, 65, 175 (1991).
- 17) P. Mombaerts: Nat. Rev. Neurosci., 5, 263 (2004).
- 18) Y. Niimura, A. Matsui & K. Touhara: Genome Res., 9, 1485 (2014).
- 19) H. Saito, Q. Chi, H. Zhuang, H. Matsunami & J. D. Mainland: Sci. Signal., 2, ra9 (2009).
- 20) M. Shirasu, K. Yoshikawa, Y. Takai, A. Nakashima, H. Takeuchi, H. Sakano & K. Touhara: Neuron, 81, 165 (2014).
- 21) N. Sato-Akuhara, N. Horio, A. Kato-Namba, K. Yoshikawa, Y. Niimura, S. Ihara, M. Shirasu & K. Touhara (submitted).
- 22) P. Kraft & G. Fráter: Chirality, 13, 388 (2001).
- 23) A. Keller, H. Zhuang, Q. Chi, L. B. Vosshall & H. Matsunami: Nature, 449, 468 (2007).
- 24) I. Menashe, T. Abaffy, Y. Hasin, S. Goshen, V. Yahalom, C. W. Luetje & D. Lancet: PLoS Biol., 30, e284 (2007).
- 25) J. F. McRae, J. D. Mainland, S. R. Jaeger, K. A. Adipietro, H. Matsunami & R. D. Newcomb: Chem. Senses, 37, 585 (2012).
- 26) S. R. Jaeger, J. F. McRae, C. M. Bava, M. K. Beresford, D. Hunter, Y. Jia, S. L. Chheang, D. Jin, M. Peng, R. D. Newcomb et al.: Curr. Biol., 23, 1601 (2013).
- 27) D. Whissell-Buechy & J. E. Amoore: Nature, 242, 271 (1973).
- 28) C. J. Wysocki, D. R. Reed, D. Lancet, Y. Hasin, J. Louie, L. Oriolo & F. Duke: Abstract, 286, 116 (2009).
-
セミナー室
-
Page. 782 - 786
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
イネは,窒素飢餓環境では茎数や種子数を減らして完熟種子を稔らせる応答を示すが,その分子機構は明らかではなかった.この機構解明のため逆遺伝学と空間的・時間的遺伝子発現などの解析を行い,①NH4+の同化・再利用機構,②代謝バランス,③穂への物質転流モデリングを試みた.
- 1) 間藤 徹:“植物栄養学第2版”,間藤 徹,馬 建鋒,藤原 徹編,文永堂出版,2010, p. 67.
- 2) T. Yamaya & M. Kusano: J. Exp. Bot., 65, 5519 (2014).
- 3) K. Funayama, K. Kojima, M. Tabuchi-Kobayashi, Y. Sawa, Y. Nakayama, T. Hayakawa & T. Yamaya: Plant Cell Physiol., 54, 934 (2013).
- 4) T. Mae & K. Ohira: Plant Cell Physiol., 22, 1067 (1981).
- 5) H. Hayashi & M. Chino: Plant Cell Physiol., 31, 247 (1990).
- 6) M. Tabuchi, T. Abiko & T. Yamaya: J. Exp. Bot., 58, 2319 (2007).
- 7) M. Ohashi, K. Ishiyama, M. Kusano, A. Fukushima, S. Kojima, A. Hanada, K. Kanno, T. Hayakawa, Y. Seto, J. Kyozuka et al.: Plant J., 81, 347 (2015).
- 8) W. Tamura, Y. Hidaka, M. Tabuchi, S. Kojima, T. Hayakawa, T. Sato, M. Obara, M. Kojima, H. Sakakibara & T. Yamaya: Amino Acids, 39, 1003 (2010).
- 9) S. Wada, Y. Hayashida, M. Izumi, T. Kurusu, S. Hanamata, K. Kanno, S. Kojima, T. Yamaya, K. Kuchitsu, A. Makino et al.: Plant Physiol., (2015), in press.
- 10) M. Tabuchi, K. Sugiyama, K. Ishiyama, E. Inoue, T. Sato, H. Takahashi & T. Yamaya: Plant J., 42, 641 (2005).
- 11) M. Kusano, M. Tabuchi, A. Fukushima, K. Funayama, C. Diaz, M. Kobayashi, N. Hayashi, N. Y. Tsuchiya, H. Takahashi, A. Kamata et al.: Plant J., 66, 456 (2011).
- 12) W. Tamura, S. Kojima, A. Toyokawa, H. Watanabe, M. Tabuchi-Kobayashi, T. Hayakawa & T. Yamaya: Front. Plant Sci., 2, 57 (2011).
- 13) P. Lea, L. Sodek, M. A. J. Parry, P. R. Shewry & N. G. Halford: Ann. Appl. Biol., 150, 1 (2007).
- 14) M. Ohashi, K. Ishiyama, M. Kusano, A. Fukushima, S. Kojima, A. Hanada, K. Kanno, T. Hayakawa, Y. Seto & J. Kyozuka: Plant Cell Physiol., 56, 769 (2015).
- 15) T. Hayakawa, T. Nakamura, F. Hattori, T. Mae, K. Ojima & T. Yamaya: Planta, 193, 455 (1994).
- 16) M. Seki, F. G. Feugier, X.-J. Song, M. Ashikari, H. Nakamura, K. Ishiyama, T. Yamaya, M. Ikeda, H. Kitano & A. Satake: Plant Cell Physiol., 56, 605 (2015).
- 17) M. Obara, W. Tamura, T. Ebitani, M. Yano, T. Sato & T. Yamaya: Theor. Appl. Genet., 121, 535 (2010).
- 18) K. Ishiyama, E. Inoue, A. Watanabe-Takahashi, M. Obara, T. Yamaya & H. Takahashi: J. Biol. Chem., 279, 16598 (2004).
- 19) A. Martin, J. Lee, T. Kichey, D. Gerentes, M. Zivy, C. Tatout, F. Dubois, T. Balliau, B. Valot, M. Davanture et al.: Plant Cell, 18, 3252 (2006).
-
テクノロジーイノベーション
-
Page. 787 - 791
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
納豆菌の改良を通じ,特徴ある納豆の開発,納豆の基本品質の改善を行った.本稿では,実際に商品化につながった事例(低臭納豆,柔らかい納豆,ビタミンK2高含有納豆,品質劣化しにくい納豆)について紹介する.
- 1) フーズ・パイオニア:“納豆沿革史”,全国納豆共同組合連合,1975.
- 2) 竹村 浩:“納豆の科学”,建帛社,2008, p. 107.
- 3) 竹村 浩:“納豆の科学”,建帛社,2008, p. 256.
- 4) S. Kada, M. Yabusaki, T. Kaga, H. Ashida & K. Yoshida: Biosci. Biotechnol. Biochem., 72, 1869 (2008).
-
バイオサイエンススコープ
-
Page. 792 - 796
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
解糖系(Embden-Meyerhof Pathway)に名を残すマイヤーホッフは,酵母による発酵と筋肉の乳酸蓄積が共通経路をもつことを解明した.ノーベル賞を受賞したユダヤ人として,ナチスとヴィシー政権による出国制限を受けたが,ロッシュらの支援を得てピレネー山脈を越えてスペインに脱出,その後アメリカへ亡命した.この小論は,彼の国境越えの真相である.偶然,今年はヒトラーナチスからの開放70周年で,記念式典がヨーロッパ各地で行われている.
- 1) W. Meyerhof: “In the Shadow of Love, Stories From My Life,” Fithian Press, Canada, 2002.
- 2) D. Nachmansohn: “German-Jewish Pioneers in Science, 1900–1933,” Springer-Verlag, Berlin–Heidelberg–New York, 1979.
- 3) H. Krebs: “OTTO WARBURG,” Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft mbH, Stuttgart, 1979.
- 4) A. D. Beyerchen: “Scientists under Hitler,” Yale University Press, 1977.
- 5) 丸山工作:“生命現象を探る”,中央公論社,1972.
- 6) 丸山工作:“生化学の黄金時代”,岩波書店,1990.
- 7) 丸山工作:“生化学の夜明け”,中公新書,1993.
- 8) その他(関係者の書簡類多数).
-
-
Page. 797 - 801
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
CBDの締約国会議の議論において,「合成生物学」がどのような学問領域として捉えられているのか,どのような技術が「合成生物学」に含まれていると想定されているのかを整理するとともに,その議論に潜む,途上国の社会経済的な補償の問題をご紹介したい.
- 1) CBDホームページ:“New & Emerging Issues,”
- 2) 一般財団法人バイオインダストリー協会:経済産業省委託事業 平成26年度環境対応技術開発等(遺伝子組換え微生物等の産業活用促進基盤整備事業) 報告書 第II編 平成27年3月
- 3) SCHER (Scientific Committee on Health and Environmental Risks), SCENIHR (Scientific Committee on Emerging and Newly Identified Health Risks), and SCCS (Scientific Committee on Consumer Safety) のエキスパートリスト
- 4) 欧州委員会科学委員会:“Preliminary opinion on Synthetic Biology II Risk assessment methodologies and safety aspects,”
- 5) 欧州委員会科学委員会:“Opinion on Synthetic Biology I Definition,”
- 6) 日本では,「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律x{2014}通称「カルタヘナ法」」として施行
- 7) OECD: “Emerging Policy Issues in Synthetic Biology,” 2014.
- 8) Friends of the Earthによるハーゲンダッツ社への公開質問状,2013年8月27日付
- 9) 米国特許US7935515 B2(2011年5月3日公告)「新規の油を作る組換え微細藻類」
- 10) ETC group: Case Studies in the Impact of Synthetic Biology: Coconut oil, palm kernel oil and babassu
-
農芸化学@HighSchool
-
Page. 802 - 804
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
本研究は,日本農芸化学会2015年度(平成27年度)大会(開催地:岡山大学津島キャンパス)「ジュニア農芸化学会2015」において発表されたものである.アミガサハゴロモは,半翅目ハゴロモ科に属する昆虫で,本州,四国,九州の常緑照葉樹林に生息し,幼虫・成虫共に主にカシ類の葉や茎から吸汁して生活する.1~5齢幼虫は腹部先端からロウ物質を分泌し,このロウ物質は羽毛や花の雄しべに似た形になる(図1).発表者は小学2年生のときにその不思議な姿を見て,ロウ物質の形が作られる仕組みや役割に興味をもった.図鑑で調べたが生態や形態に関する詳しい記述がなかったことから自分で調べようと考え,長年にわたって研究を続けてきたという.今回発表されたのはその最近の成果の一端である.
-
書評
-
Page. 805 - 805
(published date : 2015年10月20日)
概要原稿
リファレンス
本書は,アメリカで広く使われている免疫学の教科書How the immune system worksの翻訳である.専門的な術語の使用は極力避けられており,講義形式で非常にわかりやすい.また,全体像を理解させることに主眼を置き,例外はなるべく記述しないという方針が貫かれている.一般に学者は例外を好む.教科書の定型的な記述を疑い,隙あらばそれを覆そうと考えている.だからわかりやすく言い切る形で記述しなければならない教科書を書くのが難しいわけであるが,本書はこの点を見事にクリアしている.
-